一种金针菇二维码分子鉴定方法技术

技术编号:30499658 阅读:26 留言:0更新日期:2021-10-27 22:31
本发明专利技术公开了一种金针菇二维码分子鉴定方法,包括(1)提取金针菇基因组DNA,获得多态性片段;(2)将多态性片段按照分子量大小的顺序进行梯度排列,以阿拉伯数字1

【技术实现步骤摘要】
一种金针菇二维码分子鉴定方法


[0001]本专利技术属于金针菇分子鉴定
,具体涉及一种金针菇二维码分子鉴定方法。

技术介绍

[0002]金针菇(Flammulina filiformis)是一种普遍栽培的食用菌,通常分为白色和黄色品种。其栽培历史悠久,生产总量逐年提升,目前已成为我国工厂化食用菌企业中发展速度最快、规模最大的一个品种。我国工厂化栽培金针菇的日产量约占我国食用菌工厂化总产量的47.12%。金针菇营养丰富、味道鲜美且兼具药用价值,不仅富含蛋白质、矿物质和维生素等各种营养成分,而且具有抗肿瘤、增强免疫调节、抗病毒、降血脂、抗疲劳和护肝等多种药用保健作用,深受消费者喜爱。
[0003]品种是决定金针菇产量和品质的内在因素,优质菌种在金针菇单产和质量中的贡献率举足轻重。近年来,尽管金针菇的产量和农艺性状都有了较大的进步,但栽培菌种多样性低导致的产品同质化问题日益突出,一些自主选育的品种由于缺乏高效、精准、直观的鉴定技术而得不到有效保护。上述现象不仅影响了企业的经济效益,也打击了食用菌育种工作者的信心。
[0004]SSR分子标记是一种共显性标记,具有遗传方式简单、操作简便、多态性好、重复性好、稳定可靠、检测遗传变异的能力强等特点,被广泛应用于食用菌的遗传作图构建、基因型鉴定与品种保护、种子纯度鉴定和种质保护、多样性研究、基因和QTL定位分析、系谱分析和分子标记辅助选择育种等研究领域。随着SSR技术的出现以及指纹鉴定技术的日益完善,构建食用菌品种分子身份证,为品种的区别、鉴定和对比提供了方便

技术实现思路

[0005]本部分的目的在于概述本专利技术的实施例的一些方面以及简要介绍一些较佳实施例。在本部分以及本申请的说明书摘要和专利技术名称中可能会做些简化或省略以避免使本部分、说明书摘要和专利技术名称的目的模糊,而这种简化或省略不能用于限制本专利技术的范围。
[0006]本专利技术提供一种金针菇二维码分子鉴定方法,其特征在于:
[0007](1)提取金针菇基因组DNA,分别利用金针菇SSR标记核心引物进行PCR 扩增,将扩增产物进行毛细管电泳分析,并读取条带大小数据,获得多态性片段;
[0008](2)将多态性片段按照分子量大小的顺序进行梯度排列,以阿拉伯数字和字母进行编码;
[0009](3)统计SSR核心引物对应的特异性等位基因在其相应的多态性片段中的排名,并以排名进行编号,获得分子指纹码;每组核心引物对应2个编码;
[0010](4)将品种来源地域信息、子实体性状信息和栽培类型信息,分别进行编码后,与分子指纹码共同组成金针菇分子身份证号,最后,将数字和字母编码的金针菇分子身份证号转换为二维码。
[0011]作为本专利技术所述的金针菇二维码分子鉴定方法:所述金针菇SSR标记核心引物,分别为:
[0012]SSR1:F:TCTGAATGTCCCGGAGCGT
[0013]R:GATACGAGCAGCACTCGCG
[0014]SSR2:F:TCTTCTTGGGTGGAAGACG
[0015]R:CTGAGCTAGGTTCCTCTAC
[0016]SSR3:F:CGTGCGCGTTACAATCCAT
[0017]R:TAGGCCCCCCAAGAAACAT
[0018]SSR4:F:GAAGGTGTGTTCGCTGTTC
[0019]R:CATTGGAGTGGGTAAAGAG
[0020]SSR5:F:CCTAATGGCGTTCAGCCAA
[0021]R:CTCTGAATCGGATGCCTTC
[0022]SSR6:F:GTCTTTCGCGCAGGTT
[0023]R:TGAGGGGACGGGTATGAGA
[0024]SSR7:F:TCTTCCTGTCACCACTGTTT
[0025]R:CGTCTCGACCATCGTTGGA
[0026]SSR8:F:CATGGATGTTGACGGGAA
[0027]R:CTGGAACGGTGGTAGACTCTC
[0028]SSR9:F:CTCCCAGCTTCAGGATACCT
[0029]R:GGTATGAGATGGAATCGCGA
[0030]SSR10:F:GGTGCACGCTCCTAAACCTA
[0031]R:CTTGTCGAGGAAGATCCATG
[0032]SSR11:F:AGTGATGACGAGGACAGTGA
[0033]R:CCTTCCTCCTCCATAGCAAA
[0034]SSR12:F:ATGCGGCGGTTTGTCAGAAC
[0035]R:AACCACAACCTTCCTTCCCC
[0036]SSR14:F:CAGATGATGCTGCAATGCTC
[0037]R:CTTTGTGGCACTATCTGCTG
[0038]SSR16:F:AGACCCAACACCGGACATAT
[0039]R:GGTTAGGGATGTGACGCGGT
[0040]SSR17:F:CCCAGATGATGCTGCAATGC
[0041]R:CGCTTTGTGGCACTATCTGC
[0042]SSR18:F:AAAAATTGAGAGGGTGCATG
[0043]R:TTGGACGAATCCTCGTTGCG
[0044]SSR19:F:GGTACGCTAATCCGCTTGTT
[0045]R:CGTCACTCGTGTAAGTCAAT
[0046]SSR20:F:AAATGAACGTCGAGTGATTC
[0047]R:GACGAGTCAATCCATCCACT。
[0048]作为本专利技术所述的金针菇二维码分子鉴定方法的一种优选方案:所述子实体性状
信息,为金针菇菇盖和菇柄的颜色信息。
[0049]作为本专利技术所述的金针菇二维码分子鉴定方法的一种优选方案:所述栽培类型,包括自主选育、常规栽培、工厂化栽培、野外采集。
[0050]作为本专利技术所述的金针菇二维码分子鉴定方法的一种优选方案:所述以阿拉伯数字和字母进行编码,为以阿拉伯数字1

9进行编码,9以上排名以字母 A

Z进行编码。
[0051]本专利技术的有益效果:本专利技术金针菇二维码分子鉴定方法,该方法筛选了18 对具有代表性的SSR核心引物,并以此为基础进行金针菇二维码分子身份证的构建,同时,该方法融合了品种来源地域信息、子实体颜色性状信息和栽培类型信息,最终构建获得了二维码化的真姬菇分子身份证,这些产品身份证可以有效区分不同品种的金针菇,尤其对子实体外观近似产品的区分能力强。二维码化的分子身份证能够通过信息终端直接读取,为金针菇种质的科学化鉴别和标准化管理提供便利。
附图说明
[0052]为了更清楚地说明本专利技术实施例的技术方案,本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种金针菇二维码分子鉴定方法,其特征在于:(1)提取金针菇基因组DNA,分别利用金针菇SSR标记核心引物进行PCR扩增,将扩增产物进行毛细管电泳分析,并读取条带大小数据,获得多态性片段;(2)将多态性片段按照分子量大小的顺序进行梯度排列,以阿拉伯数字和字母进行编码;(3)统计SSR核心引物对应的特异性等位基因在其相应的多态性片段中的排名,并以排名进行编号,获得分子指纹码;每组核心引物对应2个编码;(4)将品种来源地域信息、子实体性状信息和栽培类型信息,分别进行编码后,与分子指纹码共同组成金针菇分子身份证号,最后,将数字和字母编码的金针菇分子身份证号转换为二维码。2.如权利要求1所述的金针菇二维码分子鉴定方法,其特征在于:所述金针菇SSR标记核心引物,分别为:SSR1:F:TCTGAATGTCCCGGAGCGT;R:GATACGAGCAGCACTCGCG;SSR2:F:TCTTCTTGGGTGGAAGACG;R:CTGAGCTAGGTTCCTCTAC;SSR3:F:CGTGCGCGTTACAATCCAT;R:TAGGCCCCCCAAGAAACAT;SSR4:F:GAAGGTGTGTTCGCTGTTC;R:CATTGGAGTGGGTAAAGAG;SSR5:F:CCTAATGGCGTTCAGCCAA;R:CTCTGAATCGGATGCCTTC;SSR6:F:GTCTTTCGCGCAGGTT;R:TGAGGGGACGGGTATGAGA;SSR7:F:TCTTCCTGTCACCACTGTTT;R:CGTCTCGACCATCGTTGGA;SSR8:F:CATGGATGTTGACGGGAA;R:CTGGAACGGTGGTAGACTCTC;SSR9:F:CTCCCAGCT...

【专利技术属性】
技术研发人员:吴莹莹王瑞娟李燕陆欢鲍大鹏尚晓冬
申请(专利权)人:上海市农业科学院
类型:发明
国别省市:

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