【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于检测高级别鳞状上皮内病变的引物组合物
[0001]本专利技术涉及用于检测高级别鳞状上皮内病变(HSIL)和/或用于对人乳头瘤病毒(HPV)进行分型的引物组合物、试剂盒和方法。
技术介绍
[0002]人乳头瘤病毒(HPV)感染与宫颈癌(女性中最常见的癌症之一)和其它癌症的发展相关,所述其它癌症如肛门癌(LinC等人,Human papillomavirus types from infection to cancer in the anus,according to sex and HIV status:a systematic review and meta
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analysis.Lancet Infect Dis,2018,18:198
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206)、以及头颈癌(Chaturvedi AK等人,Human papillomavirus and rising oropharyngeal cancer incidence in the United States.J Clin Oncol O ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于检测高级别鳞状上皮内病变(HSIL)的引物组合物,其包含第一引物集合,所述第一引物集合称为剪接点引物集合,所述第一引物集合包含:
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HPV16特异性引物对的第一子集的至少2对引物,所述HPV16特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:1
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2至SEQ ID NO:27
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28组成的组的核酸序列;和
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HPV18特异性引物对的第二子集的至少2对引物,所述HPV18特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:29
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30至SEQ ID NO:63
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64组成的组的核酸序列;和
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HPV31特异性引物对的第三子集的至少2对引物,所述HPV31特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:65
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66至SEQ ID NO:91
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92组成的组的核酸序列;和
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HPV33特异性引物对的第四子集的至少2对引物,所述HPV33特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:93
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94至SEQ ID NO:117
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118组成的组的核酸序列;和
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HPV35特异性引物对的第五子集的至少2对引物,所述HPV35特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:119
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120至SEQ ID NO:145
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146组成的组的核酸序列;和
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HPV39特异性引物对的第六子集的至少2对引物,所述HPV39特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:147
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148至SEQ ID NO:165
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166组成的组的核酸序列;和
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HPV45特异性引物对的第七子集的至少2对引物,所述HPV45特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:167
‑
168至SEQ ID NO:193
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194组成的组的核酸序列;和
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HPV51特异性引物对的第八子集的至少2对引物,所述HPV51特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:195
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196至SEQ ID NO:213
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214组成的组的核酸序列;和
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HPV52特异性引物对的第九子集的至少2对引物,所述HPV52特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:215
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216至SEQ ID NO:245
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246组成的组的核酸序列;和
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HPV56特异性引物对的第十子集的至少2对引物,所述HPV56特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:247
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248至SEQ ID NO:277
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278组成的组的核酸序列;和
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HPV58特异性引物对的第十一子集的至少2对引物,所述HPV58特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:279
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280至SEQ ID NO:303
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304组成的组的核酸序列;和
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HPV59特异性引物对的第十二子集的至少2对引物,所述HPV59特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:305
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306至SEQ ID NO:331
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332组成的组的核酸序列;和
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HPV66特异性引物对的第十三子集的至少2对引物,所述HPV66特异性引物对具有选自
由SEQ ID NO:333
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334至SEQ ID NO:361
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362组成的组的核酸序列。2.根据权利要求1所述的HSIL引物组合物,其中所述剪接点引物集合进一步包含:
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HPV68特异性引物对的第十四子集的至少2对引物,所述HPV68特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:363
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364至SEQ ID NO:381
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382组成的组的核酸序列;和/或
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HPV73特异性引物对的第十五子集的至少2对引物,所述HPV73特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:383
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384至SEQ ID NO:407
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408组成的组的核酸序列;和/或
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HPV82特异性引物对的第十六子集的至少2对引物,所述HPV82特异性引物对具有选自由SEQ ID NO:409
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410至SEQ ID NO:429
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430组成的组的核酸序列。3.根据权利要求1或2所述的用于检测HSIL的引物组合物,其中所述剪接点引物集合包含如权利要求1中所定义的引物对的第一子集至第十三子集的至少10对引物、优选10对引物,以及任选地如权利要求2中所定义的引物对的第十四子集和/或第十五子集和/或第十六子集的至少10对引物、优选10对引物。4.一种用于检测HSIL的引物组合物,其包含引物对的第一集合,所述引物对的第一集合称为剪接点引物集合,所述引物对的第一集合包含:
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HPV16特异性引物对的第一子集的至少2对引物,所述HPV16特异性引物对能够产生具有选自由SEQ ID NO:1501至SEQ ID NO:1514组成的组的核酸序列的扩增子;和
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HPV18特异性引物对的第二子集的至少2对引物,所述HPV18特异性引物对能够产生具有选自由SEQ ID NO:1515至SEQ ID NO:1532组成的组的核酸序列的扩增子;和
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HPV31特异性引物对的第三子集的至少2对引物,所述HPV31特异性引物对能够产生具有选自由SEQ ID NO:1533至SEQ ID NO:1546组成的组的核酸序列的扩增子;和
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HPV33特异性引物对的第四子集的至少2对引物,所述HPV33特异性引物对能够产生具有选自由SEQ ID NO:1547至SEQ ID NO:1559组成的组的核酸序列的扩增子;和
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HPV35特异性引物对的第五子集的至少2对引物,所述HPV35特异性引物对能够产生具有选自由SEQ ID NO:1560至SEQ ID NO:1573组成的组的核酸序列的扩增子;和
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HPV39特异性引物对的第六子集的至少2对引物,所述HPV39特异性引物对能够产生具有选自由SEQ ID NO:1574至SEQ ID NO:1583组成的组的核酸序列的扩增子;和
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HPV45特异性引物对的第七子集的至少2对引物,所述HPV45特异性引物对能够产生具有选自由SEQ ID NO:1584至SEQ ID NO:1597组成的组的核酸序列的扩增子;和
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HPV51特异性引物对的第八子集的至少2对引物,所述HPV51特异性引物对能够产生具有选自由SEQ ID NO:1598至SEQ ID NO:1607组成的组的核酸序列的扩增子;
和
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HPV52特异性引物对的第九子集的至少2对引物,所述HPV52特异性引物对能够产生具有选自由SEQ ID NO:1608至SEQ ID NO:1623组成的组的核酸序列的扩增子;和
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HPV56特异性引物对的第十子集的至少2对引物,所述HPV56特异性引物对能够产生具有选自由SEQ ID NO:1624至SEQ ID NO:1639组成的组的核酸序列的扩增子;和
‑
HPV58特异性引物对的第十一子集的至少2对引物,所述HPV58特异性引物对能够产生具有选自由SEQ ID NO...
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