一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型制造技术

技术编号:30560212 阅读:22 留言:0更新日期:2021-10-30 13:42
本发明专利技术公开了一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型。本发明专利技术通过运用RNA测序、套索算法(LASSO)和二分类Logistic回归获得与细胞周期通路状态高度相关的ncRNA,并构建评分score,进而通过受试者工作曲线(ROC)分析得到肺腺癌中score相应的截断值,可用于预测肺腺癌细胞周期通路相关基因突变。本发明专利技术的预测模型经验证在应用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变中具有灵敏度高,特异性强的优点,具有较好的应用前景。用前景。用前景。

【技术实现步骤摘要】
一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型


[0001]本专利技术涉及一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型,属于分子诊断


技术介绍

[0002]据国际顶级医学期刊CA(A Cancer Journal for Clinicians)报导,肺癌是全球范围内癌症患者的首要死因以及男性中最常见的恶性肿瘤。作为肺癌中最常见的病理亚型,肺腺癌占肺癌病例的40%以上。尽管手术是目前治疗肺腺癌的首要方法,相当一部分患者还需辅助使用放化疗及靶向、免疫治疗等综合治疗措施。近年来,针对肺腺癌常见基因突变的研究使得各种靶向治疗药物逐步上市,其临床应用显著提高了肺腺癌患者的生存期,而对患者用药临床获益的预测和评估很大程度上取决于患者某些特定基因的突变状态。
[0003]细胞分裂是个体生长发育必不可少的生物学过程之一,其正常运作依赖于多个基因的协调配合。不同于正常细胞,肿瘤细胞能够脱离细胞周期轨道进行不受控制的细胞分裂,进而促进癌细胞的侵袭和转移。鉴于异常细胞周期对于肿瘤发生及进展的重要性,其相本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因CDKN2A/CCND1/CCNE1/CDK4/RB1突变的ncRNA,其特征在于,包括TPTEP1,LINC00885,MIR663AHG,HOTAIR,RPSAP56,SNRPCP1,C5orf17,MIR561,THAP5P1,USP32P3,PTCHD3P2,LINC00887,LINC00565,RN7SKP106,AP000351.13,TARDBPP2,HILS1,CCT6P2,GSTA8P,HK2P1,ZEB2P1,WASIR1,ERVWE2,C7orf69,LINC01475,CEP57L1P1,LINC01551,DDX11L16,TRIM53AP,SDAD1P2,AC104131.1,LINC00485,LINC00710,CYP1D1P和ANKRD30BP2。2.一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因CDKN2A/CCND1/CCNE1/CDK4/RB1突变的预测模型,其特征在于,该预测模型为:score=(

1.4038
×
TPTEP1)+(0.7367
×
LINC00885)+(

0.9344
×
MIR663AHG)+(

1.3793
×
HOTAIR)+(

2.8758
×
RPSAP56)+(

1.3070
×
SNRPCP1)+(

1.1742
×
C5orf17)+(

2.2295
×
MIR561)+(1.8387
×
THAP5P1)+(2.3643
×
USP32P3)+(1.9552
×
PTCHD3P2)+(0.7483
×
LINC00887)+(2.1776
×
LINC00565)+(

【专利技术属性】
技术研发人员:单光耀毕国澍卞赟艺詹成范虹
申请(专利权)人:复旦大学附属中山医院
类型:发明
国别省市:

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