基因群作为共预后因子在肾癌预后检测中的应用制造技术

本发明专利技术公开了基因群作为共预后因子在肾癌预后检测中的应用，所述基因群为免疫相关基因AR、IL20RB、RNASE2、RORA、SLC11A1；其中所述AR、IL20RB、RNASE2、RORA、SLC11A1的表达水平用于提供肾癌的预后，指导治疗性干预。指导治疗性干预。指导治疗性干预。

【技术实现步骤摘要】
基因群作为共预后因子在肾癌预后检测中的应用


[0001]本专利技术涉及疾病诊断领域，更具体地，本专利技术涉及基因群作为共预后因子在 肾癌预后检测中的应用。

技术介绍

[0002]肾癌(Renal Cell Carcinoma，RCC)是泌尿系统最常见的恶性肿瘤之一，根据 组织学分型，肾癌分为多种亚型，其中肾透明细胞癌(Clear Cell Renal CellCarcinoma，ccRCC)是肾癌的主要亚型，约占肾癌的75
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80％(Pavlovich CP,SchmidtLS,Phillips JL.The genetic basis of renal cell carcinoma[J].Urol Clin North Am, 2003,30(3):437
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54,vii.)，其他类型包括乳头状癌、嫌色细胞癌、Bellini管(集合 管)癌等。肾透明细胞癌患者具有最高的死亡率和转移率，2018年全球约400,000 例肾透明细胞癌新发病例，并有175,000例死亡病例(Lindenberg L,Mena E, Choyke PL,et al.PET imaging in renal cancer[J].Curr OpinOncol,2019,31(3):216
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221.)。治疗肾透明细胞癌的最主要的方式是手术切除，但 是接受切除治疗的患者术后复发率高达40％以上(Rossi SH,Klatte T,Usher
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SmithJ,et al.Epidemiology and screening for renal cancer[J].World J Urol, 2018,36(9):1341
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1353.)。肾透明细胞癌早期无明显特征，且缺乏有效的诊断方法 和早期预警信号，约30％的患者初次就诊时癌症已经发生了远期转移，5年生存 率由90％下降到12％(Campbell S,Uzzo RG,Allaf ME,et al.Renal Mass andLocalized Renal Cancer:AUA Guideline[J].J Urol,2017,198(3):520
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529.)，对于这 些转移的晚期患者手术切除治疗难以满足治疗需要，且大部分肾透明细胞癌对放 疗和化疗也不敏感，仅靠手术切除和放射治疗等传统方式难以取得良好的治疗效 果。
[0003]肿瘤免疫疗法是继手术治疗、化疗、放疗、靶向治疗后的一种创新的癌症治 疗方法，其作用机制是通过激活体内的免疫细胞增强机体抗肿瘤免疫应答，特异 性地清除肿瘤微小残留病灶、抑制肿瘤生长，打破免疫耐受，达到控制和杀伤肿 瘤细胞的目的。传统的癌症治疗方法除了杀伤肿瘤细胞外，对机体的正常组织细 胞也会造成不必要的损害，影响患者的身体状况，且治疗效果也难以保证。随着 分子生物学、医学免疫学等学科的发展，肿瘤免疫治疗越来越成熟，已在黑色素 瘤、急性淋巴性白血病、肺癌等恶性肿瘤的治疗中取得了重大突破(Cuevas LM, Daud AI.Immunotherapy for melanoma[J].Semin Cutan MedSurg,2018,37(2):127
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131.)，肿瘤免疫疗法疗效较高、安全性强，与传统的癌症治 疗方法联合应用，可以提高手术、放疗和化疗的治疗效果及肿瘤患者的生存期， 显著改善患者的生活质量，为肿瘤患者带来新的希望。
[0004]肾癌是一种免疫原性较强的肿瘤，免疫原性使肾癌的免疫治疗前景广阔。虽 然免疫疗法在肾癌的治疗中已经取得了很大的进步，但并不是所有患者都可以从 中获益，存在部分患者对免疫检查点抑制剂治疗不响应，少部分患者应用药后不 久发生耐药，以及存在免疫相关的毒性等问题(Nowicki TS,Hu
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Lieskovan S, Ribas A.Mechanisms of Resistance to PD
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1 and PD
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L1 Blockade[J].Cancer J, 2018,24(1):47
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53.)。因此需
要开发新的有效的免疫治疗靶点，通过联合治疗等方 式增加疗效，减少副作用。随着下一代测序对肾癌基因组合免疫微环境的日益了 解，可以从肾癌基因组特征出发指导治疗选择，从而朝着精密医学发展，因此迫 切需要更好地了解该疾病地分子机制、免疫微环境，并且识别更好的预后生物标 志物和预测模型。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的是提供用于肾癌预后的生物标志物群、诊断产品、装置和设备。
[0006]为了实现上述目的，本专利技术第一方面提供了一种用于肾癌预后的生物标志物 群，所述生物标志物群包括AR、IL20RB、RNASE2、RORA和/或SLC11A1。
[0007]本专利技术第二方面提供了检测样本中本专利技术第一方面所述的生物标志物群的 试剂在制备肾癌预后的诊断产品中的应用。
[0008]进一步，所述试剂包括通过数字成像技术、蛋白免疫技术、染料技术、核酸 测序技术、核酸杂交技术、色谱技术、质谱技术检测样本中生物标志物表达水平 的试剂。
[0009]进一步，所述样本选自下组：外周血样本、血清样本、血浆样本、尿样本、 唾液样本和组织样本。
[0010]本专利技术的第三方面提供了一种肾癌预后的诊断产品，所述诊断产品包括检测 本专利技术第一方面所述的生物标志物群的试剂。
[0011]进一步，所述诊断产品包括芯片、试剂盒。
[0012]进一步，所述试剂包括检测所述生物标志物群基因转录的RNA的量的试剂。
[0013]进一步，所述试剂为检测所述生物标志物群转录的mRNA的量的试剂。
[0014]进一步，所述试剂为检测与所述基因转录的mRNA互补的cDNA的量的试 剂。
[0015]进一步，所述试剂包括探针或引物。
[0016]进一步，所述诊断产品还包括总RNA抽提试剂、逆转录试剂和/或二代测序 试剂。
[0017]进一步，所述试剂为检测所述生物标志物群基因编码的多肽/蛋白的量的试 剂。
[0018]进一步，所述试剂为抗体、抗体片段或者亲和性蛋白。
[0019]本专利技术第四方面提供了一种肾癌生存期预测装置，包括：
[0020]数据获取模块，用于获取待测癌症患者的本专利技术第一方面所述的生物标志物 群基因表达谱数据；
[0021]预测模块，用于将所述基因表达谱数据作为输入提供给训练好的预测模型， 所述预测模型被训练基于癌症患者的基因表达谱数据而对所述癌症患者的生存 期进行预测；
[0022]预测结果获取模块，用于获取所述预测模型的输出，得到待测癌症患者的生 存期预测结果。
[0023]进一步，所述预测模型为Cox回归模型。
[0024]进一步，所述Cox回归模型为LASSO Cox回归模型。
[0025]进一步，所述预测模型的公式为其本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于肾癌预后的生物标志物群，其特征在于，所述生物标志物群包括AR、IL20RB、RNASE2、RORA和/或SLC11A1。2.检测样本中权利要求1所述的生物标志物群的试剂在制备肾癌预后的诊断产品中的应用。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述试剂包括通过数字成像技术、蛋白免疫技术、染料技术、核酸测序技术、核酸杂交技术、色谱技术、质谱技术检测样本中生物标志物表达水平的试剂。4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述样本选自下组：外周血样本、血清样本、血浆样本、尿样本、唾液样本和组织样本。5.一种肾癌预后的诊断产品，其特征在于，所述诊断产品包括检测权利要求1所述的生物标志物群的试剂；优选地，所述诊断产品包括芯片、试剂盒。6.根据权利要5所述的诊断产品，其特征在于，所述试剂包括检测所述生物标志物群基因转录的RNA的量的试剂；优选地，所述试剂为检测所述生物标志物群转录的mRNA的量的试剂；优选地，所述试剂为检测与所述基因转录的mRNA互补的cDNA的量的试剂；优选地，所述试剂包括探针或引物；优选地，所述诊断产品还包括总RNA抽提试剂、逆转录试剂和/或二代测序试剂。7.根据权利要求5所述的诊断产品，其特征在于，所述试剂为检测所述生物标志物群基因编码的多肽/蛋白的量的试剂；优选地，所述试剂为抗体、抗体片段或者亲和性蛋白。8.一种肾癌生存期预测装置，其特征在于，包括：数据获取模块，用于获取待测癌症患者的权利要求1所述的生物标志物群基因表达谱数据；预测模块，用于将所述基因表达谱数据作为输入提供给训练好的预测模型，所述预测模型被训练基于癌症患者的基因表达谱数据而对所述癌症患者的生存期进行预测；预测结果获取模块，用于获取所述预测模型的输出，得到待测癌症患者的生存期预测结果；优选地，所述预测模型为Cox回归模型；优选地，所述Cox回归模型为LASSOCox回归模型；优选地，所述其中，N为用于预测预后的基因数，Expi为每个基因的表达水平，Ci为每个基因的回归系数；当风险评分较高时，患者预后不良；当风险评分...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨承刚，王丹，
申请(专利权)人：北京泱深生物信息技术有限公司，
类型：发明
国别省市：