双特异性胞外基质结合肽及其使用方法技术

公开了与可靶向并归巢至癌症、肿瘤和胞外基质的肽相关的组合物、化合物和方法。这基于发现可与纤连蛋白额外结构域B(FN

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】双特异性胞外基质结合肽及其使用方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求2019年2月4日提交的美国临时申请No.62/800,879的权益和优先权，其在此通过引用整体并入。
[0003]序列表的引用
[0004]根据37 C.F.R.
§
1.52(e)(5)，在此通过引用并入2020年2月4日提交的序列表，所述序列表是命名为“TARTU_100_PCT_ST25.txt”的文本文件，其创建于2020年1月6日，并且大小为19,915字节。


[0005]本专利技术一般性地涉及分子医学、癌症治疗领域，并且更具体地，涉及细胞和组织靶向肽。

技术介绍

[0006]靶向具有亲和配体的抗癌药物(例如抗体和归巢肽(homing peptide))被广泛用于在提高肿瘤部位处的药物浓度和降低全身性暴露之间实现平衡(Kennedy et al.，Pharmacol.Ther.(2017)，doi：10.1016/j.pharmthera.2017.03.004；Ruoslahti，Adv.Drug Deliv.Rev.(2016)，doi：10.1016/j.addr.2016.03.008)。特别地，抗体药物缀合物(antibody drug conjugate，ADC)已取得临床成功，其中临床上批准4种ADC，并且＞100种处于临床测试的不同阶段(Lambert and Morris，Adv.Ther.，1
‑
21(2017))。然而，抗体的制备昂贵并且由于大尺寸和高亲和力的组合而表现出差的组织渗透(Carter and Lazar，Nat.Rev.Drug Discov.17：197
‑
223(2018))。体内肽噬菌体展示(不可知论的探索性技术)已被用于探测活体动物的血管异质性和鉴定肿瘤归巢肽(Teesalu et al.，Methods Enzymol.503：35
‑
56(2012))。由于用于体内展示的噬菌体本身是纳米粒，因此该肽特别良好地适合于递送纳米粒载荷(Ruoslahti，Adv.Drug Deliv.Rev.(2016)，doi：10.1016/j.addr.2016.03.008)。归巢肽靶分子(受体)包含不同的细胞表面分子：例如αv
‑
整联蛋白、NRP
‑
1、叶酸受体α、EphA2，以及在肿瘤和基质细胞表面上异常表达的分子，例如p32、核仁蛋白(nucleolin)和钙网蛋白(calreticulin)；血凝块和肿瘤胞外基质的组分(Willmore et al.，Nanoscale.8：9096
‑
9101(2016)；Sugahara et al.，Cancer Cell.16：510
‑
520(2009)；Paasonen et al.，ChemBioChem.17，570
‑
575(2016)；Christian et al.，J.Cell Biol.163：871
‑
878(2003)；Xing et al.，Sci.Rep.8：8426(2018)；Simberg et al.，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.104：932
‑
6(2007)；Mitra et al.，Biochemistry.49：6687
‑
6695(2010))。
[0007]在肿瘤微环境中过表达的一些ECM蛋白(例如，骨膜蛋白(periostin)、透明质酸、某些胶原蛋白、层黏连蛋白、串珠蛋白聚糖(perlecan)、纤连蛋白和生腱蛋白)可提供比在细胞表面上表达的抗原更稳健的靶标用于亲和递送(Pharmacol Rev.61：198
‑
223(2009))。选择性剪接的纤连蛋白额外结构域
‑
B(fibronectin Extra Domain
‑
B，
FN
‑
EDB)和腱生蛋白
‑
C(Tenascin
‑
C，TNC)在许多实体瘤中过表达(Silacci et al.，Protein Eng.Des.Sel.19：471
‑
478(2006)；Camemolla et al.，Am.J.Pathol.154：1345
‑
52(1999)；Park et al.，J.Control.Release.163：111
‑
118(2012))。TNC同种型C(TNC
‑
C)在非恶性组织中表现出特别低的基线表达，并且在实体瘤例如恶性脑肿瘤和肺癌中表现出稳健的上凋(Silacci et al.，Protein Eng.Des.Sel.19：471
‑
478(2006)；Carnemolla et al.，Am.J.Pathol.154：1345
‑
52(1999))。FN
‑
EDB和TNC抗体(例如，FN
‑
EDB ScFV L19、TNC
‑
C ScFV G11、F16和81C6)可用作细胞因子(例如，IL2、TNF)和放射性核素的导向模块(Kumra and Reinhardt，Adv.Drug Deliv.Rev.97：101
‑
110(2016)；Spenl
éꢀ
et al.，Cell Adh.Migr.9：141
‑
53(2015))。另外，这些抗体已被评价为在恶性原发性和转移性脑肿瘤以及头颈部鳞状细胞癌中用于免疫
‑
PET、SPECT/CT和放射免疫治疗(radioimmunotherapy，RIT)的诊断性显像剂(Kumra and Reinhardt，Adv.Drug Deliv.Rev.97：101
‑
110(2016)；Spenl
éꢀ
et al.，Cell Adh.Migr.9：141
‑
53(2015)；Akabani et al.，J.Nucl.Med.46：1042
‑
1051(2005))。重要的是，最近的研究表明，ECM导向的非内化抗体可用于增强胞内作用细胞毒性药物的细胞毒活性(Dal Corso et al.，J.Control.Release.264：211
‑
218(2017))。
[0008]然而，已证明靶向FN
‑
EDB和TNC
‑
C是困难的。因此，需要用于靶向FN
‑
EDB、TNC
‑
C、或FN
‑
EDB和TNC
‑
C二者的组合物和治疗剂。
[0009]本专利技术的目的是提供用于靶向FN<本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.分离的肽，其包含含有以下的氨基酸序列：序列PPRRGLIKLKTS(SEQ ID NO：1)或者序列PPRRGLIKLKTS(SEQ ID NO：1)的变体，所述变体具有一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个或十个氨基酸替换，其中第6位保留亮氨酸并且第11位保留苏氨酸。2.权利要求1所述的肽，其中所述氨基酸序列包含序列PPRRGLIKLKTS(SEQ ID NO：1)或序列PPRRGLIKLKTS(SEQ ID NO：1)的变体，所述变体与序列PPRRGLIKLKTS(SEQ ID NO：1)具有至少50％、58％、66％、75％、83％或91％序列同一性。3.权利要求1或2所述的肽，其中所述氨基酸序列包含式X1‑
X2‑
X3‑
X4‑
X5‑
X6‑
X7‑
X8‑
X9‑
X
10
‑
X
11
‑
X
12
，其中X6是亮氨酸，其中X7是异亮氨酸、亮氨酸或缬氨酸，其中X9是亮氨酸、异亮氨酸或缬氨酸，其中X
11
是苏氨酸，并且其中X1、X2、X3、X4、X5、X8、X
10
和X
12
各自独立地是任何氨基酸，任选地，其中X1是脯氨酸、甘氨酸、丙氨酸、丝氨酸或天冬酰胺，其中X2是脯氨酸、甘氨酸、丙氨酸、丝氨酸或天冬酰胺，并且其中X5是甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸或异亮氨酸，任选地，其中X7是异亮氨酸并且其中X9是亮氨酸，任选地，其中X2是脯氨酸，任选地，其中X3是精氨酸、赖氨酸、组氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、天冬氨酸、天冬酰胺或丙氨酸，其中X4是精氨酸、赖氨酸、组氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、天冬氨酸、天冬酰胺或丙氨酸，其中X8是丙氨酸、赖氨酸、组氨酸、精氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、酪氨酸或色氨酸，其中X
10
是丙氨酸、赖氨酸、组氨酸、精氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、酪氨酸或色氨酸，并且其中X
12
是丝氨酸、丙氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、苏氨酸、谷氨酰胺、天冬氨酸、或脯氨酸，并且优选地，其中X1是脯氨酸、甘氨酸或丙氨酸，其中X3是精氨酸、赖氨酸或组氨酸，其中X4是精氨酸、赖氨酸或组氨酸，其中X5是甘氨酸、丙氨酸或缬氨酸，其中X8是丙氨酸、赖氨酸、组氨酸或精氨酸，其中X
10
是丙氨酸、赖氨酸、组氨酸或精氨酸，并且其中X
12
是丝氨酸、丙氨酸、甘氨酸、天冬酰胺或苏氨酸。4.权利要求1至3中任一项所述的肽，其中所述氨基酸序列包含序列PPRRGLIKLKTS(SEQ ID NO：1)或PPRRGLIKLKTSSNTKENSVVASLRP(SEQ IDNO：2)。5.分离的肽，其包含含有以下的氨基酸序列：序列TSKQNSR(SEQ ID NO：3)或者序列TSKQNSR(SEQ ID NO：3)的变体，所述变体具有一个、两个、三个、四个、五个或六个氨基酸替换，其中第7位保留精氨酸和/或第6位保留丝氨酸。6.权利要求5所述的肽，其中所述氨基酸序列包含序列TSKQNSR(SEQ ID NO：3)或序列TSKQNSR(SEQ ID NO：3)的变体，所述变体与序列TSKQNSR(SEQ ID NO：3)具有至少14％、28％、42％、57％、71％或85％序列同一性。7.权利要求5或6所述的肽，其中所述氨基酸序列包含式X
13
‑
X
14
‑
X
15
‑
X
16
‑
X
17
‑
X
18
‑
X
19
，其中X
19
是精氨酸、赖氨酸、组氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、天冬氨酸、天冬酰胺或丙氨酸，其中X
18
是丝氨酸、丙氨酸、甘氨酸、天冬酰胺或苏氨酸，并且其中X
13
、X
14
、X
15
、X
16
和X
17
各自独立地是任何氨基酸，任选地，其中X
16
是谷氨酰胺、天冬酰胺、谷氨酸、丝氨酸、苏氨酸、天冬氨酸、精氨酸、赖氨酸、组氨酸、丙氨酸或甘氨酸，其中X
14
是丝氨酸、天冬酰胺、丙氨酸、甘氨酸、谷氨酰胺、苏氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、精氨酸、赖氨酸或组氨酸，并且其中X
15
是赖氨酸、精氨酸、组氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、天冬氨酸、天冬酰胺或丙氨酸，
任选地，其中X
17
是天冬酰胺、丝氨酸、苏氨酸、谷氨酰胺、天冬氨酸、丙氨酸、甘氨酸、精氨酸、缬氨酸、谷氨酸、酪氨酸、色氨酸或赖氨酸，并且其中X
13
是苏氨酸、天冬酰胺、丝氨酸、缬氨酸、丙氨酸、甘氨酸、酪氨酸、色氨酸、谷氨酰胺、异亮氨酸、亮氨酸、苯丙氨酸、赖氨酸或天冬氨酸，任选地，其中X
19
是精氨酸、赖氨酸或组氨酸，其中X
18
是丝氨酸或天冬酰胺，优选地，其中X
16
是谷氨酰胺、天冬酰胺、谷氨酸、丝氨酸、苏氨酸、天冬氨酸或精氨酸，其中X
14
是丝氨酸、天冬酰胺、丙氨酸、甘氨酸、谷氨酰胺、苏氨酸或天冬氨酸，并且其中X
15
是赖氨酸、精氨酸、组氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、天冬氨酸、天冬酰胺或丙氨酸，优选地，其中X
19
是精氨酸并且其中X
18
是丝氨酸，并且更优选地，其中X
16
是谷氨酰胺或天冬酰胺，其中X
14
是丝氨酸或天冬酰胺，并且其中X
15
是赖氨酸、精氨酸或组氨酸。8.权利要求5至7中任一项所述的肽，其中所述氨基酸序列包含序列TSKQNSR(SEQ ID NO：3)。9.分离的肽，其包含含有以下的氨基酸序列：序列AGRGRLVR(SEQ ID NO：4)或者序列AGRGRLVR(SEQ ID NO：4)的变体，所述变体具有一个、两个、三个、四个、五个、六个或七个氨基酸替换，其中第3位保留精氨酸，任选地(i)其中第6位保留亮氨酸和/或第8位保留精氨酸，或(ii)其中第6位保留亮氨酸、第8位保留精氨酸并且第5位保留精氨酸。10.权利要求9所述的肽，其中所述氨基酸序列包含序列AGRGRLVR(SEQ ID NO：4)或序列AGRGRLVR(SEQ ID NO：4)的变体，所述变体与序列AGRGRLVR(SEQ ID NO：4)具有至少25％、37％、50％、62％、75％或87％序列同一性。11.权利要求9或10所述的肽，其中所述氨基酸序列包含式X
20
‑
X
21
‑
X
22
‑
X
23
‑
X
24
‑
X
25
‑
X
26
‑
X
27
，其中X
22
是精氨酸、赖氨酸或组氨酸，其中X
25
是亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸或丙氨酸，其中X
27
是精氨酸、赖氨酸、组氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、天冬氨酸、天冬酰胺或丙氨酸，并且其中X
20
、X
21
、X
23
、X
24
和X
2...

【专利技术属性】
技术研发人员：坦贝特，
申请(专利权)人：塔图大学，
类型：发明
国别省市：