使用微流体位置编码设备的方法技术

实施方案涉及可用于路由和跟踪微流体设备内的多个移动单元的方法和组合物。移动单元可以路由通过多个化学环境，并且可以跟踪移动单元以确定移动单元已经路由通过的路径和/或环境。移动单元可以根据预定算法进行路由。移动单元可以按顺序的流通过微流体设备。通过微流体设备路由的移动单元可用于执行与单元独特相关的各种化学反应，包括但不限于肽合成、酶促基因合成和基因组装。酶促基因合成和基因组装。酶促基因合成和基因组装。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】使用微流体位置编码设备的方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求基于2019年2月25日提交的美国临时申请第62/810,196 号、2019年2月27日提交的美国临时申请第62/811,506号、2019年6月 19日提交的美国临时申请第62/863,712号和2020年1月7日提交的美国 临时申请第62/958,153号的优先权，全部申请均通过引用整体并入本文中。

技术介绍

[0003]在生物学、化学和其他领域，通常既需要创建大量化合物或产品，又 要评估这些产品的特性、性能、性质或实用性。从历史上看，单个产品是 在单独的容器中制造和表征的。已经开发并公开了批量类型的程序，该程 序能够一次生产多个产品。然而，由于成本、空间要求和所需的物理操纵， 长期以来一直希望开发可以生产或评估非常大的产品库的替代方法。诸如 拆分合成之类的方法需要在库中进行编码、随机性、冗余和表示不足的问 题。发现与单元关联的目标产品的标识可能是耗时、昂贵或费力的。此外， 编码方法具有与成本效益、可伸缩性、速度和准确性有关的挑战。
[0004]自1983年本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.从寡核苷酸片段组装DNA链的方法，包括：在微流体设备中提供用多个寡核苷酸捕获元件引发的一个或多个固体支持物；基于寡核苷酸片段混合物中的多个寡核苷酸捕获元素和寡核苷酸片段，使寡核苷酸片段混合物流过一个或多个固体支持物以诱导退火；以及将退火的寡核苷酸片段接合成多个组装的DNA链，每个组装的DNA链对应于所述多个寡核苷酸捕获元素中的单个捕获元素。2.根据权利要求1所述的方法，还包括：使纠错酶流过多个组装的DNA链以产生裂解的DNA链和完整的DNA链；以及使扩增引物在组装的DNA链上流动以产生游离的双链DNA，其中所述扩增引物仅匹配整个DNA链。3.根据权利要求2所述的方法，还包括：对游离的双链DNA进行测序；选择已测序的无珠双链DNA之一作为完美DNA链；以及选择与完美DNA链相对应的扩增引物。4.根据权利要求3所述的方法，还包括使对应于完美DNA链的所述扩增引物在多个组装的DNA链上流动，以创建完美DNA链的克隆链。5.根据权利要求3所述的方法，进一步包括将对应于完美DNA链的扩增引物与游离双链DNA混合以产生完美DNA链的克隆链。6.根据权利要求1
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5中任一项所述的方法，其中寡核苷酸扩散距离为500微米或更小。7.根据权利要求1
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5中任一项所述的方法，其中寡核苷酸扩散距离为200微米或更小。8.根据权利要求1
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5中任一项所述的方法，其中寡核苷酸扩散距离为100微米或更小。9.根据权利要求1
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8中任一项所述的方法，其中该DNA组装方法在1小时或更短的时间内完成。10.根据权利要求1
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8中任一项所述的方法，其中该DNA组装方法在20分钟或更短的时间内完成。11.根据权利要求1
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8中任一项所述的方法，其中该DNA组装方法在5分钟或更短的时间内完成。12.根据权利要求1
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8中任一项所述的方法，其中该DNA组装方法在1分钟或更短的时间内完成。13.根据权利要求1
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12中任一项所述的方法，其中所述一个或多个固体支持物基本上以单列排列。14.根据权利要求1
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5中任一项所述的方法，其中每个寡核苷酸捕获元素包含唯一的分子标识符，并且每条组装DNA链包含与相应的唯一的分子标识符相连的靶标DNA链。15.DNA组装方法，包括：在微流体回路的腔室中设置固相支撑柱；在所述微流体回路的通道中进行酶促反应以产生反应混合物，该通道与腔室流体耦合；以及使所述反应混合物流过所述腔室中的固相支撑柱以捕获组装的寡核苷酸。16.根据权利要求15所述的方法，还包括：
使洗涤混合物流过所述固相支撑柱以除去所述反应混合物的剩余部分。17.根据权利要求16所述的方法，还包括：使洗脱液流过所述固相支撑柱以洗脱组装的多个寡核苷酸。18.根据权利要求15所述的方法，还包括：使洗脱液流过所述固相支撑柱以洗脱组装的多个寡核苷酸。19.系链DNA组装方法，包括：在微流体设备内的一种或多种固体支持物上捕获一种或多种寡核苷酸片段；使额外的寡核苷酸片段流过捕获的寡核苷酸片段；提供组装酶以产生组装的DNA链；使纠错酶流过组装的DNA链，以产生裂解的DNA链和完整DNA链；以及使扩增引物流过组装的DNA链以产生无支持物的双链DNA，其中所述所述扩增引物仅匹配所述完整DNA链。20.根据权利要求1或19所述的方法，其中所述一个或多个固体支持物包含一个或多个珠子。21.根据权利要求1或19所述的方法，其中所述一个或多个固体支持物包括位于所述微流体设备的腔室中的支持基质。22.根据权利要求1或19所述的方法，其中所述一个或多个固体支持物包括位于所述微流体设备的通道中的支持基质。23.根据权利要求1或19所述的方法，其中所述一个或多个固体支持物包含微流体设备的室壁。24.根据权利要求1或19所述的方法，其中所述一个或多个固体支持物包括所述微流体设备的通道壁。25.根据权利要求1或19所述的方法，其中所述一个或多个固体支持物包括平坦基材。26.根据权利要求19所述的方法，还包括：对无支持物的双链DNA进行测序；选择已测序的无支持物的双链DNA之一作为完美DNA链；以及提供与所述完美DNA链相对应的扩增引物。27.根据权利要求26所述的方法，还包括：使对应于完美DNA链的扩增引物流过组装的DNA链，以产生多个完美DNA链的克隆链。28.根据权利要求27所述的方法，还包括：将多个克隆的完美DNA链储存到靶标序列库中。29.根据权利要求26所述的方法，还包括：将所述完美DNA链对应的扩增引物与无珠双链DNA混合，产生完美DNA链的多条克隆链。30.根据权利要求29所述的方法，还包括：将完美DNA链的多个克隆链储存到靶标序列库中。31.为分子创建唯一的分子标识符的方法，包括：提供具有多个附着部位的支持单元；在所述多个附着位点中的每一个处附着分子特异性多碱基寡聚物，其中对于支持单元上的所有附着位点，所述分子特异性多碱基寡聚物是不同的；
在所述支持单元上的多个附着位点的至少一个...

【专利技术属性】
技术研发人员：M，
申请(专利权)人：艾勒根公司，
类型：发明
国别省市：