【技术实现步骤摘要】
一种计算样本建库投入量的方法及其建库方法
本专利技术涉及基因检测
,具体涉及一种计算样本建库投入量的方法及其建库方法。
技术介绍
随着人口的老龄化和快速增长,全球的癌症发病数和死亡数也正在快速增长。癌症将成为21世纪死亡的首要原因,并且将是世界各国提高预期寿命的最重要障碍。2018年全球新增癌症患者达1810万人,因为癌症死亡人数为960万人。我国是人口大国,也是癌症高发国家,2018年我国新发病例数380.4万例,占全球癌症新发病人数的20%以上,其中恶性肿瘤发病率为278.07/10万,死亡率为167.89/10万;肺癌、胃癌、结直肠癌、肝癌、女性乳腺癌是我国主要的常见恶性肿瘤,约占全部新发病例的77%然而,在中国,最近五年的存活率仅为40.5%,远低于日本的64.1%。过去五年,中国每年癌症死亡人数由2014年的约230万人增至2018年的约260万人,估计2024年将达约300万人。伴随着各种治疗手段的不断兴起,现在的治疗手段正逐渐向着精准化、个性化的方案靠近,加之肿瘤细胞的异质性,癌症基因的基因检测技术成为了 ...
【技术保护点】
1.一种计算样本建库投入量的方法,其特征在于,包括:根据如下公式计算样本建库投入量Input:/nInput=Z*(X/Y)…(I)/n其中,Z为投入系数,X为样本中m
【技术特征摘要】
1.一种计算样本建库投入量的方法,其特征在于,包括:根据如下公式计算样本建库投入量Input:
Input=Z*(X/Y)…(I)
其中,Z为投入系数,X为样本中m1bp~m2bp片段的面积积分值,Y为m3bp~m4bp片段的面积积分值,m1<m2,m3<m4,m2>m4。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述m1为50~100,所述m2为30000~40000,所述m3为50~100,所述m4为300~600。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述Z的取值为45~55。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述Z的取值为50。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述X、Y是由生物分析仪通过毛细管电泳分析得到;
和/或,所述X、Y为对应片段的浓度;
和/或,所述生物分析仪选自LabChip生物分析仪、Aglient2100生物分析仪中的至少一种。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述样本为游离DNA样本;
和/或,所述游离DNA样本来源于体液样本;
和/或,所述体液样本选自血液、脑脊液、胸腹水、肺泡灌洗液、囊液中的至少一种。
7.一种建库方法,其特征在于,包括对游离DNA样本进行质量控制,检测得到样本中m1bp~m2bp片段的面积积分值X,m3bp~m4bp片段的面积积分值Y,m1<m2,m3<m4,m2>m4,使用权利要求1-6任意一项所述方法计算样本建库投入量,根据计算得到的样本建库投入量,确定后续文库构建的起始投入量,然后按照该起始投入量构建得到可用于上机测序的文库。
8.如权利要求7所述的建库方法,其特征在于...
【专利技术属性】
技术研发人员:楚玉星,杨玲,李奇,吴善旋,王一茜,王珺,洪立梅,
申请(专利权)人:北京吉因加医学检验实验室有限公司,
类型:发明
国别省市:北京;11
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