一种与牛生长性状相关的SNP分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与牛生长性状相关的SNP分子标记，该分子标记位于水牛DGAT2基因NW_005783701.1的第14436个碱基处，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；SEQ ID NO.1中的碱基为A或G。本发明专利技术一种与牛生长性状相关的SNP分子标记，通过筛选与水牛生长性状相关的分子标记位点，丰富了水牛育种的分子标记遗传资源库。采用该分子标记对摩拉水牛进行选育，大大增加了对水牛生长性状选择的准确性，在育种中应予以保留携带此优势等位基因的个体，从而有利于提高牛群体的体长性状，作为潜在的遗传标记。

【技术实现步骤摘要】
一种与牛生长性状相关的SNP分子标记及其应用
本专利技术涉及牛育种
，特别涉及一种与牛生长性状相关的SNP分子标记及其应用。
技术介绍
牛的育种工作指的是凡是能从遗传结构上改进牛的品质、提高产品的数量和质量的工作，牛的品种选育就是使优良基因在群体内得到巩固和提高，从而创造出生产性能优越的个体，并使优良个体数量扩大的过程。使牛群的重要经济性状得到遗传改良。传统的育种方法主要依靠于表现型选择，无法了解其遗传背景。现在，育种学家把对目标性状的改良逐步从表现型选择转变到基因型选择理论，充分利用分子育种手段开展选育工作。目前，分子标记辅助选择在育种工作中应用最为广泛，越来越受到人们的重视，利用分子标记与决定目标性状基因紧密连锁的特点，通过检测分子标记，即可检测到目的基因的存在，达到选择目标性状的目的，具有快速、准确、不受环境条件干扰的优点，借助分子标记对目标性状基因型进行选择。分子标记辅助育种缩短了育种年限，加快了育种进程，提高了育种效率，克服了很多常规育种方法中的困难。单核苷酸多态性主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种，占所有已知多态性的90％以上。SNP在人类基因组中广泛存在，SNP是基因组中最普遍、频率最高的遗传标记。SNP是一种二态的标记，由单个碱基的转换或颠换所引起，也可由碱基的插入或缺失所致。SNP既可能在基因序列内，也可能在基因以外的非编码序列上。某些位于基因表达序列内的SNP有可能直接影响蛋白质结构和表达水平。SNP易于实现自动化分析，被认为是继RFLP、微卫星标记之后的第三代分子标记技术，在遗传育种研究中有广阔的应用前景。公开于该
技术介绍
部分的信息仅仅旨在增加对本专利技术的总体背景的理解，而不应当被视为承认或以任何形式暗示该信息构成已为本领域一般技术人员所公知的现有技术。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种与牛生长性状相关的SNP分子标记，为牛的遗传育种提供新的分子标记资源。为实现上述目的，本专利技术提供了一种与牛生长性状相关的SNP分子标记，该分子标记位于水牛DGAT2基因NW_005783701.1的第14436个碱基处，所述分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示；SEQIDNO.1中的碱基为A或G。具体序列如下所述：TGCCCCTCTCATGTCTAGGAAGGCGTCTGTGGGGAGGTGGGCTGGTGTGGGGTACTCTGCAGCTGCAGGGAAGGGCGGACAGGCTGACATCTGTCTTCTGTCTGTCACAGGCACTGGCTCCAGCATCCTCTCTGCCCTCCAGGACCTGTTTTCTGTCACTTGGCTCAATAGGTCCAAGGTAGAGAAGCAGCTCCAAGTCATCTCGGTGCTACAATGGGTCCTGTCTTTCCTCGTGCTGGGTAAGCTGGGGCTCAGAGGGTCAGGGCAGGCGGGGATGTTAGAGAGCTGAGGGGTCCTTCTTGGTCCCCTATCAAGTGCTGTACCCCAGGCAGGCTTGGGGACTCAGTGAGATTCAGTGGGAGGTGGTGGTATGGTTCCCATTTCACAGATAGAAAGCCCAAGTCTCAGAGAAGGTGAGTAACTTGTCCAAAGTCACACATTTGAGTCCAGGTCTACAGGACCGCCCCCCCGCACCACCCCCAAAGCATGTGCTGTTCCCACATGCCACCCTGCCTCCCAACAGACATTTTCCTATAGGCACGTTGCATTGTCTTAGGCTGGT。二酰甘油酰基转移酶2(diacylglycerolacylt-ransferase，DGAT2)是一种完整的内质网细胞微粒体酶，是催化甘油三酸脂合成最后一步反应的酶，也是甘油三酸酯合成过程中的唯一关键酶。进一步地，第14436个碱基位点在牛生长性状的优势等位基因为G等位基因；优势基因型为GG基因型。一种上述的分子标记在选育牛生长性状检测中的应用。一种检测引物，所述引物用于检测上述述的分子标记；所述引物对的核苷酸序列如序列表SEQIDNO.2-SEQIDNO.3所示。引物如下：正向引物：F5′-TGCCCCTCTCATGTCTAGGAA-3′，如SEQIDNO.2所示；反向引物：R5′-GACCAGCCTAAGACAATGCAAC-3′，如SEQIDNO.3所示。进一步地，本专利技术提供一种试剂盒，该试剂盒含有上述的检测引物，该试剂盒用于检测与牛生长性状相关的分子标记。进一步地，上述的检测引物在检测DGAT2基因中突变位点的应用。一种选育水牛的方法，通过对待测水牛进行上述的SNP标记的检测，评估待测水牛的繁殖性状，选择具有牛生长性状的优势等位基因和基因型个体开展育种工作。优选地，上述技术方案中，选育水牛的方法，包括以下步骤：(1)获取待检测水牛的DNA，对提取的DNA进行检测，得到DNA模板；(2)将所述检测引物和所述DNA模板进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；(3)对所述PCR扩增产物进行测序，得到测序基因序列；(4)将所测序基因序列与水牛群体标准基因序列进行对比，经过分析，得到待检测水牛基因中突变位点，确定基因中突变位点的基因型，选择目标基因型的个体用于培育高繁殖力的优势品种。优选地，上述技术方案中，用于杂交育种的亲本之一，其SNP分子标记含有等位基因G；SNP分子标记为GG基因型的个体作为牛生长性状的优势个体。优选地，上述技术方案中，所述牛生长性状为牛的体高。与现有技术相比，本专利技术具有如下有益效果：(1)本专利技术一种与牛生长性状相关的SNP分子标记，通过筛选与水牛生长性状相关的分子标记位点，丰富了水牛育种的分子标记遗传资源库。(2)采用该分子标记对摩拉水牛进行选育，大大增加了对水牛生长性状选择的准确性，在育种中应予以保留携带此优势等位基因的个体，从而有利于提高牛群体的体长性状，作为潜在的遗传标记。附图说明图1是摩拉水牛DGAT2基因NW_005783701.1PCR扩增产物的电泳图；图2是摩拉水牛DGAT2基因NW_005783701.1AA、GG、AG基因型测序峰图。具体实施方式下面结合附图，对本专利技术的具体实施方式进行详细描述，但应当理解本专利技术的保护范围并不受具体实施方式的限制。除非另有其它明确表示，否则在整个说明书和权利要求书中，术语“包括”或其变换如“包含”或“包括有”等等将被理解为包括所陈述的元件或组成部分，而并未排除其它元件或其它组成部分。牛DGAT2基因SNP检测片段的获得及多态性位点检测方法的建立一、牛血液基因组DNA的提取本专利技术的试验牛品种是广西水牛研究所的摩拉水牛。牛血液基因组DNA的提取采用TIANGEN血液基因组提取试剂盒，按该试剂盒说本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种与牛生长性状相关的SNP分子标记，其特征在于，该分子标记位于水牛DGAT2基因NW_005783701.1的第14436个碱基处，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；SEQ ID NO.1中的碱基为A或G。/n

【技术特征摘要】
1.一种与牛生长性状相关的SNP分子标记，其特征在于，该分子标记位于水牛DGAT2基因NW_005783701.1的第14436个碱基处，所述分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示；SEQIDNO.1中的碱基为A或G。


2.根据权利要求1所述的与牛生长性状相关的SNP分子标记，其特征在于，第14436个碱基位点在牛生长性状的优势等位基因为G等位基因；优势基因型为GG基因型。


3.一种如权利要求1或2所述的分子标记在选育牛生长性状检测中的应用。


4.一种检测引物，其特征在于，所述引物用于检测如权利要求1或2所述的分子标记；所述引物对的核苷酸序列如序列表SEQIDNO.2-SEQIDNO.3所示。


5.一种如权利要求4所述的检测引物在制备检测与牛生长性状相关的分子标记的试剂盒中的应用。


6.一种如权利要求4所述的检测引物在检测DGAT2基因中突变位点的应用。


7.一种选育水牛...

【专利技术属性】
技术研发人员：鄢胜飞，覃广胜，黄加祥，张秀芳，尚江华，杨春艳，郑海英，于农淇，黄健，谭正准，李辉，
申请(专利权)人：广西壮族自治区水牛研究所，
类型：发明
国别省市：广西;45