丙型肝炎病毒肽组合物及其使用方法技术

技术编号:27945906 阅读:13 留言:0更新日期:2021-04-02 14:28
本公开提供了一种免疫原性组合物,所述免疫原性组合物包含:a)i)丙型肝炎病毒(HCV)异二聚体多肽,所述HCV异二聚体多肽包括HCV E1和E2多肽;ii)HCV E1多肽;或iii)HCV E2多肽;b)多肽(本文也称为“T细胞表位多肽”或“HCV T细胞表位多肽”),所述多肽包含存在于除E1和E2以外的HCV蛋白中的T细胞表位(例如,在一些HCV基因型中保守并且通过人群体中常见的一个或多个HLA等位基因呈递的CD4+和CD8+ T细胞表位);和c)药学上可接受的赋形剂。本公开提供了一种诱导个体中对HCV多肽的免疫应答的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】丙型肝炎病毒肽组合物及其使用方法交叉引用本专利申请要求2018年3月16日提交的美国临时专利申请号62/644,140的权益,该专利申请全文以引用方式并入本文。以引用方式并入作为文本文件提供的序列表序列表同时提供作为于2019年3月13日创建并且具有547KB大小的文本文件“UALB-041WO_SEQ_LISTING_ST25.txt”。该文本文件的内容全文以引用方式并入本文。引言丙型肝炎病毒(HCV)是一种血源性病原体,据估计其在全世界感染1.5-2亿人。受HCV感染可为无症状的,并且可有时在不进行医学干预下由患者清除。然而,大多数患者发展成慢性HCV感染,这可能导致肝脏炎症、瘢痕形成,并且甚至导致肝衰竭或肝癌。仅在美国,就有超过3百万人患有慢性感染。HCV病毒体含有约9.5kb的正义单链RNA基因组。该基因组编码具有3,010至3,030个氨基酸的单个多蛋白。该结构蛋白包括形成病毒核衣壳的核心蛋白和两个包膜糖蛋白E1和E2。基于来自单一基因型1a株(HCV-1)的重组包膜糖蛋白(rE1E2)的疫苗保护黑猩猩在同源性和异源性基因型1a(gt1a)病毒攻击后免受慢性感染(综述于Houghton,MImmunolRev2011)。据显示,来自经免疫黑猩猩的抗血清表现出体外交叉中和活性(Meunier等人(2011)J.Infect.Dis.204:1186)。用类似抗原在人志愿者中进行了I期临床试验(Frey等人(2010)Vaccine28:6367)。来自所选择的经疫苗接种个体的抗血清类似地能够在体外中和表达代表所有7个主要HCV基因型的菌株的结构蛋白的嵌合细胞培养源性病毒(HCVcc)(Law等人(2013)PLoSOne8:e59776),并且能够与具有广泛交叉中和活性的众多离散单克隆抗体竞争结合(Wong等人(2014)J.Virol.88:14278)。本领域需要用于诱导对HCV的免疫应答的组合物和方法。
技术实现思路
本公开提供了一种免疫原性组合物,所述免疫原性组合物包含:a)i)丙型肝炎病毒(HCV)异二聚体多肽,所述HCV异二聚体多肽包括HCVE1和E2多肽;ii)HCVE1多肽;或iii)HCVE2多肽;b)多肽(本文也称为“T细胞表位多肽”或“HCVT细胞表位多肽”),所述多肽包含存在于除E1和E2以外的HCV蛋白中的T细胞表位(例如,在一些HCV基因型中保守并且通过人群体中常见的一个或多个HLA等位基因呈递的CD4+和CD8+T细胞表位);和c)药学上可接受的赋形剂。本公开提供了一种诱导个体中对HCV多肽的免疫应答的方法。本公开提供了一种免疫原性组合物,所述免疫原性组合物包含:a)多肽,其包含存在于除E1和E2以外的HCV蛋白中的一个或多个T细胞表位(例如,在一些HCV基因型中保守并且通过人群体中常见的一个或多个HLA等位基因呈递的CD4+和CD8+T细胞表位);和b)药学上可接受的赋形剂。附图说明图1A-图1C提供了HCV基因型1病毒(具体为代表性HCV1A、1B和1C基因型)的核心-E1-E2编码区的实例的氨基酸序列比对。使用Geneious软件v5.6.4对编码区核心-E1-E2的Genbank数据库序列进行比对。氨基酸的编号根据菌株NP_671941(H77)。共有序列:SEQIDNO:1;AVI1a129:SEQIDNO:2;NP_671491(H77):SEQIDNO:3;EU155269:SEQIDNO:4;EU781810:SEQIDNO:5;EU781771:SEQIDNO:6;AB250610:SEQIDNO:7;EU781752:SEQIDNO:8;EU781759:SEQIDNO:9;EF407439:SEQIDNO:10;EF407427:SEQIDNO:11;EU362905:SEQIDNO:12;EF407413:SEQIDNO:13;EU781808:SEQIDNO:14;EU78170:SEQIDNO:15;AJ238799(Con1):SEQIDNO:16;AAK97744:SEQIDNO:17;AF139594:SEQIDNO:18;AF176573:SEQIDNO:19;BAA19625:SEQIDNO:20;BAA25076:SEQIDNO:21;BAC54896:SEQIDNO:22;BAD91386:SEQIDNO:23;BAF46764:SEQIDNO:24;BAG30950:SEQIDNO:25;CAB41951:SEQIDNO:26;AAK95832:SEQIDNO:27;AAT69968:SEQIDNO:28;和BAA03581:SEQIDNO:29。图2A-图2C提供了代表性HCV2A和HCV2B亚型的核心-E1-E2编码区的氨基酸序列的比对。使用Geneious软件v5.6.4对编码区核心-E1-E2的Genbank数据库序列进行比对。所描绘的氨基酸编号根据常见HCV菌株:分别为HCV2A和HCV2B的ABO47639(JFH1)和HPCJ8G-J8(J8)。AB047639(JFH1):SEQIDNO:30;AB047645:SEQIDNO:31;AF169003:SEQIDNO:32;AF169005:SEQIDNO:33;AF238482:SEQIDNO:34;AY746460:SEQIDNO:35;HPCPOLP:SEQIDNO:36;NC_009823:SEQIDNO:37;HPCJ8GHC-J8:SEQIDNO:38;AB030907:SEQIDNO:39;AY232730:SEQIDNO:40;AY232747:SEQIDNO:41;和DQ430817:SEQIDNO:42。图3A-图3C提供了代表性HCV3A、3B和3K基因型的核心-E1-E2编码区的氨基酸序列比对。使用Geneious软件v5.6.4对编码区核心-E1-E2的Genbank数据库序列进行比对。共有序列:SEQIDNO:43;AVI3a177:SEQIDNO:44;YP_0014696:SEQIDNO:45;CAA54244:SEQIDNO:46;AAC03058:SEQIDNO:47;AAY29642:SEQIDNO:48;ABD85062:SEQIDNO:49;ABD85063:SEQIDNO:50;ABD97104:SEQIDNO:51;BAA06044:SEQIDNO:52;BAA08372:SEQIDNO:53;和BAA09890:SEQIDNO:54。图4A-图4B提供了HCV基因型7a的核心-E1-E2编码区的氨基酸序列。基因型7a的编码区核心-E1-E2的氨基酸序列(分离株QC69;Genbank:ABN05226.1;SEQIDNO:55)根据参考菌株NP_671941(H77)的编号方案显示。图5A-5C提供了GenBank3S7G_A智人(Homosapiens)IgG1Fc:SEQIDNO:56;GenBankAAN76044智人IgG2Fc:SEQIDNO:57;本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.一种免疫原性组合物,所述免疫原性组合物包含:/na)一种或多种选自以下的T细胞表位多肽:/ni)TP35-NS3 T细胞表位多肽,所述TP35-NS3 T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:/nKSTKVPX

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20180316 US 62/644,1401.一种免疫原性组合物,所述免疫原性组合物包含:
a)一种或多种选自以下的T细胞表位多肽:
i)TP35-NS3T细胞表位多肽,所述TP35-NS3T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:
KSTKVPX1AYX2X3QGYX4VLVLNPSVAATLGFGX5X6X7SX8(SEQIDNO:134),其中X1为A或V;X2为A或V;X3为A或S;X4为K或N;X5为A或S;X6为Y或F;X7为M或L;并且X8为K或R,其中所述TP35-NS3T细胞表位多肽具有28个氨基酸至35个氨基酸的长度;以及
ii)TP50CT细胞表位多肽,所述TP50CT细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:
GVYX1LPRRGPRLGVRX2TRKX3SERSQPRGRRQX4IPKX5X6X7X8X9GX10X11WX12X13PGYP(SEQIDNO:149),其中X1为L或V;X2为A或G;X3为T或S;X4为P或R;X5为A或D;X6为R或A;X7为R、Q或S;X8为S或P;X9为E、T或Q;X10为R或K;X11为S、T、H或A;X12为A或G;并且X13为Q或K,其中所述TP50CT细胞表位多肽具有40个氨基酸至50个氨基酸的长度;
iii)TP23T细胞表位多肽,所述TP23T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:DVVVX1X2TDALMTGX3TGDFDSVID(SEQIDNO:171),其中X1为V或C;X2为A或S;并且X3为F或Y,其中所述TP23T细胞表位多肽具有18个氨基酸至23个氨基酸的长度;
iv)TP27T细胞表位多肽,所述TP27T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:X1X2X3X4KGGRHLIFCHSKKKCDEX5AX6X7LX8(SEQIDNO:189),其中X1为L或I;X2为E、A、S、V或Q;X3为Q、T、Y、F或L;X4为I或L;X5为L或I;X6为A、K或S;X7为K、Q或A;并且X8为T、R或S,其中所述TP27T细胞表位多肽具有22个氨基酸至27个氨基酸的长度;
v)TP35-NS4T细胞表位多肽,所述TP35-NS4T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:X1X2X3RHX4GX5X6EGX7X8QWMNRLIAFASRGNHVX9PTHYX10(SEQIDNO:204),其中X1为I或V;X2为L或I;X3为R或K;X4为V、I或T;X5为P、Q或T;X6为G、A或S;X7为A或V;X8为V或T;X9为S或A;并且X10为V或I,其中所述TP35-NS4T细胞表位多肽具有28个氨基酸至35个氨基酸的长度;
ⅵ)TP42T细胞表位多肽,所述TP42T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:X1X2X3GEIPFYGX4AIPX5X6X7X8KGGRHLIFCHSKKKCDEX9AX10X11LX12X13(K)n(SEQIDNO:229),其中X1为G、P或S;X2为T、N、Q、H或S;X3为E、T或D;X4为K或R;X5为L或I;X6为E、A、S或Q;X7为Q、T、Y、F或L;X8为I或L;X9为L或I;X10为A、K或S;X11为K、Q或A;X12为T、R或S;并且X13为G或S,其中n为2至10的整数,并且其中所述TP42T细胞表位多肽具有34个氨基酸至52个氨基酸的长度;
vii)TP45T细胞表位多肽,所述TP45T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:X1X2AVAX3YRGX4DVX5X6IPX7X8GDVVVX9X10TDALMTGX11TGDFDSVIDX12X13X14(K)n(SEQIDNO:249),其中X1为L或V;X2为N或T;X3为Y或F;X4为L或V;X5为S或A;X6为V或I;X7为T或A;X8为S、Q或T;X9为V或C;X10为A或S;X11为F或Y;X12为C或K;X13为N或K;并且X14为V或K,其中n为2至10的整数,并且其中所述TP45T细胞表位多肽具有36个氨基酸至55个氨基酸的长度;以及
ⅷ)TP48T细胞表位多肽,所述TP48T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:X1X2X3RHX4GX5X6EGX7X8QWMNRLIAFASRGNHVX9PTHYX10X11X12X13DAX14X15X16VX17X18X19L(K)n(SEQIDNO:255),其中X1为I或V;X2为L或I;X3为R或K;X4为V、I或T;X5为P、Q或T;X6为G、A或S;X7为A或V;X8为V或T;X9为S或A;X10为V或I;X11为P、T、A或Q,X12为E或D;X13为S、T或D;X14为S或A;X15为A、Q、R或K;X16为R、K或X;X17为T或M;X18为Q、A、T或G;并且X19为I、L或V,其中n为2至10的整数,并且其中所述TP48T细胞表位多肽具有38个氨基酸至58个氨基酸的长度;
ix)TP33T细胞表位多肽,所述TP33T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:HSKKKCDELAX1X2LX3X4X5GX6NAVAYYRGLDVSX7IP(SEQIDNO:287),其中X1为A或S;X2为K或A;X3为V、S、R或T;X4为A或G;X5为L或M;X6为I、L或V;并且X7为V或I;其中所述TP33T细胞表位多肽具有30个氨基酸至36个氨基酸的长度;
x)TP42-2T细胞表位多肽,所述TP42-2T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:KGGRHLIFCHSKKKCDELAX1X2LX3X4X5GX6NAVAYYRGLDVSX7IP(SEQIDNO:292),其中X1为A或S;X2为K或A;X3为V、S、R或T;X4为A或G;X5为L或M;X6为I、L或V;并且X7为V或I;其中所述TP42-2T细胞表位多肽具有38个氨基酸至46个氨基酸的长度;以及
b)免疫刺激量的佐剂。


2.如权利要求1所述的免疫原性组合物,其中所述一种或多种T细胞表位多肽包含异源性融合配偶体。


3.如权利要求2所述的免疫原性组合物,其中所述异源性融合配偶体为(Lys)n,其中n为2至10的整数。


4.如权利要求3所述的免疫原性组合物,其中n为3,并且其中所述融合配偶体在所述T细胞表位多肽的C-末端处。


5.如权利要求1所述的免疫原性组合物,其中所述组合物包含2、3、4或5种不同的T细胞表位多肽。


6.如权利要求1所述的免疫原性组合物,其中一种或多种T细胞表位多肽包含:
a)TP35-NS3T细胞表位多肽,所述TP35-NS3T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:
KSTKVPAAYAAQGYKVLVLNPSVAATLGFGAYMSK(SEQIDNO:133),其中所述TP35-NS3T细胞表位多肽具有28个氨基酸至35个氨基酸的长度;以及
b)TP50CT细胞表位多肽,所述TP50CT细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:
GVYLLPRRGPRLGVRATRKTSERSQPRGRRQPIPKARRSEGRSWAQPGYP(SEQIDNO:148),其中所述TP50CT细胞表位多肽具有40个氨基酸至50个氨基酸的长度。


7.如权利要求1所述的免疫原性组合物,其中所述一种或多种T细胞表位多肽包含:
a)TP35-NS3T细胞表位多肽,所述TP35-NS3T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:
KSTKVPAAYAAQGYKVLVLNPSVAATLGFGAYMSK(SEQIDNO:133),其中所述T细胞表位多肽具有28个氨基酸至35个氨基酸的长度;以及
b)TP50CT细胞表位多肽,所述TP50CT细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:
GVYLLPRRGPRLGVRATRKTSERSQPRGRRQPIPKARRSEGRSWAQPGYP(SEQIDNO:148),其中所述T细胞表位多肽具有40个氨基酸至50个氨基酸的长度;以及
c)一种或多种选自以下的T细胞表位多肽:
i)TP23T细胞表位多肽,所述TP23T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:DVVVVATDALMTGFTGDFDSVID(SEQIDNO:186),其中所述TP23T细胞表位多肽具有18个氨基酸至23个氨基酸的长度;
ii)TP27T细胞表位多肽,所述TP27T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:LEQIKGGRHLIFCHSKKKCDELAAKLT(SEQIDNO:188),其中所述TP27T细胞表位多肽具有22个氨基酸至27个氨基酸的长度;以及
iii)TP35-NS4T细胞表位多肽,所述TP35-NS4T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:ILRRHVGPGEGAVQWMNRLIAFASRGNHVSPTHYV(SEQIDNO:203),其中所述TP35-NS4T细胞表位多肽具有28个氨基酸至35个氨基酸的长度。


8.如权利要求1所述的免疫原性组合物,其中所述一种或多种T细胞表位多肽包含:
a)TP35-NS3T细胞表位多肽,所述TP35-NS3T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:
KSTKVPAAYAAQGYKVLVLNPSVAATLGFGAYMSK(SEQIDNO:133),其中所述T细胞表位多肽具有28个氨基酸至35个氨基酸的长度;以及
b)TP50CT细胞表位多肽,所述TP50CT细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:
GVYLLPRRGPRLGVRATRKTSERSQPRGRRQPIPKARRSEGRSWAQPGYP(SEQIDNO:148),其中所述T细胞表位多肽具有40个氨基酸至50个氨基酸的长度;以及
c)TP23T细胞表位多肽,所述TP23T细胞表位多肽包含与以下序列具有至少80%氨基酸序列同一性的氨基酸序列:DVVVVATD...

【专利技术属性】
技术研发人员:M·赫格顿A·兰蒂M·洛根J·L·劳陈超D·霍克曼
申请(专利权)人:艾伯塔大学理事会
类型:发明
国别省市:加拿大;CA

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