一种G-四链体核酸适配体与小分子相互作用的研究方法技术

技术编号:28939266 阅读:65 留言:0更新日期:2021-06-18 21:40
本发明专利技术属于分析化学技术领域,提供了一种G‑四链体核酸适配体与小分子相互作用的研究方法,将G‑四链体核酸适配体溶液和小分子溶液配制成一系列不同体积比的G‑四链体核酸适配体‑小分子混合溶液并进行变复性处理,然后对其进行表面增强拉曼光谱采集,得到相应的一系列表面增强拉曼光谱图并分析G‑四链体核酸适配体的多个特征峰的变化;对预定拉曼位移范围内的一系列表面增强拉曼光谱图进行2DCOS计算得到功率谱和异步谱;通过分析功率谱和异步谱得到G‑四链体核酸适配体与小分子相互作用的基团、位点及结合过程。该研究方法将SERS和2DCOS相结合,实现了G‑四链体核酸适配体与小分子相互作用机制的分析,具有无标记、快速、灵敏、特异性强的特点。

【技术实现步骤摘要】
一种G-四链体核酸适配体与小分子相互作用的研究方法
本专利技术属于分析化学
,具体涉及一种G-四链体核酸适配体与小分子相互作用的研究方法。
技术介绍
核酸适配体是指利用指数富集的配体进化技术(SELEX)从特定的寡核苷酸库中筛选出与靶分子有特异性相互作用的单链寡核苷酸(ssDNA或RNA)。核酸适配体分子可形成多种稳定的空间结构,如茎环、发夹、假结、G-四链体等,与靶分子形成空间互补,从而高特性、高选择性地结合靶分子。其中G-四链体核酸适配体已在诊断学、治疗学、生物传感器、成像、食品和环境有毒物质检测等领域的广泛应用,因此获得亲和力更高、特异性更强的核酸适配体具有重要的意义。目前研究核酸适配体尤其是G-四链体核酸适配体,与配体小分子相互作用的方法主要有等温滴定量热法、表面等离子体共振、微量热泳动法和生物膜干涉法,这些方法属于近年来发展起来的测量适配体与配体相互作用的方法,可获得DNA与小分子配体相互作用的动力学或热力学的可靠信息。然而,这些方法也存在一定的局限性,如需要进行标记、固定配体分子或核酸适配体等,而且它们几乎不能提供核酸本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种G-四链体核酸适配体与小分子相互作用的研究方法,其特征在于,包括以下步骤:/n步骤S1,用缓冲溶液分别配制G-四链体核酸适配体溶液以及小分子溶液,将所述G-四链体核酸适配体溶液和所述小分子溶液配制成一系列不同体积比的G-四链体核酸适配体-小分子混合溶液,然后将所述混合溶液进行变复性处理;/n步骤S2,对经过所述变复性处理的一系列所述混合溶液分别进行表面增强拉曼光谱采集,得到相应的一系列表面增强拉曼光谱图;/n步骤S3,根据所述一系列表面增强拉曼光谱图,分析G-四链体核酸适配体的多个特征峰的变化;/n步骤S4,对预定拉曼位移范围内的所述一系列表面增强拉曼光谱图进行2DCOS计算,得到功率...

【技术特征摘要】
1.一种G-四链体核酸适配体与小分子相互作用的研究方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤S1,用缓冲溶液分别配制G-四链体核酸适配体溶液以及小分子溶液,将所述G-四链体核酸适配体溶液和所述小分子溶液配制成一系列不同体积比的G-四链体核酸适配体-小分子混合溶液,然后将所述混合溶液进行变复性处理;
步骤S2,对经过所述变复性处理的一系列所述混合溶液分别进行表面增强拉曼光谱采集,得到相应的一系列表面增强拉曼光谱图;
步骤S3,根据所述一系列表面增强拉曼光谱图,分析G-四链体核酸适配体的多个特征峰的变化;
步骤S4,对预定拉曼位移范围内的所述一系列表面增强拉曼光谱图进行2DCOS计算,得到功率谱和异步谱;以及
步骤S5,通过分析所述功率谱和所述异步谱,得到所述G-四链体核酸适配体与小分子相互作用的基团、位点及结合过程。


2.根据权利要求1所述的G-四链体核酸适配体与小分子相互作用的研究方法,其特征在于:
其中,所述小分子为膝沟藻毒素、石房蛤毒素、新石房蛤毒素或岩沙海葵毒素中的任意一种。


3.根据权利要求1所述的G-四链体核酸适配体与小分子相互作用的研究方法,其特征在于:
其中,步骤S1,所述变复性处理过程为:将所述混合溶液依次经过95℃水浴加热10min、冰浴猝冷5min、室温放置5min。


4.根据权利要求1所述的G-四链体核酸适配体与小分子相互作用的研究方法,其特征在于:
其中,步骤S1中,在所述G-四链体核酸适配体溶液中加入不同体积的所述小分子溶液,配置成体积比分别为1:0、1:0.2、1:0.5、1:0.75、1:1的所述G-四链体核酸适配体-小分子混合溶液,所述G-四链体...

【专利技术属性】
技术研发人员:陆峰柳艳蒋承顺袁一凡周青王梁华焦炳华
申请(专利权)人:中国人民解放军海军军医大学
类型:发明
国别省市:上海;31

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