QTL“随时定位”方法技术

本发明专利技术提供了用于监测ＱＴＬ作用和标记辅助选择（ＭＡＳ）的方法，所述方法包括：提供经过递归确定的、一种或多种标记和目标表型之间的相关性。（*该技术在2024年保护过期，可自由使用*）

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及对植物中表型性状，例如QTL的定位。更具体地，本专利技术提供了一种方法，用于针对下述表型性状进行有效定位以及对植物进行选择，所述表型性状与上位性(epistasis)和基因x环境相互作用的效果相关。
技术介绍
在过去60至70年间，植物育种对于农业生产率的贡献是很大的(Smith(1998)53rdAnnual corn and sorghum research conference，American Seed Trade Association，Washington，D.C.；Duvick(1992)Maydica 3769)。这很大程度上是因为植物育种者已经熟练于收集和整合来自对获得自优良自交系的复交的分离后代进行的大量评价的信息。进行此类育种程序需要大量的资源。例如，一位商业玉米育种者，可能要对1,000至10,000个F3顶交后代进行评估，所述后代是从在广泛的地理区域上进行的重复田间试验中的100至200次杂交所获得的。除此类巨大的资源投入之外，还有证据表明，过去的利润难以维继目前的方法(见上文，Smith(1998))。从植物育种者的角度来看，发展分子标记本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种方法，用于确保至少一种标记和至少一种表型之间的对应性的正确性，所述方法包括：提供：在多个植物种群间至少一种标记和至少一种表型之间相关性的经过递归确定的估计值，其中植物种群集体包含多次双亲杂交的后代。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】US 2003-7-7 60/485,4971.一种方法，用于确保至少一种标记和至少一种表型之间的对应性的正确性，所述方法包括提供在多个植物种群间至少一种标记和至少一种表型之间相关性的经过递归确定的估计值，其中植物种群集体包含多次双亲杂交的后代。2.如权利要求1所述的方法，其中对相关性的所述经过递归确定的估计值对于所述多个植物种群来说是正确的。3.如权利要求1所述的方法，其中所述植物种群包含后代的多个连续世代。4.如权利要求3所述的方法，其中包含在后代的每个连续世代处提供对QTL等位基因作用的更新的估计值。5.如权利要求3所述的方法，其中包含在后代的至少每两个连续世代处提供对QTL等位基因作用的更新的估计值。6.如权利要求3所述的方法，其中包含在后代的至少每五个连续世代处提供对QTL等位基因作用的更新的估计值。7.如权利要求3所述的方法，其中包含在后代的至少每十个连续世代处提供对QTL等位基因作用的更新的估计值。8.如权利要求1所述的方法，其中，对相关性的所述经过递归确定的估计值是通过如下步骤提供的a)提供多种植物中至少一种标记的等位基因和所述至少一种表型之间的相关性的第一个估计值，由此提供了对QTL等位基因作用的第一个估计值；以及，b)通过对后代种群中所述至少一种标记的所述等位基因和所述至少一种表型之间的相关性进行评估，提供更新的对QTL等位基因作用的估计值，所述后代是通过将包含所述至少一种标记的至少一种植物进行杂交获得的，由此确保所述至少一种标记与所述至少一种表型之间的所述相关性的所述正确性。9.如权利要求8所述的方法，其中包括提供对QTL等位基因作用的更新的估计值，这是通过用对QTL等位基因作用的第二个估计值去替换对QTL等位基因的所述第一个估计值来进行的。10.如权利要求8所述的方法，其中包括提供对QTL等位基因作用的更新的估计值，这是通过将对QTL等位基因作用的所述第一个估计值与对QTL等位基因作用的第二个估计值组合来进行的。11.如权利要求1所述的方法，其中对相关性的所述经过递归确定的估计值是通过如下步骤提供的a)提供多种植物中至少一种标记的等位基因和所述至少一种表型之间的相关性的第一个估计值，由此提供了对QTL等位基因作用的第一个估计值；b)选出至少一种植物，可选地，所述至少一种植物选自步骤a)的所述多种植物，其具有所述至少一种标记的所述等位基因；c)通过对后代种群中所述至少一种标记的相同或不同的等位基因和所述至少一种表型之间的相关性进行评估，更新对QTL等位基因作用的所述第一个估计值，所述后代是通过将所述至少一种选出的植物进行杂交来获得的，由此产生出对QTL等位基因作用的更新的估计值；以及d)可选地，从来自所述后代种群中选出具有所述至少一种标记的所述等位基因的至少一种植物，并且，重复c)的所述更新步骤一次或多次，以产生至少一种后续的对QTL等位基因作用的估计值。12.如权利要求11所述的方法，其中包括提供从单次育种杂交获得的多种植物中，或从多次育种杂交获得的多种植物中，所述至少一种标记的所述等位基因和所述至少一种表型之间的相关性的所述第一个估计值。13.如权利要求11所述的方法，其中包括在步骤b)中选出具有所述至少一种标记的所述等位基因和至少一种表型的至少一种植物。14.如权利要求11所述的方法，其中所述后代种群是通过将所述至少一种选出的植物与一种或多种第二次选出的植物杂交获得的。15.如权利要求11所述的方法，其中所述后代种群是通过将所述至少一种选出的植物与新的植物品系或种群的代表进行杂交获得的。16.如权利要求1所述的方法，其中包括使用至少一种统计分析来提供关于相关性的所述经过递归确定的估计值。17.如权利要求16所述的方法，其中所述至少一种统计分析用于加合作用、基因x环境相互作用和上位性中的一种或多种。18.如权利要求16所述的方法，其中所述至少一种统计分析是使用下述方法中的一种或多种来进行的，所述方法选自由单点标记分析、区间定位、复合区间定位、惩罚回归分析、复杂系谱分析、MCMC分析、MQM分析、HAPLO-IM+分析、HAPLO-M...

【专利技术属性】
技术研发人员：D波德利奇，M库珀，C温克莱尔，
申请(专利权)人：先锋高级育种国际公司，
类型：发明
国别省市：US[美国]