一种甘蔗杂种真实性鉴定的分子标记体系及其开发方法技术

本发明专利技术涉及生物信息学与分子遗传育种技术领域，尤其涉及一种甘蔗杂种真实性鉴定的分子标记体系及其开发方法，通过对甘蔗现代栽培种的两个亲本割手密种和热带种的全基因组DNA序列的比较，选取种间差异的同源序列并分别设计分子标记引物，采用多个热带种和割手密种材料进行PCR扩增及电泳检测后，选取覆盖不同染色体共计8个种间多态的分子标记，该标记系统在杂种F1产生杂合带型。本发明专利技术的热带种与割手密种间多态标记可检测甘蔗杂交种真实性，由于标记覆盖全部染色体可大大降低真实杂种漏检率，同时，各个标记在种内具有高度保守性，可用于不同亲本组合间的杂种后代真实性鉴定，具有较好普遍适用性。较好普遍适用性。较好普遍适用性。

【技术实现步骤摘要】
一种甘蔗杂种真实性鉴定的分子标记体系及其开发方法


[0001]本专利技术涉及生物信息学与分子遗传育种
，尤其涉及一种甘蔗杂种真实性鉴定的分子标记体系及其开发方法。

技术介绍

[0002]甘蔗是全球最为重要的糖料与能源作物，其蔗糖产量占世界蔗糖产量的80％以上。现代甘蔗栽培种主要由具有高糖含量的热带种和抗逆性强的割手密种杂交而来。但是，热带种和割手密种均为多倍体植物，基因组复杂。热带种是一个含有80条染色体的八倍体(2n＝8x＝80)；割手密种的基因组较热带种更为复杂，其不同材料(clone，克隆)间往往具有不同的染色体组成。目前，已发现从2n＝40至2n＝128多达近40个不同的染色体数目类型的割手密种材料，其基因组包含从四倍体到十三倍体等多种倍性类型。同时，由于甘蔗花为圆锥花序，花结构小且多，人工去雄十分困难，因此，杂交后代杂种真实性鉴定成为甘蔗杂交育种工作关键。但是，至今仍没有建立高效且具有普遍适用性的杂种真实性鉴定方法，严重制约了甘蔗杂交制种工作的开展。
[0003]近年来，人们通过筛选亲本多态标记方法，尝试进行杂种真实性的本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种甘蔗杂种真实性鉴定的分子标记体系，其特征在于，所述分子标记体系由8个来自不同染色体且在割手密种和热带种间具有多态的分子标记构成，名称分别为SsCh1、SsCh2、SsCh3、SsCh4、SsCh5、SsCh6、SsCh7及SsCh8；其扩增引物的核苷酸序列分别为SEQ ID NO.1
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16所示。2.根据权利要求1所述的一种甘蔗杂种真实性鉴定的分子标记体系的开发方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤1、首先，采用生物信息分析方法比对热带种和割手密种基因组，获得两者具有差异的同源DNA序列；步骤2、根据上述差异的DNA序列分别设计引物；步骤3、分别采用多个热带种和割手密种材料进行PCR扩增和聚丙烯凝胶电泳检测，获得在种间具有多态，且种内具有保守性的标记；步骤4、选取符合以下标准8个标记：标记在两个种间呈现差异带型、标记在种内材料间具有高度保守带型、标记来自不同染色体，...

【专利技术属性】
技术研发人员：王凯，禄小溪，张会，
申请(专利权)人：南通大学，
类型：发明
国别省市：