【技术实现步骤摘要】
一种增加基因组突变率的碱基编辑系统及碱基编辑方法
[0001]本专利技术涉及生物工程
,特别是涉及一种增加基因组突变率的碱基编辑系统及碱基编辑方法。
技术介绍
[0002]酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)作为第一个全基因组测序的模式真核生物,也是最早被应用于酿酒、食品等方面的微生物之一,如今已经被广泛应用于各种食品、化工产品和药品的大规模生产。酿酒酵母具有遗传背景清楚、遗传操作性强、发酵性能好等优点,是优良的代谢工程底盘细胞。随着合成生物学的发展,各种微生物,包括毕赤酵母(Pichia pastoris)、大肠杆菌(Escherichia coli)、罗尔斯通氏菌(Ralstonia eutropha)等,都已经被开发成生产天然产品的细胞工厂。
[0003]然而,由于生物系统的复杂性,诸如胁迫耐受性等受到多基因调控的复杂表型,单基因理性改造方法很难实现预定的目标。为了克服这一主要限制,微生物细胞工厂需构建一种强大的多功能工具——基因组突变,以满足工业生产需求(夏思杨;江丽红;蔡谨;黄 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种增加基因组突变率的碱基编辑系统,其特征在于,包括编码胞嘧啶脱氨酶的基因和编码特异性单链DNA结合蛋白的基因。2.如权利要求1所述的碱基编辑系统,其特征在于,编码胞嘧啶脱氨酶的基因是哺乳动物的胞嘧啶脱氨酶APOBEC1。3.如权利要求2所述的碱基编辑系统,其特征在于,编码胞嘧啶脱氨酶的基因是大鼠的胞嘧啶脱氨酶APOBEC1,基因序列如SEQ ID No.1所示。4.如权利要求1所述的碱基编辑系统,其特征在于,编码特异性单链DNA结合蛋白的基因是以下一种:(1)酿酒酵母的DNA单链结合蛋白3个亚基RFA1、RFA2、RFA3中的至少一个,RFA1、RFA2、RFA3的基因序列分别如SEQ ID No.2、SEQ ID No.3、SEQ ID No.4所示;(2)酿酒酵母的DNA引物酶PRI1,基因序列如SEQ ID No.5所示;(3)酿酒酵母的解旋酶HCS1,基因序列如SEQ ID No.6所示;(4)酿酒酵母的拓扑异构酶TOP1,基因序列如SEQ ID No.7所示;(5)毕赤酵母的单链结合蛋白亚基RPA,基因序列如SEQ ID No.8所示;(6)大肠杆菌的DNA单链结合蛋白ssb,基因序列如SEQ ID No.9所示;(7)罗尔斯通氏菌的单链结合蛋白h16_A0402,基因序列如SEQ ID No.10所示。5.如权利要求1所述的碱基编辑系统,其特征在于,将编码胞嘧啶脱氨酶的基因和编码特异性单链DNA结合蛋白的基因克隆到同一表达载体中进行共表达。6.如权利要求1~5任一所述的碱基编辑系统在提高菌株基因组突变率中的应用。7.如权利要求1~...
【专利技术属性】
技术研发人员:连佳长,潘颖佳,董昌,夏思杨,
申请(专利权)人:浙江大学杭州国际科创中心,
类型:发明
国别省市:
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