TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用制造技术

本发明专利技术提供了TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用。是基于本发明专利技术发明专利技术人首次发现TCL患者外周血中TNFAIP3非编码序列突变情况与TCL患者的预后相关。当发生TNFAIP3非编码序列突变时，表明TCL患者临床预后好的可能性较大。TNFAIP3非编码序列突变情况对于TCL患者的预后判断和临床治疗方案的制定具有重要的指导意义，可为TCL患者的应用靶向药物提供更多的临床预后研究资料，具有广阔的应用前景。具有广阔的应用前景。具有广阔的应用前景。

【技术实现步骤摘要】
TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用


[0001]本专利技术属于生物医学领域，特别涉及TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用。

技术介绍

[0002]T细胞淋巴瘤(T
‑
cell lymphoma，TCL)起源于淋巴母细胞或成熟T细胞。这种疾病仅占非霍奇金淋巴瘤的10
‑
15％，可进一步细分为许多相对罕见的亚型。与B细胞淋巴瘤患者相比，TCL患者的预后往往较差。目前，基于国际预后指数(international prognosis index,IPI)的危险分层在预测TCL患者的预后方面取得了重大进展，这种精准化的危险分层可以为临床决策提供重要的参考，从而改善患者的预后。然而，基于IPI的危险分层仍不能对所有TCL患者的预后进行精准预测。因此，需要进一步探索改善TCL危险分层的新型生物标志物。
[0003]细胞内泛素编辑蛋白肿瘤坏死因子α诱导蛋白3(tumor necrosis factor alpha inducing protein 3,TNFAIP3)，也称为A20，通过肿瘤坏死因子和Toll样受体在多种途径中负调控NF
‑
κB的活性。TNFAIP3基因位点位于染色体6q23，其缺失常发生于B细胞淋巴瘤，尤其是结外边缘区B细胞淋巴瘤和弥漫性大B细胞淋巴瘤。此外，之前的一些研究表明，TNFAIP3缺失常见于皮肤T细胞淋巴瘤和NK
‑
T细胞淋巴瘤。但是，多个研究中心探讨了NK
‑
T细胞淋巴瘤患者中TNFAIP3缺失的预后价值，发现其结果相互矛盾。在我们之前的研究中，在T细胞肿瘤中发现了TNFAIP3的非编码序列(non
‑
coding sequence,non
‑
CDS)区域发生了突变。然而，TNFAIP3的non
‑
CDS突变对TCL患者的预后方面的评估仍然缺乏。

技术实现思路

[0004]本专利技术的首要目的在于克服现有技术的缺点与不足，提供TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用。当检测到TNFAIP3非编码序列突变时，表明TCL患者的预后良好可能性大，可以作为预测TCL患者预后评估的指标。
[0005]本专利技术的另一目的在于提供一种预测T细胞淋巴瘤预后的试剂盒。
[0006]本专利技术的目的通过下述技术方案实现：
[0007]TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用，是基于本专利技术的专利技术人首次发现TCL患者外周血单个核细胞中TNFAIP3非编码序列突变情况与T细胞淋巴瘤患者的预后相关。
[0008]在所述的应用中，通过检测临床患者的外周血单个核细胞中TNFAIP3非编码序列突变情况，从而预测T细胞淋巴瘤预后。
[0009]进一步地，所述的突变的区域为如下区域的至少一个区域或多个区域的组合：
[0010]1)TNFAIP3基因5
′‑
UTR的部分或全部区域；
[0011]2)TNFAIP3基因3
′‑
UTR的部分或全部区域；
[0012]3)TNFAIP3基因内含子的部分或全部区域。
[0013]更进一步地，所述的突变的区域为TNFAIP3基因如下六个位点的至少一个位点或多个位点的组合：g.3918、g.3637、g.3869、g.13751、g.14244、g.11822。
[0014]更进一步地，所述的突变为如下突变情况的至少一种情况或多种情况的组合：g.3918C>T突变、g.3637T>A突变、g.3869C>G、g.13751A>C突变、g.14244C>T突变、g.11822T>C突变。
[0015]所述的预测具体指：
[0016]①
当TNFAIP3非编码序列有突变时，TCL患者临床预后良好的可能性较大；
[0017]②
当TNFAIP3非编码序列无突变时，TCL患者临床预后差的可能性较大。
[0018]所述的预后良好是指当TNFAIP3非编码序列有突变时，TCL患者的总体生存率大于83％；
[0019]所述的预后差是指当TNFAIP3非编码序列无突变时，TCL患者的总体生存率小于44％。
[0020]一种预测T细胞淋巴瘤预后的试剂盒，包括用于扩增包含TNFAIP3基因非编码序列的序列的引物中的一组或多组引物的组合。
[0021]进一步地，所述的试剂盒包括如下用于扩增TNFAIP3基因5
′‑
UTR启动子序列片段的引物、用于扩增TNFAIP3基因3
′‑
UTR序列片段的引物和用于扩增TNFAIP3基因外显子和内含子序列片段的引物中的一组或多组引物的组合：
[0022](1)用于扩增TNFAIP3基因5
′‑
UTR启动子序列片段的引物：
[0023]Promoter(g.2933
‑
3687)(F):5'
‑
TTTACAAAGGAGCACCAGCAGGAGA
‑
3'；
[0024]Promoter(g.2933
‑
3687)(R):5'
‑
ATTACATTTAAGAATACTTGTCAGG
‑
3'；
[0025]Promoter(g.3568
‑
4249)(F):5'
‑
AAGTGCCACCCTCCATCC
‑
3'；
[0026]Promoter(g.3568
‑
4249)(R):5'
‑
AGCGGTGACAGCCTTTGG
‑
3'；
[0027]Promoter(g.4110
‑
4744)(F):5'
‑
GGTGAGTGTTGTTCTGATTC
‑
3'；
[0028]Promoter(g.4110
‑
4744)(R):5'
‑
TCACGTGACTCTCTGGGTCG
‑
3'；
[0029](2)用于扩增TNFAIP3基因3
′‑
UTR序列片段的引物：
[0030]3’‑
UTR(g.18828
‑
19347)(F):5'
‑
CAACGGCTACTGCAACGAAT
‑
3'；
[0031]3’‑
UTR(g.18828
‑
19347)(R):5'
‑
CTCGCTGCCATGAGGATCT
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用。2.根据权利要求1所述的TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用，其特征在于：通过检测临床患者的外周血中TNFAIP3非编码序列突变情况，从而预测T细胞淋巴瘤预后。3.根据权利要求1所述的TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用，其特征在于：所述的突变的区域为如下区域的至少一个区域或多个区域的组合：1)TNFAIP3基因5
′‑
UTR的部分或全部区域；2)TNFAIP3基因3
′‑
UTR的部分或全部区域；3)TNFAIP3基因内含子的部分或全部区域。4.根据权利要求1所述的TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用，其特征在于：所述的突变的区域为TNFAIP3基因如下六个位点的至少一个位点或多个位点的组合：g.3918、g.3637、g.3869、g.13751、g.14244、g.11822。5.根据权利要求1所述的TNFAIP3非编码序列突变检测试剂在制备预测T细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用，其特征在于：所述的预测具体指：
①
当TNFAIP3非编码序列有突变时，T细胞淋巴瘤患者临床预后良好的可能性较大；
②
当TNFAIP3非编码序列无突变时，T细胞淋巴瘤患者临床预后差的可能性较大。6.一种预测T细胞淋巴瘤预后的试剂盒，其特征在于：包括如下用于扩增TNFAIP3基因5
′‑
UTR启动子序列片段的引物、用于扩增TNFAIP3基因3
′‑
UTR序列片段的引物和用于扩增TNFAIP3基因外显子和内含子序列片段的引物中的一组或多组引物的组合：(1)用于扩增TNFAIP3基因5
′‑
UTR启动子序列片段的引物：Promoter(g.2933
‑
3687)(F):5'
‑
TTTACAAAGGAGCACCAGCAGGAGA
‑
3'；Promoter(g.2933
‑
3687)(R):5'
‑
ATTACATTTAAGAATACTTGTCAGG
‑
3'；Promoter(g.3568
‑
4249)(F):5'
‑
AAGTGCCACCCTCCATCC
‑
3'；Promoter(g.3568
‑
4249)(R):5'
‑
AGCGGTGACAGCCTTTGG
‑
3'；Promoter(g.4110
‑
4744)(F):5'
‑
GGTGAGTGTTGTTCTGATTC
‑
3'；Promoter(g.4110
‑
4744)(R):5'
‑
TCACGTGACTCTCTGGGTCG
‑
3'；(2)用于扩增TNFAIP3基因3
′‑
UTR序列片段的引物：3
’‑
UTR(g.18828
‑
19347)(F):5'
‑
CAACGGCTACTGCAACGAAT
‑
3'；3
’‑
UTR(g.18828
‑
19347)(R):5'
‑
CTCGCTGCCATGAGGATCT
‑
3'；3
’‑
UTR(g.19272
‑
19787)(F):5'
‑
GAGAAGCCAGAGCCATTCCACCT
‑
3'；3
’‑
UTR(g.19272
‑
19787)(R):5'
‑
GCTCATGCCCCAACAACAACCA
‑
3'；3
’‑
UTR(g.19717
‑
20407)(F):5'
‑
GCTGCCCTAGAAGTACAATA
‑
3'；3
’‑
UTR(g.19717
‑
20407)(R):5'
‑
GACAGCAACCACAAAGCACAC
‑
3'；3
’‑
UTR(g.20455
‑
...

【专利技术属性】
技术研发人员：权利要求书三页说明书八页序列表七页附图一页，
申请(专利权)人：暨南大学，
类型：发明
国别省市：