【技术实现步骤摘要】
基于秋石斛转录组序列开发的EST
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SSR标记及应用
[0001]本专利技术属于分子标记领域,具体涉及秋石斛转录组序列开发的EST
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SSR标记、引物及其应用。
技术介绍
[0002]秋石斛(Dendrobiumhybrida)是指以原产于热带地区的常绿石斛为亲本,经过杂交选育出来的一大类石斛优良品种,是石斛兰中最具观赏价值的种群之一,因其花型花姿优美、色彩丰富艳丽、花期及瓶插期较长,深受人们喜爱,是观赏兰花中的重要切花和盆花。近年来深受消费者的喜爱,已成为兰花市场中新兴的、具发展潜力的兰花新种类,市场前景广阔。目前,有关秋石斛的研究主要集中在组织培养技术、栽培技术、花期调控等方面,对于秋石斛遗传多样性、遗传图谱构建、基因定位等方面的研究还很少。秋石斛中用于以上研究的分子标记仅为一些通用引物如RAPD,SRAP等,这大大限制了秋石斛分子育种的进程。
[0003]表达序列标签微卫星(EST
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SSR)是一种基于表达序列标签的简单序列重复设计的新型分子标记,具多态性高、共显性遗传、重复性好、开发成本低等优点,且其来自基因组的编码区,与功能基因紧密连锁,更容易获得基因表达的信息。随着EST数据库不断丰富和高通量测序技术发展,EST
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SSR在植物上被大量开发和应用,但有关EST
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SSR在秋石斛中的应用研究还未见报道。
[0004]因此,建立一种基于秋石斛花序转录组筛选EST
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SSR引物方法,筛选出 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.基于秋石斛转录组序列开发的EST
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SSR标记,其特征在于:微卫星标记编号为:Den2、Den7、Den12、Den17、Den18、Den19、Den24、Den27、Den38、Den46、Den47、Den51、Den57、Den60、Den63、Den72、Den75、Den82、Den94和Den95;其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.20所示。2.根据权利要求1所述的基于秋石斛转录组序列开发的EST
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SSR标记,其特征在于:包括20对引物组,分别为DenSSR2、DenSSR7、DenSSR12、DenSSR17、DenSSR18、DenSSR19、DenSSR24、DenSSR27、DenSSR38、DenSSR46、DenSSR47、DenSSR51、DenSSR57、DenSSR60、DenSSR63、DenSSR72、DenSSR75、DenSSR82、DenSSR94和DenSSR95,其引物序列分别为:DenSSR2 F:AGAGGAGAGGAGTTCGAAGAGACDenSSR2 R:TGTTCTCAACGGTTACTACTGCCDenSSR7 F:GTAACGCTGGTATTTGCTCTCAGDenSSR7 R:AGCTTGACGTATTTGAGCTTCACDenSSR12F:GTACCCGCCTTATAATGGTCTCTDenSSR12R:GAGTGAGGATGCTAAGTACCCAADenSSR17 F:CGGCCAGTGGAACAGTTTATATTDenSSR17R:CACTTGCTGTTGATTTCCATACADenSSR18 F:GTTGATTACTCGCCAAATAGCTCDenSSR18R:GCTTTGTCTTCGTAGCTGTTCATDenSSR19 F:TTTTTATTTTGGGGAATGACAACDenSSR19R:AGTTAGCTTTCTATTGCGCGAGDenSSR24 F:TTGATAATAGACCTAGCCAAGCADenSSR24R:ATTAATCAAAAGTCGTAGCACCGDenSSR27F:AGGGAATAGAGACGTGAGCTTCTDenSSR...
【专利技术属性】
技术研发人员:易双双,陆顺教,黄明忠,廖易,李崇晖,罗小燕,张志群,
申请(专利权)人:中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,
类型:发明
国别省市:
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