一种增加基因组突变率的碱基编辑系统及碱基编辑方法技术方案

技术编号:30755326 阅读:30 留言:0更新日期:2021-11-10 12:09
本发明专利技术公开了一种增加基因组突变率的碱基编辑系统及碱基编辑方法,所述碱基编辑系统包括编码胞嘧啶脱氨酶的基因和编码特异性单链DNA结合蛋白的基因。利用本发明专利技术构建的碱基编辑系统,对酿酒酵母基因组进行进化,在操作上具有简单,效率高等优点,在功能上,能提高β

【技术实现步骤摘要】
一种增加基因组突变率的碱基编辑系统及碱基编辑方法


[0001]本专利技术涉及生物工程
,特别是涉及一种增加基因组突变率的碱基编辑系统及碱基编辑方法。

技术介绍

[0002]酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)作为第一个全基因组测序的模式真核生物,也是最早被应用于酿酒、食品等方面的微生物之一,如今已经被广泛应用于各种食品、化工产品和药品的大规模生产。酿酒酵母具有遗传背景清楚、遗传操作性强、发酵性能好等优点,是优良的代谢工程底盘细胞。随着合成生物学的发展,各种微生物,包括毕赤酵母(Pichia pastoris)、大肠杆菌(Escherichia coli)、罗尔斯通氏菌(Ralstonia eutropha)等,都已经被开发成生产天然产品的细胞工厂。
[0003]然而,由于生物系统的复杂性,诸如胁迫耐受性等受到多基因调控的复杂表型,单基因理性改造方法很难实现预定的目标。为了克服这一主要限制,微生物细胞工厂需构建一种强大的多功能工具——基因组突变,以满足工业生产需求(夏思杨;江丽红;蔡谨;黄磊;徐志南;连佳长,本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种增加基因组突变率的碱基编辑系统,其特征在于,包括编码胞嘧啶脱氨酶的基因和编码特异性单链DNA结合蛋白的基因。2.如权利要求1所述的碱基编辑系统,其特征在于,编码胞嘧啶脱氨酶的基因是哺乳动物的胞嘧啶脱氨酶APOBEC1。3.如权利要求2所述的碱基编辑系统,其特征在于,编码胞嘧啶脱氨酶的基因是大鼠的胞嘧啶脱氨酶APOBEC1,基因序列如SEQ ID No.1所示。4.如权利要求1所述的碱基编辑系统,其特征在于,编码特异性单链DNA结合蛋白的基因是以下一种:(1)酿酒酵母的DNA单链结合蛋白3个亚基RFA1、RFA2、RFA3中的至少一个,RFA1、RFA2、RFA3的基因序列分别如SEQ ID No.2、SEQ ID No.3、SEQ ID No.4所示;(2)酿酒酵母的DNA引物酶PRI1,基因序列如SEQ ID No.5所示;(3)酿酒酵母的解旋酶HCS1,基因序列如SEQ ID No.6所示;(4)酿酒酵母的拓扑异构酶TOP1,基因序列如SEQ ID No.7所示;(5)毕赤酵母的单链结合蛋白亚基RPA,基因序列如SEQ ID No.8所示;(6)大肠杆菌的DNA单链结合蛋白ssb,基因序列如SEQ ID No.9所示;(7)罗尔斯通氏菌的单链结合蛋白h16_A0402,基因序列如SEQ ID No.10所示。5.如权利要求1所述的碱基编辑系统,其特征在于,将编码胞嘧啶脱氨酶的基因和编码特异性单链DNA结合蛋白的基因克隆到同一表达载体中进行共表达。6.如权利要求1~5任一所述的碱基编辑系统在提高菌株基因组突变率中的应用。7.如权利要求1~...

【专利技术属性】
技术研发人员:连佳长潘颖佳董昌夏思杨
申请(专利权)人:浙江大学杭州国际科创中心
类型:发明
国别省市:

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