一种蚌类环境DNA宏条形码引物、鉴定方法及应用技术

本发明专利技术具体涉及一种蚌类环境DNA宏条形码引物、鉴定方法及应用，属于分子生态学领域。本发明专利技术公开一种蚌类环境DNA宏条形码引物，所述引物的名称为16SPP300或者16SPP147；其中，引物16SPP300由SEQ ID NO：1所示上游引物和SEQ ID NO：2所示下游引物组成；引物16SPP147由SEQ ID NO：3所示上游引物和SEQ ID NO：4所示下游引物组成。本发明专利技术还公开一种用于蚌类群落结构研究的环境DNA宏条形码鉴定方法和应用。本发明专利技术方法可补充传统调查方法中难采到、濒危的蚌类动物丰度数据，且能鉴定雄性蚌类物种，有效提高了蚌类的鉴定水平、物种检测率及丰度评估准确度，是有效、可靠的蚌类群落结构调查新方法，具有实用价值。具有实用价值。具有实用价值。

【技术实现步骤摘要】
一种蚌类环境DNA宏条形码引物、鉴定方法及应用


[0001]本专利技术涉及分子生态学领域，具体涉及一种蚌类环境DNA宏条形码引物、鉴定方法及应用。

技术介绍

[0002]蚌类属软体动物门(Mollusca)、双壳纲(Bivalvia)、蚌目(Unionoida)，广泛分布于北美、欧亚大陆、中美洲、非洲和东南亚。蚌类是大型底栖动物，是生态系统中最重要的生物类群之一。作为食物链的一部分它们是小型动物如底层鱼类和一些鸟类的食物。作为滤食者，它们通过滤食营养物质、有机物和浮游生物来保持水质。它们在食物网中处于非常关键的位置，如果湖泊或是河流中的淡水双壳类消失将会引起一系列的生态问题。在最近的几十年中，全球蚌类种群密度和种类丰富程度等存在明显的下降，一些物种数量减少的速度超出了种群自我恢复能力的范围，以致一些物种濒临灭绝甚至灭绝。进入90年代全球范围内蚌类种群明显呈衰退趋势，且有学者认为蚌类是目前最受威胁的淡水生物类群。IUCN濒危物种红色名录显示，蚌类是所有动物类群中灭绝数目最多的一类(Version 2019
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种蚌类环境DNA宏条形码引物，其特征在于，所述引物的名称为16SPP300或者16SPP147；其中，引物16SPP300由SEQ ID NO：1所示上游引物和SEQ ID NO：2所示下游引物组成；引物16SPP147由SEQ ID NO：3所示上游引物和SEQ ID NO：4所示下游引物组成。2.根据权利要求1所述的蚌类环境DNA宏条形码引物，其特征在于，所述引物的名称为16SPP147，其由SEQ ID NO：3所示上游引物和SEQ ID NO：4所示下游引物组成。3.一种用于蚌类群落结构研究的环境DNA宏条形码鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤(1)：蚌类环境DNA宏条形码引物的筛选，得到权利要求2所述的引物；步骤(2)：蚌类环境DNA宏条形码数据库构建；步骤(3)：根据蚌类群落所在水域的大小，设计采样点，采集水样；步骤(4)：将水样进行处理后，提取其中的总环境DNA；步骤(5)：将总环境DNA用步骤(1)筛选的引物进行PCR扩增；步骤(6)：高通量测序，OUT聚类与注释；步骤(7)：确定待测水域中蚌类的物种组成和群落结构。4.根据权利要求3所述的用于蚌类群落结构研究的环境DNA宏条形码鉴定方法，其特征在于，步骤(2)所述蚌类环境DNA宏条形码数据库构建包括以下过程：在GenBank数据库上下载中国蚌类的线粒体基因组序列，包括母系和父系，若没有线粒体基因组序列的就下载16SrRNA线粒体片段，如果这两种都无，则提取该蚌的组织DNA，并进行线粒体基因组序列测序。5.根据权利要求3所述的用于蚌类群落结构研究的环境DNA宏条形码鉴定方法，其特征在于，步骤(3)所述水样采集的方法为：设置采样点，使用采水器在水下0.5
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1m处采集1L水样，做3次生物学重复，水样低温保存于无菌的广口瓶；和/或步骤(3)所述水域为鄱阳湖水域，鄱阳湖水域选自鄱阳湖通江水道、鄱阳湖主湖区、军山湖和青岚湖中至少一处。6.根据权利要求3所述的用于蚌类群落结构研究的环境DNA宏条形码鉴定方法，其特征在于，步骤(4)中的水样处理方法为在24小时...

【专利技术属性】
技术研发人员：周春花，陈金萍，吴小平，黄晓晨，欧阳珊，
申请(专利权)人：南昌大学，
类型：发明
国别省市：