【技术实现步骤摘要】
用于肝癌预后的mRNA基因组、mRNA基因对组、预测模型及应用
[0001]本专利技术涉及生物医药
,尤其涉及用于肝癌预后的mRNA基因组、mRNA基因对组、预测模型及应用。
技术介绍
[0002]肝癌即肝脏恶性肿瘤,可分为原发性和继发性两大类。原发性肝脏恶性肿瘤起源于肝脏的上皮或间叶组织,前者称为原发性肝癌,是我国高发的,危害极大的恶性肿瘤;后者称为肉瘤,与原发性肝癌相比较较为少见。原发性肝癌的病因及确切分子机制尚不完全清楚,目前认为其发病是多因素、多步骤的复杂过程,受环境和饮食双重因素影响。流行病学及实验研究资料表明,乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV)感染、黄曲霉素、饮水污染、酒精、肝硬化、性激素、亚硝胺类物质、微量元素等都与肝癌发病相关。继发性肝癌(转移性肝癌)可通过不同途径,如随血液、淋巴液转移或直接侵润肝脏而形成疾病。
[0003]在肝癌患者中,肿瘤单个位置的检测结果往往不能完全反映患者肿瘤的全部特性,这种异质性对肝癌的预后和治疗带来了很大的困难。中国专利CN 110580956 A公开了 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种用于肝癌预后的mRNA基因组,包括以下mRNA基因:MED8、CIZ1、CBX1、RCC1、RACGAP1、IFT52、PPIE、ASF1B、CDC6、POLA2、GLTP、CDK4、NECAP2、CENPH、SLC41A3、CCNF、TRAIP、RPA2、RUVBL1、EZH2、EFTUD2、PSMB2、STMN1、CHTF18、MUTYH、PPM1G、RAD51、KIF23、XPO6、SAMD4B、BUB1、TAF12、MSH2、TMEM50A、KIAA1522、DTYMK、FANCG、TCF19、MCM2、AGBL5、CDT1、CDCA8、GINS1、MELK、PPP1CC、NCBP2、FUBP1、PSRC1、LCMT1、TRIP13、SHCBP1、G6PD、C1orf174、RERE、METTL9、NUP37、PEF1、RBMX、RALY、UPF3B、TPD52L2、SCMH1、KHDRBS1、CEP55、AGTRAP、RNF19B、RBBP4、MIIP、MRTO4、ORC1、PHF19、CDK16、RNF34、MDC1和EHMT2。2.权利要求1所述的mRNA基因组组成的mRNA基因对组,包括表1所示mRNA基因对:表1 mRNA基因对
3.一种基于权利要求2所述的mRNA基因对组用于肝癌预后和/或治疗效果的预测模型,所述预测模型的检测结果采用风险评分来表征;所述风险评分的计算公式为:
风险评分=∑第N1基因|第N2基因
×
加权系数;当第N1基因的表达量高于第N2基因,表达量的比较结果计为1;当第N1基因的表达量低于第N2基因,比较结果计为0。4.根据权利要求3所述的预测模型,其特征在于,所述第N1基因和第N2基因的表达量的比较结果以第N1基因|第N2基因表示;所述风险评分的计算公式为:风险评分=MED8|TMEM50A
×
0.0017178222110322+CIZ1|KIAA1522
×
(
‑
0.0857141755287526)+CBX1|DTYMK
×
(
‑
0.00446285219108617)+RCC1|DTYMK
×
(
‑
0.209551826185795)+RACGAP1|FANCG
×
0.159573941643644+RACGAP1|TCF19
×
0.333830008692591+IFT52|MCM2
×
(
‑
0.126255606333546)+PPIE|AGBL5
×
(
‑
0.0652850791847818)+ASF1B|CDT1
×
(
‑
0.165248911328347)+ASF1B|CDCA8
×
(
‑
0.462026853168634)+CDC6|GINS1
×
(
‑
0.106818192015718)+FANCG|MELK
×
(
‑
0.124387315884686)+POLA2|PSRC1
×
(
‑
0.0749854847045839)+GLTP|G6PD
×
(
‑
0.133694424004746)+CDK4|RALY
×
0.0168875845571728+CDK4|PPP1CC
×
0.226065714240363+NECAP2|NCBP2
×
(
‑
0.057983296330769)+NECAP2|FUBP1
×
(
‑
0.0982835138473346)+CENPH|PSRC1
×
(
‑
0.13197...
【专利技术属性】
技术研发人员:罗春英,刘发煇,梁家东,龙朴泽,侯婉云,
申请(专利权)人:右江民族医学院附属医院,
类型:发明
国别省市:
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