一种指导选择适用于抗PD-1/PD-L1免疫治疗患者的膀胱癌免疫分类系统技术方案

技术编号:28298255 阅读:125 留言:0更新日期:2021-04-30 16:24
本发明专利技术提供一种指导选择适用于抗PD‑1/PD‑L1免疫治疗患者的膀胱癌免疫分类系统,涉及生物医学技术领域。所述分类系统的确立主要是采用无监督非负矩阵分解(NMF)和最近模板预测(NTP)算法,将膀胱癌患者分为免疫活化亚组、免疫耗竭亚组和非免疫亚组。本发明专利技术克服了现有技术的不足,膀胱癌患者进行分类,确定一种新的免疫分子分类器,为膀胱癌患者的免疫治疗策略的临床选择提供方向。

【技术实现步骤摘要】
一种指导选择适用于抗PD-1/PD-L1免疫治疗患者的膀胱癌免疫分类系统
本专利技术涉及生物医学
,具体涉及一种指导选择适用于抗PD-1/PD-L1免疫治疗患者的膀胱癌免疫分类系统。
技术介绍
膀胱癌在全世界都是一个沉重的健康负担,特别是在欧洲和北美。每年约有55万新发病例,将近20万人死于膀胱癌。世界各地的膀胱癌发病率有很大的差异,南欧的发病率最高,中非的发病率最低。在美国,膀胱癌是最常见的癌症类型中的第6位,2020年度报告的新增病例约为81000例,新增死亡人数为18000人。大多数患者被诊断为早期膀胱癌,也被称为非肌层浸润性膀胱癌(non-muscle-invasivebladdercancer,NMIBC),可以通过经尿道电切术(TUR)或卡介苗(BCG)膀胱内灌注治疗或其他化疗方法治疗,但是复发在NMIBC中极为常见,大约会有70%的患者会在10年之内复发,有三分之一的患者会进展到肌层浸润性膀胱癌(muscle-invasivebladdercancer,MIBC)。MIBC的标准治疗是根治性膀胱切除术,加或不加新辅助本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种指导选择适用于抗PD-1/PD-L1免疫治疗患者的膀胱癌免疫分类系统,其特征在于,所述膀胱癌免疫分类系统包括免疫增强组和非免疫组,其中免疫增强组又分为免疫活化组和免疫耗竭组,所述膀胱癌分类系统的确立包括以下步骤:/n(1)选取一批膀胱癌患者,确定其基因表达谱、临床病理信息和总体生存数据;/n(2)采用无监督非负矩阵分解算法对膀胱癌患者的mRNA表达谱进行显微切割,通过单样本基因集富集分析计算免疫富集得分,选择富集最强的模块为免疫模块;/n(3)提取免疫模块中权重最大的150个代表基因,通过共识聚类,将膀胱患者重新定义为免疫增强组和非免疫组;/n(5)进一步使用多维尺度随机森林来定义免疫...

【技术特征摘要】
1.一种指导选择适用于抗PD-1/PD-L1免疫治疗患者的膀胱癌免疫分类系统,其特征在于,所述膀胱癌免疫分类系统包括免疫增强组和非免疫组,其中免疫增强组又分为免疫活化组和免疫耗竭组,所述膀胱癌分类系统的确立包括以下步骤:
(1)选取一批膀胱癌患者,确定其基因表达谱、临床病理信息和总体生存数据;
(2)采用无监督非负矩阵分解算法对膀胱癌患者的mRNA表达谱进行显微切割,通过单样本基因集富集分析计算免疫富集得分,选择富集最强的模块为免疫模块;
(3)提取免疫模块中权重最大的150个代表基因,通过共识聚类,将膀胱患者重新定义为免疫增强组和非免疫组;
(5)进一步使用多维尺度随机森林来定义免疫增强组和非免疫组,进行精确的分类;
(6)通过最近模板预测方法的基质活化签名来将免疫增强组识别区分为免疫活化和免疫耗竭的亚群。


2.根据权利要求1所述的一种指导选择适用于抗PD-1/PD-L1免疫治疗患者的膀胱癌免疫分类系统,其特征在于:所述步骤(3)中选取的样本基因参与了T细胞...

【专利技术属性】
技术研发人员:孟佳林张蒙陆晓凡周宇杰卞子辰金晨葛秦涛莫凡丁杨张力郝宗耀梁朝朝
申请(专利权)人:安徽医科大学第一附属医院
类型:发明
国别省市:安徽;34

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