一种SSR和SV分子标记引物和及其在世界大豆群体遗传多样性分析中的应用制造技术

本发明专利技术公开了一种SSR和SV分子标记引物和及其在世界大豆群体遗传多样性分析中的应用，属于植物遗传资源技术领域。本发明专利技术提供了223对均匀覆盖大豆20条染色体的SSR和SV分子标记引物，利用这223对分子标记引物对大豆样品基因组进行PCR扩增；通过核酸电泳分析扩增条带的大小和数量，得到大豆样品的谱带信息；根据谱带信息利用PowerMarker 3.25对大豆地理群体的等位变异丰富度和等位变异离散度进行分析；利用Arlequin version 3.11计算成对群体间分化系数；根据SharedAllele算法计算群体内两两个体间的遗传距离(d

【技术实现步骤摘要】
一种SSR和SV分子标记引物和及其在世界大豆群体遗传多样性分析中的应用
本专利技术涉及植物遗传资源
，具体涉及一种SSR和SV分子标记引物及其在世界大豆群体遗传多样性分析中的应用。
技术介绍
大豆起源于我国，作为世界上最重要的经济作物，为人类提供了重要的蛋白和油脂资源，在全世界得到广泛的种植。世界各国不同的地理生态条件和育种目标，使得大豆品种产生大量新的变异，具有不同的表现差异，形成群体特异性，群体间产生分化。遗传多样性是种质资源研究的一个重要方面。通过对遗传多样性的研究，不仅可以揭示不同地理群体的亲缘关系，为挖掘其遗传潜力奠定基础。而且对现阶段掌握的种质资源来说，有助于了解它们的性状表现和遗传规律，为以后选育各种符合改进目标且具有综合优良性状的品种提供参考。现在大豆遗传多样性研究利用的材料仅限于几个国家，几乎没有涉及到全世界范围的大豆材料。因此至今关于世界大豆的遗传变异与分化的研究还很少，尤其是世界大豆群体的系统地理学关系研究。分子标记是指以DNA多态性为基础的遗传标记，具有不受环境及基因表达与否的影响，数量多、多态性高本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种SSR和SV分子标记引物，其特征在于，包括SEQ ID NO.1～446所示序列的引物。/n

【技术特征摘要】
1.一种SSR和SV分子标记引物，其特征在于，包括SEQIDNO.1～446所示序列的引物。


2.权利要求1所述SSR和SV分子标记引物在世界大豆群体遗传多样性分析中的应用，其特征在于，包括如下步骤：
(1)提取大豆样品的基因组DNA；
(2)分别以SEQIDNO.1～446所示的序列为引物，步骤(1)得到的基因组DNA为模板，分别进行PCR扩增，通过核酸电泳分析扩增条带的大小和数量，得到大豆样品的谱带信息；
(3)根据步骤(2)得到的谱带信息利用PowerMarker3.25对大豆地理群体的等位变异丰富度和等位变异离散度进行分析，并通过统计群体间互补等位变异数、群体特有和特缺等位变异数分析各地理群体的遗传基础特异性；
(4)利用Arlequinversion3.11计算成对群体间分化系数；
(5)根据SharedAllele算法计算群体内两两个体间的遗传距离(dij)，并利用“Neighbor-Joiningtree”方法得到大豆栽培品种和地理群体的无根树状遗传关系聚类图；
dij＝1-sij
其中sij为遗传相似系数，
sij＝(∑knijk)/2m
其中nijk为第i个体与第j个体在第k个分子标记上的共有等位基因数目，m为分子标记数目，
该聚类分析是在PowerMaker3.25上运行完成，并用MEGA4演示。

【专利技术属性】
技术研发人员：刘学勤，龙泉秀，谢鹏飞，杨洋，
申请(专利权)人：江苏农林职业技术学院，
类型：发明
国别省市：江苏;32