抗TALEN抗体及其用途制造技术

除其它方面外，本公开提供了用于检测样本中的TALEN和/或FokI核酸酶的抗体以及使用所述抗体的方法。述抗体的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】抗TALEN抗体及其用途
[0001]交叉引用
[0002]本申请要求于2019年6月13日提交的美国临时申请第62/861,214号的优先权权益，所述美国临时申请的内容以全文引用的方式特此并入。
[0003]序列表
[0004]本申请含有序列表，所述序列表已经以ASCII格式电子提交，并且以全文引用的方式特此并入。所述ASCII副本创建于2020年6月12日，被命名为AT
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021_02_SL_ST25.txt并且大小为26,590字节。


[0005]本公开涉及抗原结合分子，包含但不限于特异性结合基因编辑蛋白(例如，TALEN蛋白，包括FokI，也被称为Fok
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1或Fok1，催化结构域)和对所述蛋白进行编码的多核苷酸的抗体以及使用方法。

技术介绍

[0006]如转录激活子样效应物核酸酶锌指核酸酶(ZFN)以及RNA引导的FokI核酸酶(RFN)等基因组编辑工具是实现基因精确修正、插入或缺失的强有力工具。TALEN、ZFN和RFN可以与基因组中的靶向位点结合并且在所述靶向位点处进行切割。当提供修复模板后，通过非同源末端连接(NHEJ)的内源性细胞DNA修复机制或通过同源定向修复(HDR)，对所得经切割的DNA进行修复。TALEN采用与DNA切割结构域(例如，FokI)融合的TAL效应物DNA结合结构域。ZFN由与工程化Cys2His2锌指、DNA结合多肽连接的FokI等限制性核酸内切酶切割或催化结构域构成。RFN包含与Cas9的催化灭活形式融合的FokI核酸酶。由于哺乳类动物(如人、狗、牛、非人灵长类动物等)具有高效的基因组编辑能力，因此可以设想，TALEN、ZFN和RFN将高水平表达。由于存在持续核酸酶活性和脱靶效应的风险，以及潜在的免疫原性，本领域中需要可识别基因组编辑工具(例如，抗TALEN和/或抗FokI抗体)的抗体，所述基因组编辑工具能够结合核酸酶蛋白，以评估各种基因编辑疗法的安全性和功效。

技术实现思路

[0007]除其它方面外，本公开提供了用于在样品中检测FokI催化结构域和全长TALEN蛋白的抗体。如本文所描述的，包含在下文实例，本公开提供了特异性结合TALEN和FokI蛋白的抗TALEN抗体。在一些实施例中，本公开的抗TALEN抗体可以用于评估基因编辑疗法和过程。
[0008]一方面，本公开提供了一种抗TALEN抗体，所述抗TALEN抗体包括与SEQ ID NO:3至少85％相同的可变重链氨基酸序列和与SEQ ID NO:7至少85％相同的可变轻链氨基酸序列。在一个实施例中，所述抗TALEN抗体是人源化的。在不同实施例中，所述抗体选自以下组成的组：Fv、F(ab')2抗体、scFv、Fab、Fab'、dAb、人抗体、人源化抗体、嵌合抗体、单克隆抗体、多克隆抗体、重组抗体、IgE抗体、IgD抗体、IgM抗体、IgG1抗体、在铰链区具有至少一个
突变的IgG1抗体、IgG2抗体、在铰链区具有至少一个突变的IgG2抗体、IgG3抗体、在铰链区具有至少一个突变的IgG3抗体、IgG4抗体、在铰链区具有至少一个突变的IgG4抗体、包括至少一个非天然氨基酸的抗体以及其任何组合。
[0009]在具体实施例中，所述抗体包括选自由SEQ ID NO:3
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6组成的组的可变重链(HC)，并且在另外的实施例中，所述抗TALEN抗体包括选自由SEQ ID NO:12
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14组成的组的重链CDR1，和/或选自由SEQ ID NO:15
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20组成的组的重链CDR2，和/或包含SEQ ID NO:21的重链CDR3。在具体实施例中，抗TALEN抗体包括重链CDR1、重链CDR2和重链CDR3，每个CDR均包括表1c中示出的氨基酸序列。还提供了一种抗TALEN抗体，所述抗TALEN抗体包括与本文所提供的抗原结合分子的VH至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％、至少约99％或约100％相同的VH氨基酸序列。
[0010]在其它实施例中，抗TALEN抗体包括选自由SEQ ID NO:7
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11组成的组的轻链可变区(VL)序列。在具体实施例中，抗TALEN抗体包括包含SEQ ID NO:22的轻链CDR1、和/或选自由SEQ ID NO:23
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25组成的组的轻链CDR2和/或选自由SEQ ID NO:26
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28组成的组的轻链CDR3。进一步提供了一种抗TALEN抗体，其中所述轻链包括轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3，每个CDR均包括表1d中的氨基酸序列。还提供了一种抗TALEN抗体，所述抗TALEN抗体包括与本文所提供的抗原结合分子的VL至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％、至少约99％或约100％相同的VL氨基酸序列。
[0011]在另一个实施例中，本文提供了一种抗TALEN抗体，所述抗TALEN抗体包括：(a)包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:23的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列的VL CDR3，并且在另外的实施例中，抗TALEN抗体包括：(a)包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列的VH；以及(b)包含SEQ ID NO:7的氨基酸序列的VL。
[0012]在另一个实施例中，本文提供了一种抗TALEN抗体，所述抗TALEN抗体包括：(a)包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列的VL CDR3，并且在另外的实施例中，抗TALEN抗体包括：(a)包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列的VH；以及(b)包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列的VL。
[0013]在另外的实施例中，本文提供了一种抗TALEN抗体，所述抗TALEN抗体包括：(a)包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:25的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列的VL CDR3，并且在另外的实施例中，所本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种抗TALEN抗体，其包括与SEQ ID NO:3至少85％相同的可变重链氨基酸序列和与SEQ ID NO:7至少85％相同的可变轻链氨基酸序列。2.根据权利要求1所述的抗TALEN抗体，其中所述抗体是人源化的。3.根据权利要求1或2所述的抗TALEN抗体，其中抗原结合分子选自由以下组成的组：抗体、scFv、Fab、Fab'、Fv、F(ab')2、dAb、人抗体、人源化抗体、嵌合抗体、单克隆抗体、多克隆抗体、重组抗体、IgE抗体、IgD抗体、IgM抗体、IgG1抗体、在铰链区具有至少一个突变的IgG1抗体、IgG2抗体、在铰链区具有至少一个突变的IgG2抗体、IgG3抗体、在铰链区具有至少一个突变的IgG3抗体、IgG4抗体、在铰链区具有至少一个突变的IgG4抗体、包括至少一个非天然氨基酸的抗体以及其任何组合。4.根据权利要求1到3中任一项所述的抗TALEN抗体，其中所述抗体包括选自由SEQ ID NO:3
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6组成的组的可变重链(HC)。5.根据前述权利要求中任一项所述的抗TALEN抗体，其包括选自由SEQ ID NO:12
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14组成的组的重链CDR1。6.根据前述权利要求中任一项所述的抗TALEN抗体，其包括选自由SEQ ID NO:15
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20组成的组的重链CDR2。7.根据前述权利要求中任一项所述的抗TALEN抗体，其包括包含SEQ ID NO:21的重链CDR3。8.根据前述权利要求中任一项所述的抗TALEN抗体，其中所述重链包括重链CDR1、重链CDR2和重链CDR3，每个CDR均包括表1c中示出的氨基酸序列。9.一种抗TALEN抗体，其包括与根据权利要求4所述的抗原结合分子的VH至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％、至少约99％或约100％相同的VH氨基酸序列。10.根据权利要求1到9中任一项所述的抗TALEN抗体，其中经分离的抗体包括选自由SEQ ID NO:7
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11组成的组的轻链可变区(VL)序列。11.根据权利要求10所述的抗TALEN抗体，其包括包含SEQ ID NO:22的轻链CDR1。12.根据权利要求10所述的抗TALEN抗体，其包括选自由SEQ ID NO:23
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25组成的组的轻链CDR2。13.根据权利要求10所述的抗TALEN抗体，其包括选自由SEQ ID NO:26
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28组成的组的轻链CDR3。14.根据权利要求10所述的抗TALEN抗体，其中所述轻链包括轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3，每个CDR均包括表1d中的氨基酸序列。15.一种抗TALEN抗体，其包括与根据权利要求10所述的抗原结合分子的VL至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％、至少约99％或约100％相同的VL氨基酸序列。16.一种抗TALEN抗体，其包括：(a)包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列的VL CDR1；
(e)包含SEQ ID NO:23的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列的VL CDR3。17.根据权利要求16所述的抗TALEN抗体，其包括：(a)包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列的VH；以及(b)包含SEQ ID NO:7的氨基酸序列的VL。18.一种抗TALEN抗体，其包括：(a)包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列的VL CDR3。19.根据权利要求18所述的抗TALEN抗体，其包括：(a)包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列的VH；以及(b)包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列的VL。20.一种抗TALEN抗体，其包括：(a)包含SEQ ID NO:13的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:25的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列的VL CDR3。21.根据权利要求20所述的抗TALEN抗体，其包括：(a)包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列的VH；以及(b)包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列的VL。22.一种抗TALEN抗体，其包括：(a)包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列的VL CDR3。23.根据权利要求22所述的抗TALEN抗体，其包括：(a)包含SEQ ID NO:5的氨基酸序列的VH；以及(b)包含SEQ ID NO:10的氨基酸序列的VL。24.一种抗TALEN抗体，其包括：(a)包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:17的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列的VH CDR3；
(d...

【专利技术属性】
技术研发人员：T，
申请(专利权)人：艾洛基治疗公司，
类型：发明
国别省市：