肿瘤驱动基因识别方法及装置制造方法及图纸

本申请公开了一种肿瘤驱动基因识别方法及装置。该方法包括基于样本基因构建共表达网络；根据不同时期的共表达网络的相关性变化通过对比共表达网络间的变化得到共表达变化网络；对共表达变化网络进行连通分量分析得到最大连通分量网络；根据最大连通分量网络获取肿瘤驱动基因。本申请通过构建共表达网络得到更全面的基因间的相互作用进而分析基因参与的癌症发展过程，并基于共表达变化模式划分得到共表达变化网络，对共表达变化网络进行连通分量分析以减少零散网络的干扰，并结合中心性度量指标获取肿瘤驱动基因，以提高识别肿瘤驱动基因的精准性。

【技术实现步骤摘要】
肿瘤驱动基因识别方法及装置
本申请涉及肿瘤基因的计算机分析
，特别的涉及一种肿瘤驱动基因识别方法及装置。
技术介绍
肿瘤是一种复杂的疾病，其发病过程是一个阶段性发展的过程，其初期表现为肿瘤细胞自身的异常增长，在发展过程中表现为对邻近正常组织的侵犯以及经血管、淋巴管和体腔转移到其他部位，并经过一系列病理生理的变化最终导致个体死亡。由于大多数技术目前还无法找出驱动肿瘤发生发展过程的关键基因，因此现在研究的重点倾向于获取肿瘤发展的驱动基因。我们发现，现有肿瘤驱动基因的挖掘多基于差异表达分析，但由于基因的差异表达往往在相同阶段的肿瘤样本中稳定性不高，且不同阶段间特异性不强，因此基于差异表达分析的分类性能并不令人满意，也很难实际应用于分析肿瘤的发展。
技术实现思路
本申请实施例提供了一种肿瘤驱动基因识别方法及装置，可更全面性的反应基因间的相互作用以及基因参与的生物过程，通过连通分量分析以减少零散网络的干扰，并结合中心性度量指标获取肿瘤驱动基因，以提高识别肿瘤驱动基因的精准性。第一方面，本申请实施例提供了一种肿瘤驱本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种肿瘤驱动基因识别方法，其特征在于，包括：/n基于样本基因构建共表达网络；所述样本基因包括正常时期的样本基因及肿瘤四个时期的样本基因；/n根据不同时期的所述共表达网络的相关性通过对比所述共表达网络间的变化得到共表达变化网络；所述共表达变化网络用于表征所述与癌症发展密切相关的样本基因的相关性变化趋势；/n对所述共表达变化网络进行连通分量分析得到最大连通分量网络；/n根据所述最大连通分量网络获取肿瘤驱动基因。/n

【技术特征摘要】
1.一种肿瘤驱动基因识别方法，其特征在于，包括：
基于样本基因构建共表达网络；所述样本基因包括正常时期的样本基因及肿瘤四个时期的样本基因；
根据不同时期的所述共表达网络的相关性通过对比所述共表达网络间的变化得到共表达变化网络；所述共表达变化网络用于表征所述与癌症发展密切相关的样本基因的相关性变化趋势；
对所述共表达变化网络进行连通分量分析得到最大连通分量网络；
根据所述最大连通分量网络获取肿瘤驱动基因。


2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述基于样本基因构建共表达网络具体包括：
获取不同时期的样本基因的样本数；
对所述不同时期的样本基因的样本数进行采样，所述采样的个数基于所述不同时期的样本基因的样本数中最小的样本数确定；
基于采样得到的所述不同时期的样本基因构建对应不同时期的共表达网络。


3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述基于采样得到的所述不同时期的样本基因构建对应不同时期的共表达网络具体包括：
基于采样得到的所述不同时期的样本基因构建对应不同时期的初始共表达网络；
基于所述不同时期的初始共表达网络得到对应于不同时期的P值网络；
根据所述不同时期的初始共表达网络及所述对应于不同时期的P值网络得到不同时期的共表达网络。


4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据不同时期的所述共表达网络的相关性通过对比所述共表达网络的变化得到共表达变化网络具体包括：
对相邻时期的所述共表达网络进行相关性比较，得到所述肿瘤四个时期的四个共表达变化网络；
基于所述肿瘤四个时期的四个共表达变化网络得到两个共表达变化网络；
其中，所述共表达变化网络包括呈现递增的共表达变化网络及呈现递减的共表达变化网络。


5.根据权利要求1所述的方法，其特征...

【专利技术属性】
技术研发人员：孙慧妍，姜弘扬，王志航，
申请(专利权)人：吉林大学，
类型：发明
国别省市：吉林;22