本发明专利技术涉及生物分子标记技术领域，公开了与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记及其应用。该SNP分子标记，位于如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列的第151位，多态性为A/G，该分子标记与丝瓜瓜长性状显著相关：可用于鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的瓜长性状、鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的果实为长瓜还是短瓜、选育果实为长瓜的丝瓜、选育果实为短瓜的丝瓜和丝瓜育种。育果实为短瓜的丝瓜和丝瓜育种。
【技术实现步骤摘要】
与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记及其应用
[0001]本专利技术属于生物分子标记
，具体涉及与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记及其应用。
技术介绍
[0002]丝瓜是一种重要的多功能蔬菜。丝瓜果实富含维生素、氨基酸、微量元素和抗氧化物质，具有清热消暑、止血消炎的功效，是一种药食兼用的多功能蔬菜。近年来，随着人们对营养健康的重视，丝瓜的播种面积逐年增大，已成为重要的日常消费蔬菜。
[0003]丝瓜商品果果实长度是其重要的外观品质性状。由于消费习惯和用途的不同，各地对丝瓜长度的要求不一。针对不同地区的消费习惯，培育不同瓜长的丝瓜品种，可以显著增加农民效益。然而，复杂的环境因素及遗传变异，影响丝瓜不同瓜长品种的选育。然而，利用分子标记可以快速简单的在苗期进行辅助鉴定，节省了大量人力物力。
[0004]因此，深入挖掘、利用丝瓜瓜长相关分子标记，对于丝瓜产业的发展具有重要意义。
技术实现思路
[0005]为了克服现有技术所存在的不足，本专利技术的第一方面的目的，在于提供与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记。
[0006]本专利技术的第二个方面的目的，在于提供用于扩增第一方面的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记的引物组。
[0007]本专利技术的第三个方面的目的，在于提供一种用于鉴定或辅助鉴定丝瓜瓜长性状的试剂盒。
[0008]本专利技术的第四个方面的目的，在于提供第一方面的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记的应用。
[0009]本专利技术的第五方面的目的，在于提供第二方面的引物组的应用。
[0010]本专利技术的第六方面的目的，在于提供第三方面的试剂盒的应用。
[0011]本专利技术的第七方面的目的，在于提供一种鉴定或辅助鉴定丝瓜瓜长性状的方法。
[0012]本专利技术的第八方面的目的，在于提供一种鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的果实为长瓜还是短瓜的方法。
[0013]本专利技术的第九方面的目的，在于提供一种选育果实为长瓜的丝瓜的方法。
[0014]本专利技术的第十方面的目的，在于提供一种选育果实为短瓜的丝瓜的方法。
[0015]为了实现上述目的，本专利技术所采取的技术方案是：
[0016]本专利技术的第一个方面，提供一种与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记，位于如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列的第151位，多态性为A/G。
[0017]本专利技术的第二个方面，提供用于扩增本专利技术第一方面的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记的引物组。
[0018]优选地，所述引物组包括正向引物1、正向引物2和反向引物；所述正向引物1为GAGAACACATTACTTGAATATTAAGCAA(SEQ ID NO.5)；所述正向引物2为TGAGAACACATTACTTGAATATTAAGCAG(SEQ ID NO.6)；反向引物为TGTTGATGTATAGGTTAGGGTGGC(SEQ ID NO.4)。
[0019]本专利技术的第三个方面，提供一种用于鉴定或辅助鉴定丝瓜瓜长性状的试剂盒，包含本专利技术第二方面的引物组。
[0020]优选地，所述正向引物1和正向引物2的5
’
端分别带有序列标签A和序列标签B，所述序列标签A和序列标签B的核苷酸序列互不相同并且与丝瓜基因组序列不同源。
[0021]优选地，所述序列标签A为GAAGGTGACCAAGTTCATGCT(SEQ ID NO.7)。
[0022]优选地，所述序列标签B为GAAGGTCGGAGTCAACGGAT(SEQ ID NO.8)。
[0023]优选地，所述试剂盒还包含PCR预混液，所述PCR预混液含有荧光探针A、荧光探针B、淬灭探针A和淬灭探针B；
[0024]所述荧光探针A的核苷酸序列与序列标签A的核苷酸序列一致，其5
’
端连接荧光基团A；所述淬灭探针A的核苷酸序列与序列标签A的核苷酸序列反向互补，其3
’
端连接淬灭基团；
[0025]所述荧光探针B的核苷酸序列与序列标签B的核苷酸序列一致，其5
’
端连接荧光基团B；所述淬灭探针B的核苷酸序列与序列标签B的核苷酸序列反向互补，其3
’
端连接淬灭基团。
[0026]优选地，所述荧光基团A与荧光基团B互不相同。
[0027]优选地，所述荧光基团A、荧光基团B选自FAM和HEX；进一步优选地，所述荧光基团A为FAM，所述荧光基团B为HEX。
[0028]优选地，所述淬灭基团选自BQH。
[0029]优选地，所述PCR预混液还包含其他KASP扩增所需的试剂，比如聚合酶、dNTP和MgCl2等。
[0030]优选地，一种用于鉴定或辅助鉴定丝瓜瓜长性状的试剂盒，所述试剂盒包含：正向引物1、正向引物2、反向引物和PCR预混液；
[0031]所述正向引物1为GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGAGAACACATTACTTGAATATTAAGCAA(SEQ ID NO.2)；
[0032]所述正向引物2为GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGAGAACACATTACTTGAATATTAAGCAG(SEQ ID NO.3)；
[0033]所述反向引物为TGTTGATGTATAGGTTAGGGTGGC(SEQ ID NO.4)；
[0034]所述PCR预混液为2
×
PARMS master mix。
[0035]本专利技术的第四个方面，提供本专利技术第一方面的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记在(1)～(10)中任一种中的应用；
[0036](1)鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的瓜长性状；
[0037](2)制备鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的瓜长性状的产品；
[0038](3)鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的果实为长瓜还是短瓜；
[0039](4)制备鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的果实为长瓜还是短瓜的产品；
[0040](5)选育果实为长瓜的丝瓜；
[0041](6)制备选育果实为长瓜的丝瓜的产品；
[0042](7)选育果实为短瓜的丝瓜；
[0043](8)制备选育果实为短瓜的丝瓜的产品；
[0044](9)丝瓜育种；
[0045](10)制备丝瓜育种的产品。
[0046]本专利技术的第五方面，提供本专利技术第二方面的引物组在(1)～(10)中任一种中的应用；
[0047](1)鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的瓜长性状；
[0048](2)制备鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的瓜长性状的产品；
[0049](3)鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的果实为长瓜还是短瓜；
[0050](4)制备鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的果实为长瓜还是短瓜的产品；
[0051](5)选育果实为长瓜的丝瓜；
[0052](6)制备选育果实为长瓜的丝瓜的产品；
[0053](7)选育果实为短瓜的丝瓜；
[0054](8)制备选育果实为短瓜的丝本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记，位于如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列的第151位，多态性为A/G。2.用于扩增权利要求1所述的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记的引物组。3.根据权利要求2所述的引物组，其特征在于：所述引物组包括正向引物1、正向引物2和反向引物；所述正向引物1为GAGAACACATTACTTGAATATTAAGCAA(SEQ ID NO.5)；所述正向引物2为TGAGAACACATTACTTGAATATTAAGCAG(SEQ ID NO.6)；反向引物为TGTTGATGTATAGGTTAGGGTGGC(SEQ ID NO.4)。4.一种试剂盒，包含权利要求2或3所述的引物组。5.根据权利要求4所述的试剂盒，其特征在于：所述正向引物1和正向引物2的5
’
端分别带有序列标签A和序列标签B，所述序列标签A和序列标签B的核苷酸序列互不相同并且与丝瓜基因组序列不同源；优选地，所述试剂盒还包含PCR预混液，所述PCR预混液含有荧光探针A、荧光探针B、淬灭探针A和淬灭探针B；所述荧光探针A的核苷酸序列与序列标签A的核苷酸序列一致，荧光探针A的5
’
端连接荧光基团A；所述淬灭探针A的核苷酸序列与序列标签A的核苷酸序列反向互补，淬灭探针A的3
’
端连接淬灭基团；所述荧光探针B的核苷酸序列与序列标签B的核苷酸序列一致，荧光探针B的5
’
端连接荧光基团B；所述淬灭探针B的核苷酸序列与序列标签B的核苷酸序列反向互补，淬灭探针B的3
’
端连接淬灭基团。6.(a1)～(a3)中任一项在(1)～(10)中任一种中的应用；(a1)权利要求1所述的与丝瓜瓜长相关的SNP分子标记；(a2)权利要求2～3中任一项所述的引物组；(a3)权利要求4～5中任一项所述的试剂盒；(1)鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的瓜长性状；(2)制备鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的瓜长性状的产品；(3)鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的果实为长瓜还是短瓜；(4)制备鉴定或辅助鉴定待测丝瓜的果实为长瓜还是短瓜的产品；(5)选育果实为长瓜的丝瓜；(6)制备选育果实...
【专利技术属性】
技术研发人员：赵钢军，吴海滨，罗剑宁，龚浩，李俊星，郑晓明，刘小茜，
申请(专利权)人：广东省农业科学院蔬菜研究所，
类型：发明
国别省市：
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