一种水稻粒形主效QTL的InDel分子标记GS9-InDel及其检测引物和应用制造技术

本发明专利技术提供了一种水稻粒形主效QTL的InDel分子标记GS9‑InDel及其检测引物和应用，属于水稻育种技术领域。GS9‑InDel的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，其中存在连续的3或4个重复序列(GTCTC)。本发明专利技术还提供了用于检测GS9‑InDel的引物1对。对日本晴、9311等15个亲本材料进行测序鉴定分析，在GS9基因正向‑2位点处插入一段GTCTC序列，基因中包含的重复序列由3次重复变成4次重复。当GS9基因包含4次重复序列时，水稻籽粒为细长粒，当GS9基因包含3次重复序列时，水稻籽粒为短圆粒。因此，该GS9‑InDel可提高水稻粒形鉴定的选育效率、加快育种研究进展。

【技术实现步骤摘要】
一种水稻粒形主效QTL的InDel分子标记GS9-InDel及其检测引物和应用
本专利技术属于水稻育种
，具体涉及一种水稻粒形主效QTL的InDel分子标记GS9-InDel及其检测引物和应用。
技术介绍
水稻是世界上最重要的谷类作物之一，也是世界上约一半人口的主要粮食来源，水稻产量的稳步提高对于我国乃至全球的粮食生产和稳定具有重要意义。水稻产量主要由单株有效穗数、每穗粒数和千粒重决定。其中，粒形是影响水稻粒重的最重要因素之一，同时也影响着稻米品质。粒形有关的三个主要性状分别为粒长(GL)、粒宽(GW)、千粒重(TGW)。水稻粒形不仅直接决定水稻品种的外观品质，而且对水稻品种的高产起重要作用。因此，发掘利用新的粒形基因等位变异也是水稻分子育种的研究目的和重要方法之一。根据Gramene网站(http：//www.gramene.org/qtl/)公布的已克隆基因数据，目前和水稻粒形相关的主效QTL有20个，主要分布于水稻第2～9号染色体上。然而，在这些研究中，大多数QTLs仅在特定的遗传背景中被发现和定位，存在于其他品种中本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种水稻粒形主效QTL的InDel分子标记GS9-InDel，其特征在于，所述GS9-InDel的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示；在所述SEQ ID NO：1中存在连续的3或4个重复序列；所述重复序列为GTCTC。/n

【技术特征摘要】
1.一种水稻粒形主效QTL的InDel分子标记GS9-InDel，其特征在于，所述GS9-InDel的核苷酸序列如SEQIDNO：1所示；在所述SEQIDNO：1中存在连续的3或4个重复序列；所述重复序列为GTCTC。


2.一种用于检测权利要求1所述InDel分子标记GS9-InDel的试剂，其特征在于，所述试剂包括引物对；所述引物对包括核苷酸序列如SEQIDNO：2所述的正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO：3所示的反向引物。


3.一种用于检测水稻粒形性状的试剂盒，其特征在于，包括权利要求2所述试剂。


4.根据权利要求3所述试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括含镁离子的10×Taqbuffer、dNTPs和TaqDNA聚合酶。


5.权利要求1所述InDel分子标记GS9-InDel、权利要求2所述试剂或权利要求4或5所述试剂盒在水稻粒形检测中的应用。


6.权利要求1所述InDel分子标记GS9-InDel、权利要求2所述试剂或权利要求4或5所述试剂盒在细长粒形水稻品种选育中的应用。


7.一种检测水稻粒形的方法，其特征在于，包括以下步骤：
1)提取待测水稻的DNA；
2)以步骤1)提取的DNA为模板，用权利要求2所述试剂中引物对进行...

【专利技术属性】
技术研发人员：孙廉平，龚柯，占小登，薛炮，彭泽群，陈代波，程式华，曹立勇，周正平，
申请(专利权)人：中国水稻研究所，
类型：发明
国别省市：浙江;33