基于MRM的植物组蛋白变体H3.3的定量检测方法技术

本发明专利技术公开了一种基于MRM的植物组蛋白变体H3.3的定量检测方法，属于化学检测技术领域。所述定量检测方法包括：鉴定组蛋白变体H3.3K27

【技术实现步骤摘要】
基于MRM的植物组蛋白变体H3.3的定量检测方法


[0001]本专利技术涉及化学检测领域，特别是涉及一种基于MRM的植物组蛋白变体H3.3的定量检测方法。

技术介绍

[0002]组蛋白作为染色质的组成部分，其翻译后修饰对染色质的结构和功能起到重要的调控作用。通常认为真核生物染色质的基本单元是核小体，核小体由含147个碱基对的DNA缠绕组蛋白八聚体(由四种组蛋白H2A、H2B、H3和H4组装而成)构成，核小体之间通过组蛋白H1连接逐步形成其高级结构。除了常规的四种组蛋白外，还包括许多组蛋白的变体，组蛋白不同变体可能携带完全不同的生物学信息，例如组蛋白H3.3主要与转录激活相关。组蛋白变体和其修饰也共同参与染色质的表观遗传。现有报道发现H3氨基尾端(1
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40aa)几乎所有的赖氨酸和精氨酸上均可发生翻译后修饰，特别是甲基化和乙酰化修饰。关于组蛋白H3.3的功能以及对植物生长发育的影响研究越来越受到重视。H3.3在愈伤组织形成过程中涉及到细胞命运的转变以及表观遗传重编程。H3.3甲基化修饰对愈伤组织形成，进而对植物的生长发育具有重要本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基于MRM的植物组蛋白变体H3.3的定量检测方法，其特征在于，鉴定组蛋白变体H3.3 K27
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R40不同形式修饰的肽段，并合成组蛋白变体H3.3 K27
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R40不同形式修饰的标准肽段，利用质谱多反应监测技术对所述标准肽段进行质谱定量条件优化，以实现对植物组蛋白变体H3.3 K27
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R40不同形式修饰的肽段的定量检测。2.如权利要求1所述的基于MRM的组蛋白变体H3.3的定量检测方法，其特征在于，具体包括以下步骤：步骤1：提取植物体内组蛋白，通过组蛋白胶内衍生化反应及酶解，获取组蛋白H3的不同变体；步骤2：利用HPLC/MS/MS鉴定组蛋白H3变体H3.3 K27
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R40不同形式修饰的肽段，并挑选出可用于质谱多反应监测分析用的肽段样品；步骤3：合成组蛋白变体H3.3 K27
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R40不同形式修饰的标准肽段，筛选特异的母子离子对；步骤4：利用质谱多反应监测技术对所述标准肽段进行质谱优化，然后利用优化条件定量检测植物样本中组蛋白变体H3.3 K27
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R40...

【专利技术属性】
技术研发人员：胡亚君，金红，
申请(专利权)人：上海市口腔医院上海市口腔健康中心，
类型：发明
国别省市：