【技术实现步骤摘要】
一组诊断食管癌的甲基化标志物
[0001]本专利技术涉及生物技术、生物医药领域,具体涉及一组诊断食管癌的甲基化标志物。
技术介绍
[0002]DNA甲基化是哺乳动物中研究最深入的表观遗传调控系统之一,并且这种共价表观遗传标记的编写、读取和维持模式已得到全面阐述。CpG岛(CpG island,CGI)是富含CpG二核苷酸的DNA序列的延伸,存在于大多数哺乳动物启动子区域,通过对这些位置DNA甲基化的研究初步分析了甲基化与基因表达的调控关系。CpG岛的甲基化通常会导致长期稳定的基因沉默,然而在相应的表观遗传研究手段发展之前,位于启动子区域以外的DNA甲基化模式在多种动态生物学过程中的研究十分缺乏。目前,全基因组甲基化谱的相关研究已全面揭示了增强子、基因体和部分甲基化区域中DNA甲基化的动态改变,表明其在个体发育和疾病过程中的调控作用。虽然已有研究普遍认为DNA甲基化是一种抑制性的表观遗传标记,但其介导的转录抑制的调控机制尚未完全阐明。部分研究表明,DNA甲基化介导的转录调控可能涉及其与序列特异性转录因子间的相互作用。
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【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种诊断食管癌的甲基化标志物组合,所述甲基化标志物组合包括以下至少一个甲基化位点:cg05446471、cg10085326、cg11926456、cg12126990、cg13480465、cg19310604、cg20473977、cg21041579、cg21553182、cg24276395、cg25724842、cg26033932;优选地,所述甲基化标志物组合是以下甲基化位点的组合:cg05446471、cg10085326、cg11926456、cg12126990、cg13480465、cg19310604、cg20473977、cg21041579、cg21553182、cg24276395、cg25724842和cg26033932。2.如权利要求1所述的甲基化标志物组合,其特征在于,所述甲基化位点在患者和健康者体内的甲基化程度是差异的。3.如权利要求2所述的甲基化标志物组合,其特征在于,所述差异的包括患者体内的甲基化程度是健康者的至少1倍,或者,患者体内的甲基化程度是健康者的10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%。4.如权利要求1所述的甲基化标志物组合,其特征在于,所述食管癌包括但不限于食管鳞癌、食管腺癌、食管淋巴瘤、食管平滑肌肉瘤和食管转移性癌;优选地,所述食管癌是食管鳞癌。5.一种食管癌诊断系统,所述食管癌诊断系统包括计算模块,所述计算模块是根据权利要求1所述的甲基化标志物组合中至少一个甲基化标志物的甲基化程度计算诊断模型预测值;优选地,所述诊断模型预测值使用LASSO构建的模型进行计算,各位点系数如下:cg05446471的系数
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4.843834、cg10085326的系数5.328574、cg11926456的系数7.431151、cg12126990的系数0.2826689、cg134804...
【专利技术属性】
技术研发人员:吴晨,林东昕,席奕轶,林媛,赵萱,张少森,谭文,
申请(专利权)人:中国医学科学院肿瘤医院,
类型:发明
国别省市:
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