识别MHCII类限制性MAGE-A3的T细胞受体制造技术

本申请涉及识别MHC II类限制性MAGE

【技术实现步骤摘要】
识别MHC II类限制性MAGE
‑
A3的T细胞受体
[0001]本申请是申请号为201380059102.4的专利技术名称为“识别MHC II类限制性MAGE
‑
A3的T细胞受体”的中国专利申请的分案申请，原申请是2013年09月13日提交的PCT国际申请PCT/US2013/059608于2015年05月12日进入中国国家阶段的申请。
[0002]本专利技术是在国立卫生研究院国家癌症研究院的项目号ZIABC010984下，利用政府的资助完成的。政府对本专利技术享有一定的权利。
[0003]相关申请的交叉引用
[0004]本申请要求于2012年9月14日提交的美国临时申请No.61/701,056的权益，其全部内容通过引用并入本文。
[0005]以电子方式提交的材料的引用并入
[0006]与本文同时提交的计算机可读核苷酸/氨基酸序列表通过引用整体并入本文并且标识如下：日期为2013年8月20日，名称为“714146ST25.TXT”的一个63,888字节ASCII(Text)文件。


[0007]本申请涉及识别MHC II类限制性MAGE
‑
A3的T细胞受体。

技术介绍

[0008]过继细胞疗法(adoptive cell therapy，ACT)涉及使反应性T细胞转移至患者中，包括使肿瘤反应性T细胞转移至癌症患者中。使用靶向人白细胞抗原(HLA)
‑
A＊02限制性T细胞表位之T细胞的过继细胞疗法在一些患者中已成功地引起肿瘤消退。然而，缺乏HLA
‑
A＊02表达的患者不能用靶向HLA
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A＊02限制性T细胞表位的T细胞进行治疗。这样的限制对过继细胞疗法的广泛应用产生了障碍。因此，需要用于治疗癌症的改进免疫组合物和方法。

技术实现思路

[0009]本专利技术的一个实施方案提供了对MAGE
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A3
243
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258
和MAGE
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A6具有抗原特异性的分离或纯化的T细胞受体(TCR)及其功能部分和功能变体。
[0010]本专利技术的另一个实施方案提供了包含(a)SEQ ID NO：3至8或(b)SEQ ID NO：21至22，或者(a)或(b)的功能变体的分离或纯化的TCR，其中所述功能变体包含在(a)的任意一个或更多个或(b)的任意一个或更多个中具有至少一个氨基酸替换的(a)或(b)，并且所述功能变体在HLA
‑
DPβ1＊04的背景下对MAGE
‑
A3具有抗原特异性。
[0011]本专利技术还提供了相关多肽和蛋白质，以及相关核酸、重组表达载体、宿主细胞和细胞群。本专利技术还提供了与本专利技术TCR(包括其功能部分和功能变体)相关的抗体或其抗原结合部分和药物组合物。
[0012]本专利技术还提供了在哺乳动物中检测癌症存在的方法和在哺乳动物中治疗或预防癌症的方法。本专利技术的在哺乳动物中检测癌症的存在的方法包括：(i)使包含癌症细胞的样品与本文所述的本专利技术TCR(包括其功能部分和功能变体)、多肽、蛋白质、核酸、重组表达载
体、宿主细胞、宿主细胞群或者抗体或其抗原结合部分中的任意一种相接触，从而形成复合物；以及(ii)检测所述复合物，其中检测到所述复合物指示所述哺乳动物中存在癌症。
[0013]本专利技术的在哺乳动物中治疗或预防癌症的方法包括：以有效治疗或预防所述哺乳动物中癌症的量向所述哺乳动物施用本文所述的TCR(包括其功能部分和功能变体)、多肽或蛋白质中的任意一种，包含编码本文所述的TCR(包括其功能部分和功能变体)、多肽、蛋白质中任意一种的核苷酸序列的任意核酸或重组表达载体，或者包含编码本文所述的TCR(包括其功能部分和功能变体)、多肽或蛋白质中任意一种的的重组载体的任意宿主细胞或宿主细胞群。
附图说明
[0014]图1A和1B是示出响应于与未经转染的293
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CIITA靶细胞(292
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CIITA)或者经全长NY
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ESO
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1(293
‑
CIITA
‑
NY
‑
ESO
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1)蛋白、MAGE
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A1蛋白(293
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CIITA
‑
MAGE A1)、MAGE
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A3蛋白(293
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CIITA
‑
MAGE
‑
A3)、MAGE
‑
A6蛋白(293
‑
CIITA
‑
MAGE
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A6)或MAGE A12蛋白(293
‑
CIITA
‑
MAGE
‑
A12)转染的293
‑
CIITA靶细胞的共培养，来自第一供体(1A)和第二供体(1B)的CD4+T细胞的干扰素(IFN)
‑
γ分泌(pg/ml)的条形图。所述T细胞是未转导的(UT)或者经F5(抗MART
‑
1)TCR、R12C9TCR或6F9TCR转导的。
[0015]图2A是示出响应于与未经处理的或者经抗MAGE
‑
A3 siRNA或抗MART
‑
1 siRNA处理的526
‑
CIITA细胞的共培养，来自人供体的T细胞的IFN
‑
γ分泌(pg/ml)的条形图，所述T细胞是未转导的或者经6F9 TCR或F5 TCR转导的。
[0016]图2B是示出响应于与未经处理的或者经抗MAGE
‑
A3 siRNA或抗MART
‑
1 siRNA处理的H1299
‑
CIITA细胞的共培养，来自人供体的CD4+T细胞的IFN
‑
γ分泌(pg/ml)的条形图，所述CD4+T细胞是未转导的或者经6F9TCR转导的。
[0017]图3是示出单独培养的(仅T细胞)或者与3071细胞、3071
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CIITA细胞、397细胞、397
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CIITA细胞、2630细胞、2630
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CIITA细胞、2984细胞或2984
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CIITA细胞共培养的经6F9转导PBL的IFN
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γ分泌(pg/ml)的条形图。
[0018]图4是示出在单独培养(仅T细胞)或者响应于与未经处理的H1299
‑
CIITA细胞、经抗HLA
‑
DP或抗HLA
‑
DR siRNA转染的H1299
‑
CIITA、未经处理的526
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CIITA细胞、或经抗HLA
‑
DP或抗HLA
‑
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.至少一种表达TCR的宿主细胞在制备用于在哺乳动物中治疗或预防癌症的药物中的用途，其中所述TCR包含：(a)SEQ ID NO：3的α链CDR1氨基酸序列，SEQ ID NO：4的α链CDR2氨基酸序列，SEQ ID NO：5的α链CDR3氨基酸序列，SEQ ID NO：6的β链CDR1氨基酸序列，SEQ ID NO：7的β链CDR2氨基酸序列，以及SEQ ID NO：8的β链CDR3氨基酸序列，或者(b)(a)的功能变体，其中所述功能变体包含：(I)SEQ ID NO：3的α链CDR1氨基酸序列，SEQ ID NO：4的α链CDR2氨基酸序列，SEQ ID NO：29的α链CDR3氨基酸序列，SEQ ID NO：6的β链CDR1氨基酸序列，SEQ ID NO：7的β链CDR2氨基酸序列，以及SEQ ID NO：8的β链CDR3氨基酸序列，其中：(1)在SEQ ID NO：29中，在4位的Xaa是Ala，在5位的Xaa是Ser，在6位的Xaa是Gly，并且在7位的Xaa是Thr；(2)在SEQ ID NO：29中，在4位的Xaa是Ser，在5位的Xaa是Ala，在6位的Xaa是Gly，并且在7位的Xaa是Thr；(3)在SEQ ID NO：29中，在4位的Xaa是Ser，在5位的Xaa是Ser，在6位的Xaa是Gly，并且在7位的Xaa是Ala；(4)在SEQ ID NO：29中，在4位的Xaa是Val，在5位的Xaa是Ser，在6位的Xaa是Gly，并且在7位的Xaa是Thr；或者(II)SEQ ID NO：3的α链CDR1氨基酸序列，SEQ ID NO：4的α链CDR2氨基酸序列，SEQ ID NO：5的α链CDR3氨基酸序列，SEQ ID NO：6的β链CDR1氨基酸序列，SEQ ID NO：7的β链CDR2氨基酸序列，以及SEQ ID NO：30的β链CDR3氨基酸序列，其中：(1)在SEQ ID NO：30中，在4位的Xaa是Ala，在5位的Xaa是Thr，在6位的Xaa是Gly，并且在7位的Xaa是Pro；或者(2)在SEQ ID NO：30中，在4位的Xaa是Arg，在5位的Xaa是Ala，在6位的Xaa是Gly，并且在7位的Xaa是Pro，并且所述TCR和功能变体在HLA
‑
DPβ1＊04的背景下对MAGE
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A3
243
‑
258
具有抗原特异性，其中所述癌症是急性淋巴细胞癌；骨癌；脑癌；乳腺癌；肛门癌、肛管癌或肛肠癌；眼癌；肝内胆管癌；关节癌；颈癌、胆囊癌或胸膜癌；鼻癌、鼻腔癌或中耳癌；口腔癌；外阴癌；宫颈癌；慢性髓细胞癌；结肠癌；食管癌；胃癌；胃肠道类癌肿瘤；胶质瘤；头癌；肝细胞癌；下咽部癌；肾癌；喉癌；白血病；肝癌；肺癌；淋巴瘤；恶性间皮瘤；黑素瘤；多发性骨髓瘤；鼻咽癌；卵巢癌；颈癌；胰腺癌；腹膜癌、网膜癌和肠系膜癌；咽癌；前列腺癌；直肠癌；肉瘤；小肠癌；软组织癌；胃癌；睾丸癌；甲状腺癌；或尿路上皮癌，其中所述癌症是MAGE
‑
A3阳性的。2.根据权利要求1所述的用途，其中所述功能变体包含(a)SEQ ID NO：29，其中Xaa4是Ala，Xaa5是Ser，Xaa6是Gly且Xaa7是Thr；或者(b)SEQ ID NO：29，其中Xaa4是Ser，Xaa5是Ala，Xaa6是Gly且Xaa7是Thr.3.根据权利要求1或2所述的用途，其中所述TCR包含鼠恒定区.4.根据权利要求1或2所述的用途，其中所述TCR包含含有SEQ ID NO：25和/或SEQ ID NO：26的鼠恒定区.5.根据权利要求1或2所述的用途，其中所述TCR包含：
(a)SEQ ID NO：9和10；(b)SEQ ID NO：10和31，其中：(1)在SEQ ID NO：31中，116位的Xaa是Ala，117位的Xaa是Ser，118位的Xaa是Gly，并且119位的Xaa是Thr；(2)在SEQ ID NO：31中，116位的Xaa是Ser，117位的Xaa是Ala，118位的Xaa是Gly，并且119位的Xaa是Thr；(3)在SEQ ID NO：31中，116位的Xaa是Ser，117位的Xaa是Ser，118位的Xaa是Gly，并且119位的Xaa是Ala；或者(4)在SEQ ID NO：31中，116位的Xaa是Val，117位的Xaa是Ser，118位的Xaa是Gly，并且119...

【专利技术属性】
技术研发人员：保罗，
申请(专利权)人：美国政府卫生与公众服务部，
类型：发明
国别省市：