抗STEAP1抗原结合蛋白制造技术

技术编号:27888910 阅读:27 留言:0更新日期:2021-03-31 02:03
本披露提供了结合STEAP1的新颖抗原结合蛋白以及使用方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】抗STEAP1抗原结合蛋白
本披露提供了结合前列腺六跨膜上皮抗原1(STEAP1)的新颖抗原结合蛋白及其用途。相关申请的交叉引用本申请要求于2018年7月2日提交的美国临时专利申请号62/693,216和于2019年2月1日提交的美国临时专利申请号62/800,259,所述申请的披露内容通过引用以其整体并入本文。序列表作为本披露的单独部分,本申请包含呈计算机可读形式的序列表(文件名:52601_Seqlisting.txt;大小:298,914字节;创建日:2019年6月27日),该序列表通过引用以其全文并入本文。
技术介绍
前列腺癌仍然是美国男性中最常见的癌症之一。美国癌症统计工作组(U.S.CancerStatisticsWorkingGroup).美国癌症统计:基于网络报告的1999-2014发病率和死亡率(1999–2014IncidenceandMortalityWeb-basedReport);亚特兰大(GA):卫生与人类服务部,疾病控制与预防中心(DepartmentofHealthandHumanServices,CentersforDiseaseControlandPrevention)和国家癌症研究所(NationalCancerInstitute);2017。虽然与其他癌症类型相比前列腺癌的存活率相对较高,但目前的治疗选择伴随着风险和不希望的副作用。例如,手术伴随着神经损伤和阳痿的风险,并且放射疗法可以增加发展膀胱癌或胃肠道癌的风险。传统化疗与许多副作用相关联,这些副作用限制了患者在治疗期间的生活质量。基于抗体的疗法已经成功地治疗多种疾病,包括癌症和自身免疫/炎性障碍。至少部分地由于前列腺癌特异性抗原的存在,据信前列腺癌特别适合于基于抗体的疗法。尽管最近在阐明癌发生和潜在生物标志物的潜在生物学机制方面取得了进展,但仍存在对用于癌症(包括前列腺癌)的基于抗体的可替代治疗选择的需要。
技术实现思路
本披露提供了结合SEQIDNO:2的STEAP1的抗原结合蛋白,并且该抗原结合蛋白包含:(a)重链CDR,其包含与i)vhCDR1SEQIDNO:14、vhCDR2SEQIDNO:15或vhCDR2SEQIDNO:21、和vhCDR3SEQIDNO:16;或ii)vhCDR1SEQIDNO:33、vhCDR2SEQIDNO:34、和vhCDR3SEQIDNO:35差异不超过3、2、或1个氨基酸的氨基酸序列;或(b)轻链CDR,其包含与i)vlCDR1SEQIDNO:11、vlCDR2SEQIDNO:12、和vlCDR3SEQIDNO:13;或ii)vlCDR1SEQIDNO:30、vlCDR2SEQIDNO:31、和vlCDR3SEQIDNO:32差异不超过3、2、或1个氨基酸的氨基酸序列;或(c)轻链可变结构域,其包含与SEQIDNO:183或SEQIDNO:186具有至少90%同一性的氨基酸序列;或(d)重链可变结构域,其包含与SEQIDNO:182、SEQIDNO:184、或SEQIDNO:185具有至少90%同一性的氨基酸序列。在多个方面,该抗原结合蛋白包含:含有SEQIDNO:14的vhCDR1、含有SEQIDNO:15或SEQIDNO:21的vhCDR2、含有SEQIDNO:16的vhCDR3、含有SEQIDNO:11的vlCDR1、含有SEQIDNO:12的vlCDR2、和含有SEQIDNO:13的vlCDR3。可替代地,该抗原结合蛋白包含:含有SEQIDNO:33的vhCDR1、含有SEQIDNO:34的vhCDR2、含有SEQIDNO:35的vhCDR3、含有SEQIDNO:30的vlCDR1、含有SEQIDNO:31的vlCDR2、和含有SEQIDNO:32的vlCDR3。在多个方面,该抗原结合蛋白包含:含有SEQIDNO:182或SEQIDNO:184的可变重链结构域和含有SEQIDNO:183的可变轻链结构域;例如,该抗原结合蛋白包含:含有SEQIDNO:182的可变重链结构域和含有SEQIDNO:183的可变轻链结构域,或含有SEQIDNO:184的可变重链结构域和含有SEQIDNO:183的可变轻链结构域。可替代地,该抗原结合蛋白包含:含有SEQIDNO:185的可变重链结构域和含有SEQIDNO:186的可变轻链结构域。本披露进一步提供了抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白包含:含有SEQIDNO:201的重链和含有SEQIDNO:200的轻链;或含有SEQIDNO:203的重链和含有SEQIDNO:200的轻链。本披露进一步提供了包含第一单体的异源二聚体抗体,该第一单体包含第一重链,该第一重链包含:1)第一可变重链结构域;2)第一恒定重链,其包含第一CH1结构域和第一Fc结构域;和3)scFv,其结合人CD3并且包含scFv可变轻链结构域、scFv接头和scFv可变重链结构域;其中使用一个或多个结构域接头将所述scFv共价附接至所述CH1结构域的C末端和所述第一Fc结构域的N末端之间。该异源二聚体抗体进一步包含第二单体,该第二单体包含:第二重链,该第二重链包含第二可变重链结构域和含有第二Fc结构域的第二恒定重链;和共同轻链,该共同轻链包含可变轻链结构域和恒定轻链结构域。该第一可变重链结构域和该可变轻链结构域结合人STEAP1,该第二可变重链结构域和该可变轻链结构域结合人STEAP1,并且其中(i)该第一可变重链结构域和该第二可变重链结构域包含重链CDR,这些重链CDR包含与vhCDR1SEQIDNO:14、vhCDR2SEQIDNO:15或vhCDR2SEQIDNO:21、和vhCDR3SEQIDNO:16差异不超过3、2、或1个氨基酸的氨基酸序列,并且该可变轻链结构域包含轻链CDR,这些轻链CDR包含与vlCDR1SEQIDNO:11、vlCDR2SEQIDNO:12、和vlCDR3SEQIDNO:13差异不超过3、2、或1个氨基酸的氨基酸序列;或(ii)该第一可变重链结构域和该第二可变重链结构域包含重链CDR,这些重链CDR包含与vhCDR1SEQIDNO:33、vhCDR2SEQIDNO:34、和vhCDR3SEQIDNO:35差异不超过3、2、或1个氨基酸的氨基酸序列,并且该可变轻链结构域包含轻链CDR,这些轻链CDR包含与vlCDR1SEQIDNO:30、vlCDR2SEQIDNO:31、和vlCDR3SEQIDNO:32差异不超过3、2、或1个氨基酸的氨基酸序列;或(iii)该第一可变重链结构域和该第二可变重链结构域包含与SEQIDNO:182或SEQIDNO:184具有至少90%同一性的氨基酸序列,并且该可变轻链结构域包含与SEQIDNO:183具有至少90%同一性的氨基酸序列;或(iv)该第一可变重链结构域和该第二可变重链结构域包含与SEQIDNO:185具有至少90%同一性的氨基酸序列,并且该可变轻链结构域包含与SEQIDNO:186具有至少90%同一性的氨基酸序列。在多个方面,该第一可变重链结构域和该第二可变重链结构域包含CD本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.一种抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白结合SEQ ID NO:2的STEAP1并且包含:/n(a)重链CDR,其包含与i)vhCDR1 SEQ ID NO:14、vhCDR2SEQ ID NO:15或vhCDR2 SEQID NO:21、和vhCDR3 SEQ ID NO:16;或ii)vhCDR1 SEQ ID NO:33、vhCDR2 SEQ ID NO:34、和vhCDR3 SEQ ID NO:35差异不超过3、2、或1个氨基酸的氨基酸序列;或/n(b)轻链CDR,其包含与i)vlCDR1 SEQ ID NO:11、vlCDR2SEQ ID NO:12、和vlCDR3 SEQID NO:13;或ii)vlCDR1 SEQ ID NO:30、vlCDR2 SEQ ID NO:31、和vlCDR3 SEQ ID NO:32差异不超过3、2、或1个氨基酸的氨基酸序列;或/n(c)轻链可变结构域,其包含与SEQ ID NO:183或SEQ ID NO:186具有至少90%同一性的氨基酸序列;或/n(d)重链可变结构域,其包含与SEQ ID NO:182、SEQ ID NO:184、或SEQ ID NO:185具有至少90%同一性的氨基酸序列。/n...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20180702 US 62/693216;20190201 US 62/8002591.一种抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白结合SEQIDNO:2的STEAP1并且包含:
(a)重链CDR,其包含与i)vhCDR1SEQIDNO:14、vhCDR2SEQIDNO:15或vhCDR2SEQIDNO:21、和vhCDR3SEQIDNO:16;或ii)vhCDR1SEQIDNO:33、vhCDR2SEQIDNO:34、和vhCDR3SEQIDNO:35差异不超过3、2、或1个氨基酸的氨基酸序列;或
(b)轻链CDR,其包含与i)vlCDR1SEQIDNO:11、vlCDR2SEQIDNO:12、和vlCDR3SEQIDNO:13;或ii)vlCDR1SEQIDNO:30、vlCDR2SEQIDNO:31、和vlCDR3SEQIDNO:32差异不超过3、2、或1个氨基酸的氨基酸序列;或
(c)轻链可变结构域,其包含与SEQIDNO:183或SEQIDNO:186具有至少90%同一性的氨基酸序列;或
(d)重链可变结构域,其包含与SEQIDNO:182、SEQIDNO:184、或SEQIDNO:185具有至少90%同一性的氨基酸序列。


2.如权利要求1所述的抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白包含CDR序列
a)含有SEQIDNO:14的vhCDR1、含有SEQIDNO:15或SEQIDNO:21的vhCDR2、和含有SEQIDNO:16的vhCDR3;或
b)含有SEQIDNO:33的vhCDR1、含有SEQIDNO:34的vhCDR2、和含有SEQIDNO:35的vhCDR3。


3.如权利要求1或权利要求2所述的抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白包含CDR序列,其选自
a)含有SEQIDNO:11的vlCDR1、含有SEQIDNO:12的vlCDR2、和含有SEQIDNO:13的vlCDR3;或
b)含有SEQIDNO:30的vlCDR1、含有SEQIDNO:31的vlCDR2、和含有SEQIDNO:32的vlCDR3。


4.如权利要求1-3中任一项所述的抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白包含
含有SEQIDNO:14的vhCDR1、
含有SEQIDNO:15或SEQIDNO:21的vhCDR2、
含有SEQIDNO:16的vhCDR3、
含有SEQIDNO:11的vlCDR1、
含有SEQIDNO:12的vlCDR2、和
含有SEQIDNO:13的vlCDR3。


5.如权利要求1-3中任一项所述的抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白包含含有SEQIDNO:33的vhCDR1、含有SEQIDNO:34的vhCDR2、含有SEQIDNO:35的vhCDR3、含有SEQIDNO:30的vlCDR1、含有SEQIDNO:31的vlCDR2、和含有SEQIDNO:32的vlCDR3。


6.如权利要求1-3中任一项所述的抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白包含含有SEQIDNO:182、SEQIDNO:184、或SEQIDNO:185的可变重链结构域。


7.如权利要求1-3中任一项所述的抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白包含含有SEQIDNO:183或SEQIDNO:186的可变轻链结构域。


8.如权利要求1-3中任一项所述的抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白包含含有SEQIDNO:182或SEQIDNO:184的可变重链结构域以及含有SEQIDNO:183的可变轻链结构域。


9.如权利要求1-3中任一项所述的抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白包含含有SEQIDNO:185的可变重链结构域和含有SEQIDNO:186的可变轻链结构域。


10.一种抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白交叉阻断如权利要求1-9中任一项所述的参考抗原结合蛋白与STEAP1的结合,或该抗原结合蛋白与STEAP1的结合被如权利要求1-9中任一项所述的参考抗原结合蛋白交叉阻断。


11.如权利要求10所述的抗原结合蛋白,其中通过表面等离子体共振或ELISA检测该交叉阻断。


12.如权利要求10所述的抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白不结合STEAP1的胞外环2。


13.如权利要求10所述的抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白优先介导T细胞依赖性地杀伤具有大于10,000的STEAP1表面密度的细胞。


14.一种抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白结合STEAP1的氨基酸92-118和氨基酸279-290内的区域。


15.如权利要求1-14中任一项所述的抗原结合蛋白,其中该抗原结合蛋白是抗体。


16.如权利要求15所述的抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白是单克隆抗体、嵌合抗体、或人源化抗体。


17.如权利要求1-14中任一项所述的抗原结合蛋白,其中该抗原结合蛋白是抗原结合抗体片段。


18.如权利要求1-14中任一项所述的抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白包含单链抗体、双抗体、三抗体、四抗体、或结构域抗体。


19.一种药物组合物,该药物组合物包含如权利要求1-18中任一项所述的抗原结合蛋白和生理学上可接受的运载体。


20.如权利要求19所述的药物组合物,该药物组合物进一步包含抗PD-1抗原结合蛋白,该抗PD-1抗原结合蛋白包含:含有在SEQIDNO:189中列出的氨基酸序列的vhCDR1、含有在SEQIDNO:190中列出的氨基酸序列的vhCDR2、含有在SEQIDNO:191中列出的氨基酸序列的vhCDR3、含有在SEQIDNO:192中列出的氨基酸序列的vlCDR1、含有在SEQIDNO:193中列出的氨基酸序列的vhCDR2、和含有在SEQIDNO:194中列出的氨基酸序列的vlCDR3。


21.一种治疗癌症的方法,该方法包括向有需要的受试者施用如权利要求1-18中任一项所述的抗原结合蛋白。


22.如权利要求21所述的方法,该方法进一步包括向该受试者施用抗PD-1抗原结合蛋白。


23.如权利要求1-18中任一项所述的抗原结合蛋白在制备药物中的用途,该药物用于在对其有需要的受试者中治疗癌症。


24.如权利要求23所述的用途,其中该药物用于施用
与有效量的抗PD-1抗原结合蛋白联合的有效量的抗STEAP1抗原结合蛋白。


25.如权利要求1-18中任一项所述的抗原结合蛋白,该抗原结合蛋白用于在治疗对其有需要的受试者的癌症中使用。


26.如权利要求25所述使用的抗原结合蛋白,其中该抗原结合蛋白与抗PD1抗原结合蛋白一起被施用。


27.如权利要求22、24、或26所述使用的方法、用途、或抗原结合蛋白,其中该抗PD1抗原结合蛋白包含:含有在SEQIDNO:189中列出的氨基酸序列的vhCDR1、含有在SEQIDNO:190中列出的氨基酸序列的vhCDR2、含有在SEQIDNO:191中列出的氨基酸序列的vhCDR3、含有在SEQIDNO:192中列出的氨基酸序列的vlCDR1、含有在SEQIDNO:193中列出的氨基酸序列的vhCDR2、和含有在SEQIDNO:194中列出的氨基酸序列的vlCDR3。


28.如权利要求27所述使用的方法、用途、或抗原结合蛋白,其中该抗PD1抗原结合蛋白包含:含有与SEQIDNO:195的氨基酸序列具有至少90%同一性的氨基酸序列的重链可变结构域以及含有与SEQIDNO:196的氨基酸序列具有至少90%同一性的氨基酸序列的轻链可变结构域。


29.如权利要求28所述使用的方法、用途、或抗原结合蛋白,其中该抗PD1抗原结合蛋白包含:含有SEQIDNO:195的氨基酸序列的重链可变结构域以及含有SEQIDNO:196的氨基酸序列的轻链可变结构域。


30.如权利要求27-29中任一项所述使用的方法、用途、或抗原结合蛋白,其中该抗PD-1抗原结合蛋白是抗原结合抗体片段。


31.如权利要求27-29中任一项所述使用的方法、用途、或抗原结合蛋白,其中该抗PD-1抗原结合蛋白是抗体。


32.如权利要求27-29中任一项所述使用的方法、用途、或抗原结合蛋白,其中该抗PD-1抗原结合蛋白是单克隆抗体、嵌合抗体或人源化抗体。


33.如权利要求27-31中任一项所述使用的方法、用途、或抗原结合蛋白,其中该抗PD1抗原结合蛋白包含:含有SEQIDNO:197的氨基酸序列的重链以及含有SEQIDNO:198的氨基酸序列的轻链。


34.如权利要求21-33中任一项所述使用的方法、用途、或抗原结合蛋白,其中该癌症是前列腺癌。


35.如权利要求21-33中任一项所述使用的方法、用途、或抗原结合蛋白,其中该癌症是尤文肉瘤。


36.一种多核苷酸,该多核苷酸包含编码如权利要求1-14中任一项所述的抗原结合蛋白的轻链可变结构域和/或重链可变结构域的核酸序列。


37.一种表达载体,该表达载体包含如权利要求36所述的多核苷酸。


38.一种组合物,该组合物包含:含有编码如权利要求1-14中任一项所述抗原结合蛋白的轻链可变结构域的核酸序列的多核苷酸以及含有编码如权利要求1-14中任一项所述的抗原结合蛋白的重链可变结构域的核酸序列的多核苷酸。


39.一种制备抗原结合蛋白的方法,该方法包括在允许轻链可变结构域和重链可变结构域表达的条件下使宿主细胞与权利要求36所述的多核苷酸或与权利要求38所述的组合物接触。


40.一种双特异性抗原结合蛋白,该双特异性抗原结合蛋白包含如权利要求1-14中任一项所述的抗原结合蛋白。


41.如权利要求40所述的双特异性抗原结合蛋白,该双特异性抗原结合蛋白结合STEAP1和CD3。


42.如权利要求41所述的双特异性抗原结合蛋白,该双特异性抗原结合蛋白包含CD3结合结构域,该CD3结合结构域包含SEQIDNO:170-172和174-176的CDR序列。


43.一种异源二聚体抗体,该异源二聚体抗体包含:
a)第一单体,其包含第一重链,该第一重链包含:
1)第一可变重链结构域;
2)第一恒定重链,其包含第一CH1结构域和第一Fc
结构域;
3)scFv,其结合人CD3并且包含scFv可变轻链结构域、scFv接头和scFv可变重链结构域;其中使用一个或多个结构域接头将所述scFv共价附接至所述CH1结构域的C末端和所述第一Fc结构域的N末端之间;
b)第二单体,其包含第二重链,该第二重链包含第二可变重链结构域和含有第二Fc结构域的第二恒定重链;以及
c)共同轻链,其包含可变轻链结构域和恒定轻链结构域;
其中所述第一可变重链结构域和所述可变轻链结构域结合人STEAP1,所述第二可变重链结构域和所述可变轻链结构域结合人STEAP1,并且其中
(i)该第一可变重链结构域和该第二可变重链结构域包...

【专利技术属性】
技术研发人员:O·诺兰斯特沃C·李C·M·穆劳斯基B·M·阿尔巴N·J·阿拉马尔K·格拉厄姆J·L·斯蒂芬斯G·摩尔
申请(专利权)人:美国安进公司XENCOR公司
类型:发明
国别省市:美国;US

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