病毒受体与人体靶器官的感染路径分析系统、电子设备技术方案

技术编号:27940229 阅读:69 留言:0更新日期:2021-04-02 14:21
本发明专利技术提供了一种病毒受体与人体靶器官的感染路径分析系统、电子设备,其基于目前已有的病毒、基因、器官、器官样本建立了多个相互关联的数据库,基于数据库中的病毒与人体基因对应关系,运用统计学方法在人体组织层面上进行基因表达值大数据的分析,筛选高基因表达值器官并进行可视化展现,极大地方便了医疗人员进行医学科研活动。

【技术实现步骤摘要】
病毒受体与人体靶器官的感染路径分析系统、电子设备
本专利技术涉及医疗信息
,尤其涉及一种病毒受体与人体靶器官的感染路径分析系统、电子设备。
技术介绍
随着国内外科学家对病毒基因序列的研究,病毒的基因序列解析与病毒受体解析工作也在我国逐渐开展。新型冠状病毒肺炎患者除出现肺部感染典型症状外,有些危重患者还出现肾脏、心脏等其它器官的损害,甚至功能衰竭,这些症状提示该新型冠状病毒除感染肺部外,也可能侵入人体其他脏器官。为了找出新型冠状病毒及其它自然界中常见的其他病毒如何侵入人体器官,即病毒受体与人体靶器官的感染路径分析是一个亟需解决的问题。
技术实现思路
(一)要解决的技术问题本专利技术以期至少部分地解决以上技术问题中的至少之一。(二)技术方案为了实现如上目的,根据本专利技术的一个方面,提供了一种病毒受体与人体靶器官的感染路径分析系统。该感染路径分析系统包括:病毒数据库,其存储有病毒的数据信息;基因数据库,其存储有人体基因的数据信息;基因表达数据库,其存储有人体器官的样本本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种病毒受体与人体靶器官的感染路径分析系统,其特征在于,包括:/n病毒数据库,其存储有病毒的数据信息;/n基因数据库,其存储有人体基因的数据信息;/n基因表达数据库,其存储有人体器官的样本针对各个人体基因的基因表达值;/n输入用户接口,用于接收用户输入或选定的:病毒;/n关联信息查找模块,用于基于用户输入或选择的病毒,在病毒数据库中查找该病毒对应的数据项“Entrz ID”;基于该数据项“Entrz ID”的内容在基因数据库中查找对应的目标基因的数据项“基因Ensembl”;基于该数据项“基因Ensembl”的内容在基因表达数据库中确定目标基因的数据;/n高表达器官筛选模块,用于基于该目标...

【技术特征摘要】
1.一种病毒受体与人体靶器官的感染路径分析系统,其特征在于,包括:
病毒数据库,其存储有病毒的数据信息;
基因数据库,其存储有人体基因的数据信息;
基因表达数据库,其存储有人体器官的样本针对各个人体基因的基因表达值;
输入用户接口,用于接收用户输入或选定的:病毒;
关联信息查找模块,用于基于用户输入或选择的病毒,在病毒数据库中查找该病毒对应的数据项“EntrzID”;基于该数据项“EntrzID”的内容在基因数据库中查找对应的目标基因的数据项“基因Ensembl”;基于该数据项“基因Ensembl”的内容在基因表达数据库中确定目标基因的数据;
高表达器官筛选模块,用于基于该目标基因对应各个器官样本的基因表达值,筛选出对目标基因的高表达器官;
输出用户接口,用于将所述高表达的人体器官进行展示。


2.根据权利要求1所述的感染路径分析系统,其特征在于,所述高表达器官筛选模块包括:
基线对象选取子模块,用于选取基因表达数据库中的多个器官建立基线对象;
基线对象参数计算子模块,用于计算基线对象中各器官对应的样本针对目标基因的基因表达值的统计学参数;
器官参数计算子模块,用于分别计算各器官对应的样本针对目标基因的基因表达值的统计学参数;
筛选子模块,用于依据基线对象和各器官针对目标基因的基因表达值的统计学参数从各器官中筛选出目标基因的高表达器官。


3.根据权利要求2所述的感染路径分析系统,其特征在于:
所述基线对象参数计算子模块,用于计算基线对象中各器官对应的器官样本针对目标基因的基因表达值的均值和标准差SO,gene(k);
所述器官参数计算子模块,用于分别计算各器官对应的样本针对目标基因的基因表达值的均值和标准差;
所述筛选子模块,用于:
如时,确定人体器官organ(i)对于人体基因gene(k)为高表达;
如则器官organ(i)对于人体基因gene(k)为低表达;
除上述两种情况外,确定器官organ(i)对于人体基因gene(k)为中性表达;
其中,和Sorgan(i),gene(k)分别为人体器官organ(i)对于人体基因gene(k)的均值和标准差。


4.根据权利要求2所述的感染路径分析系统,其特征在于:所述基线对象选择子模块通过确定基线选取边界,从而将索引值在基线选取边界之内的器官组成基线对象;其中:
对于基因表达数据库中的人体器官,确定每一个人体器官对应一个独一无二的索引值;
基线选取边界包括:最小器官索引和最大器官索引,其中:最小器官索引=ceiling(P/k);最大器官索引=P-ceiling(P/k),其中,P为基因表达数据库中...

【专利技术属性】
技术研发人员:周文霞韩露张永祥肖智勇崔修亮黄晏刘港高圣乔罗丹
申请(专利权)人:中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
类型:发明
国别省市:北京;11

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