一种肿瘤融合基因的靶向捕获探针及其应用制造技术

本发明专利技术涉及基因工程技术领域，尤其涉及一种肿瘤融合基因的靶向捕获探针及其应用。利用本发明专利技术探针组合，结合高通量测序技术，能够检测转录水平BCR、ABL1、RUNX1、CBFB、PML、RARA和KMT2A相关的融合基因，检出率高、灵敏度高、检测周期短、检测成本低，其中，检测灵敏度达到百分之一以上。分之一以上。

【技术实现步骤摘要】
一种肿瘤融合基因的靶向捕获探针及其应用


[0001]本专利技术涉及生物
，特别涉及一种肿瘤融合基因的靶向捕获探针及其应用。

技术介绍

[0002]造血系统肿瘤的疾病诊断和靶向治疗非常依赖融合基因的检测。如PML
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RARA融合基因阳性急性早幼粒细胞白血病采用维甲酸靶向治疗，BCR
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ABL1融合基因阳性慢性髓细胞白血病采用imatinib靶向治疗，CBFB
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MYH11和RUNX1
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RUNX1T1融合基因阳性急性髓系白血病提示对化疗敏感预后较好，而KMT2A融合基因在急性髓系白血病中提示预后较差常采用中高危组强化疗方案治疗等等。
[0003]当前传统的检测融合基因的技术方法主要有以下几种：
[0004]1.PCR、定量PCR技术：该方法主要原理是根据常见融合基因断裂位点设计引物定量 PCR方法检测。该方法的优点是检测灵敏度高，但是只能检测已知断裂位点类型的融合基因。对于不在引物设计位置产生的新融合基因不能检测。2.全基因组测序：该方法的原理是通过对整本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.肿瘤融合基因的靶向捕获探针，其特征在于，包括分别针对BCR、ABL1、RUNX1、PML、RARA、CBFB和KMT2A基因的外显子的起始位点或其附近、终止位点或其附近设计的探针；和针对BCR、ABL1、RUNX1、PML、RARA、CBFB和KMT2A基因转录本设计的探针；各基因的编码序列的序列号和转录本号为：其中，所述靶向捕获探针的长度为120bp，相邻探针之间的间隔为15～20bp。2.根据权利要求1所述的靶向捕获探针，其特征在于，所述靶向捕获探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:1～1037所示。3.权利要求1或2所述的靶向捕获探针在制备检测肿瘤融合基因的产品中的应用。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述肿瘤融合基因包括如下融合基因中的至少一种：与BCR、ABL1、RUNX1、PML、RARA、CBFB和KMT2A中任意一个基因融合的融合基因。5.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述肿瘤融合基因包括：与KMT2A基因融合的融合基因、BCR
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ABL1融合基因、RUNX1
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RUNX1T1融合基因、PML
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RARA融合基因和CBFB
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MYH11融合基因中的至少一种。6.一种肿瘤融合基因靶向检测的试剂盒，其特征在于，包括权利要求1或2所述的靶向捕获探针。7....

【专利技术属性】
技术研发人员：沈宏杰，
申请(专利权)人：苏州大学附属第一医院，
类型：发明
国别省市：