用于检测COVID-19易感性的分子标记、试剂盒及应用制造技术

本发明专利技术公开了一种用于检测COVID

【技术实现步骤摘要】
用于检测COVID
‑
19易感性的分子标记、试剂盒及应用


[0001]本专利技术涉及基因的单核苷酸多态性(single nucleotidepolymorphism,SNP)及其与COVID
‑
19的相关性研究，属于分子生物 学和医学
，具体地涉及一种用于检测COVID
‑
19易感性的分 子标记、试剂盒及应用。

技术介绍

[0002]据数据模型研究和血清感染研究估计实际感染人数要大得多，表 明大多数感染者可能有轻度症状或无症状。COVID
‑
19患者表现出广 泛的临床症状：在确诊病例中，多达5％会发展成为包含急性呼吸窘 迫综合征(ARDS)在内的严重肺炎。虽然目前研究已发现高龄、男性、 高血压、糖尿病、肥胖和心血管疾病等因素与COVID
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19的发病密切 相关，但仍有大量没有上述危险因素的患者出现严重症状。提示 COVID
‑
19患者的筛选、早期诊断对于疫情防治具有重要意义，因此， 寻找和鉴定COVID
‑
19高危人群和易感个体至关重要。
[0003][0004]然而现有技术中，没有与COVID
‑
19易感性相关的遗传变异的报 道，也没有相关的检测试剂盒和检测方法。因此，本领域急需进一步 寻找COVID
‑
19易感性基因，开发检测COVID
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19高危人群和易感个 体的方法、试剂盒以及相关的治疗药物。

技术实现思路
r/>[0005]为解决上述技术问题，本专利技术公开了一种用于检测COVID
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19易 感性的分子标记、试剂盒及应用。具体地通过检测体外样品中是否含 有ABO基因中的单核苷酸多态性，能够实现对于COVID
‑
19高危人 群及易感人群的早期诊断、筛查和对于COVID
‑
19的有效防控。
[0006]为实现上述目的，本专利技术公开了一种用于检测COVID
‑
19易感性 的分子标记，其特征在于：在ABO基因序列的第1007位存在一个 SNP位点，其中，脱氧核苷酸由T变为TC。
[0007]本专利技术公开技术方案的其中一个技术目的是上述分子标记在制 备用于检测COVID
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19易感性的试剂盒中的应用。
[0008]进一步地，一种用于检测COVID
‑
19易感性的试剂盒，所述试剂 盒包括SEQ ID No：2和SEQ ID No：3所示的用于扩增ABO基因的 特异性引物。
[0009]进一步地，所述试剂盒还包括PCR反应液，所述PCR反应液由 Taq酶、Buffer、dNTP、Mg
2+
和双蒸水组成。
[0010]进一步地，所述特异性引物对ABO基因扩增后所得产物长度为 250～2010bp。
[0011]本专利技术公开技术方案的另一个技术目的是一种检测体外样品是 否存在基因单核苷酸多态性的方法，它包括如下检测过程：
[0012]采用特异性引物SEQ ID No：2和SEQ ID No：3扩增样品的ABO 基因，得到扩增产物，对所述扩增产物进行序列测定，当ABO基因 序列的第1007位存在一个SNP位点，且脱氧核苷酸由T变为TC时， 则为突变ABO基因，仍是T时为正常基因。
[0013]进一步地，采用PCR扩增技术对样品进行扩增，且PCR扩增条 件为，94℃:4分钟，94
℃:30秒
×
35次循环，60℃:30秒
×
35次循环， 72℃:1分钟
×
35次循环，72℃延伸5分钟。
[0014]进一步地，所述样品包括血液、唾液、肺泡冲洗液等。
[0015]本专利技术公开技术方案的余下技术目的是是对个体COVID易感性 或患病风险进行检测或诊断的方法，它包括如下步骤：
[0016](1)提取受试者血液DNA，应用上述检测试剂盒进行PCR反 应，并将产物进行测序，其中，测序引物使用SEQ ID No：2或SEQID No：3。
[0017](2)比对测序结果，若出现SEQ ID No：1中1007T>TC的SNP 位点，说明该受试者为COVID
‑
19易感染对象，应提醒该受试者严格 注意防护，减少公众场合活动，避免感染，并优先进行疫苗接种；若 未出现上述中的任意一种，说明该受试者不是COVID
‑
19易感染对象。
[0018]检验原理：
[0019]SNP是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列 多态性。通过大数据分析研究表明，本专利技术中SEQ ID No：1中的1007 T>TC位点与新冠肺炎疾病严重程度呈显著相关性，这可能是因为单 个氨基酸的改变或突变，进一步导致蛋白质表达异常或结构异常，进 而导致相应蛋白质功能异常，影响个体的免疫系统或影响机体不能及 时有效清除SARS
‑
Cov
‑
2，最终使得机体感染病毒并发病。
[0020]有益效果：
[0021]1、本专利技术设计了一种分子标记及试剂盒，能实现对于COVID
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19 高危人群及易感人群的早期诊断和筛查，对于实现COVID
‑
19的有效 防控具备重要意义；
[0022]2、本专利技术设计的检测方法操作简单，且检测过程快速，准确度 也较高，适合对COVID
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19高危人群及易感人群的早期筛查。
附图说明
[0023]图1为新冠肺炎患者人群中9q34.2位点的Regional plot图。
具体实施方式
[0024]术语解释
[0025]SNP：单核苷酸多态性，主要是指在基因组水平上由单个核苷酸 的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见 的一种，占所有已知多态性的90％以上。SNP在人类基因组中广泛 存在，平均每300个碱基对中就有1个，估计其总数可达300万个甚 至更多。SNP是一种二态的标记，由单个碱基的转换或颠换所引起， 也可由碱基的插入或缺失所致。SNP既可能在基因序列内，也可能在 基因以外的非编码序列上。
[0026]本专利技术的专利技术人经过广泛深入而深入的研究，通过对多中心大样 本数据的整合分析，对大量候选基因的SNP进行分析和筛选，首次 发现ABO基因SNP位点与COVID
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19易感性密切相关，可作为 COVID
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19易感性检测或早期诊断的分子标记。因此，本专利技术提供了 一种用于检测COVID
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19易感性的分子标记、试剂盒及应用。
[0027]为更好的解释本专利技术技术方案，以下结合具体实施例进行详细说 明。
[0028]实施例1 ABO基因突变的检测及其与COVID
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19感染的相关性 分本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于检测COVID
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19易感性的分子标记，其特征在于，在ABO基因序列的第1007位存在一个SNP位点，其中，脱氧核苷酸由T变为TC。2.一种权利要求1所述分子标记在制备用于检测COVID
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19易感性的试剂盒中的应用。3.一种用于检测COVID
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19易感性的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括SEQ ID No：2和SEQ ID No：3所示的用于扩增ABO基因的特异性引物。4.根据权利要求3所述用于检测COVID
‑
19易感性的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括PCR反应液，所述PCR反应液由Taq酶、Buffer、dNTP、Mg
2+
和双蒸水组成。5.根据权利要求3或4所述用于检测COVID
‑
19易感性的试剂盒，其特征在于，所述特异性引物对ABO基因扩增后...

【专利技术属性】
技术研发人员：马丁，吴鹏，丁文成，邬堂春，王超龙，王志杰，
申请(专利权)人：华中科技大学同济医学院附属同济医院，
类型：发明
国别省市：