水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术属于分子生物技术领域，具体涉及水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记及其应用。包括共分离分子标记Pi57

【技术实现步骤摘要】
水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记及其应用


[0001]本专利技术属于水稻抗病性分子生物
，具体涉及水稻稻瘟病抗性基因Pi57的2个共分离分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]水稻(Oryza sativa)是世界上最重要的粮食作物之一，全球约一半以上的人口以稻米作为主食，水稻也是我国粮食安全和农业可持续发展的重要战略资源；由真菌Magnaporthe oryzae1引起的稻瘟病是世界水稻生产区为害最为严重的病害之一，全球每年因稻瘟病危害所造成的经济损失超过70亿美元；发病田块通常可造成10
‑
30％的水稻减产，严重的田块甚至绝收2‑5。该病既可降低水稻产量，也可降低水稻品质，已成为限制水稻生产的重要因素。由于稻瘟病菌和水稻品种之间的特异性互作符合Flor“基因对基因”假说，持有特定抗病基因的水稻品种与病原菌互作时，只有病原菌持有与该特定基因相对应的无毒基因时，品种才表现出抗性，其它任何一种情况品种均表现感病6。因此，抗病品种的利用、选育和推广是水稻生产上控制该病最经济、有效和环境友好的防治措施，特别是广谱抗病基因用于抗病育种以解决品种的抗病性，已成为当前抗病育种中最为紧迫的问题。
[0003]长雄野生稻(O.longistaminata)是野生稻中抗生物胁迫和非生物胁迫的优异种质资源，其广泛分布于热带非洲的一个多年生野生种，与亚洲栽培稻(O.sativa)具有相同的AA基因组。国内外通过长期研究发现，该种质资源耐冷性强、抗水稻东革鲁病毒病、抗根结线虫、抗稻瘟病和抗白叶枯病等，高抗白叶枯病的Xa21基因就来源于长雄野生稻7‑
10
。为鉴定和研究长雄野生稻中的抗稻瘟病基因，本申请人项目组利用前期构建的一套以RD23(RD23感病籼稻品种)为背景的长雄野生稻基因组渗入系开展研究，通过田间病圃鉴定及采集自云南不同稻区的75个稻瘟病菌单孢菌株室内接种鉴定，发现水稻渗入系IL
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E1454高抗稻瘟病，表明IL
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E1454所持的基因可能具有广谱抗稻瘟病的特点；利用稻瘟病菌HN09
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1C
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7菌株接种水稻渗入系IL
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E1454与感病籼稻品种RD23杂交获得的F2群体，发现该材料中持有1个显性抗稻瘟病基因。本项目组采用图位克隆策略分离克隆了该基因，命名为Pi57基因，为了明确水稻渗入系IL
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E1454中抗性基因Pi57对稻瘟病的抗性水平，实验室利用来源于中国、柬埔寨、老挝、缅甸、泰国和越南的322个稻瘟病菌单孢菌株接种水稻渗入系IL
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E1454，抗谱测定结果表明，水稻渗入系IL
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E1454对前述6个国家采集的322分菌株的抗谱达到91％以上，说明Pi57基因具有广谱抗稻瘟病的特性，可以作为抗病育种的抗源在这些地方利用
11
。因此，有必要开发出与其共分离的分子标记用于水稻抗稻瘟病的辅助选择。
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57
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InDel
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1，其特征在于，所述水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57
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InDel
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1的片段长度为132bp，其核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO：1所示。2.一种水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57
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InDel
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2，其特征在于，所述水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57
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InDel
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2的片段长度为143bp，其核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO：2所示。3.权利要求要求1所述的水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57
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InDel
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1在水稻抗稻瘟病育种中的应用。4.权利要求要求2所述的水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57
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InDel
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2在水稻抗稻瘟病育种中的应用。5.用于扩增权利要求1所述的水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57
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InDel
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1的引物对，其特征在于，所述引物对为Pi57
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InDel
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1FW引物和Pi57
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InDel
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1RV引物，所述Pi57
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InDel
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1FW引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：3所示，Pi57
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InDel
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1RV引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：4所示。6.用于扩增权利要求2所述的水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57
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InDel
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2的引物对，其特征在于，所述引物对为Pi57
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InDel
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2FW引物和Pi57
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InDel
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2RV引物，所述Pi57
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InDel
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2FW引物的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO：5所示，Pi57
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InDel
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2RV引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：6所示。7.权利要求5所述的引物对在水稻抗稻瘟病育种中的应用。8.权利要求6所述的引物对在水稻抗稻瘟病育种中的应用。9.根据权利要求7或8所述的应用，其特征在于，(1)当用Pi57
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InDel
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1FW引物和Pi57
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InDel
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1RV引物通过PCR扩增目标水稻材料，目标水稻材料中扩增出132bp的片段，则目标水稻材料含有抗稻瘟病基因Pi57位点；用Pi57
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InDel
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1FW引物和Pi57
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【专利技术属性】
技术研发人员：杨勤忠，刘树芳，董丽英，周伍民，李迅东，曾莉，
申请(专利权)人：云南省农业科学院农业环境资源研究所，
类型：发明
国别省市：