一种RNA检测与定量的方法技术

本发明专利技术涉及一种适配体核酸分子，包含该适配体和荧光团小分子的复合物，该适配体核酸分子用于检测细胞内或者细胞外的RNA、DNA或者其他靶分子的方法，以及包含该适配体的试剂盒。本发明专利技术的适配体可以特异性结合一种荧光团小分子，并显著提高其在合适波长光激发下的荧光强度。

【技术实现步骤摘要】
一种RNA检测与定量的方法
本专利技术涉及一种适配体核酸分子，该适配体核酸分子用于检测细胞内或者细胞外的RNA、DNA或者其他靶分子的方法，以及包含该适配体的试剂盒。本专利技术的适配体可以特异性结合一种荧光团小分子，并显著提高其在合适波长光激发下的荧光强度。
技术介绍
在所有的生物大分子中，RNA展示出了种类最为繁多的细胞生物学功能。在生物的中心法则中，RNA作为遗传物质的传递者(信使RNA)、蛋白质合成的模板(核糖体RNA)和氨基酸运输工具(转移RNA)，组成了一连串的生理过程，最终实现基因的转录与表达。过去的几十年里，RNA在多种生命活动中发挥至关重要的功能被科学家们逐渐发掘出来，包括很多RNA-蛋白质复合体，如端粒酶、剪接酶、核酶和核糖开关等。此外，近些年来一些非编码RNA，如短链干扰RNA(siRNA)、小微RNA(microRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)等，在转录后水平上对于基因表达的调控发挥着不可替代的作用。实时监测细胞中RNA的运输和代谢过程对于研究RNA的定位与基因表达以及细胞调控过程的关系是至关重要的。目前有科学家本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种核酸适配体分子，所述适配体分子包含下述核苷酸序列(a)、(b)或(c)：/n(a)核苷酸序列N

【技术特征摘要】
1.一种核酸适配体分子，所述适配体分子包含下述核苷酸序列(a)、(b)或(c)：
(a)核苷酸序列N1CACUGGCGCCN12-N13-N14CAAUCGUGGCGUGUCGGN32，其中N1、N12、N13、N14和N32代表长度≧1个核苷酸的片段，并且N1与N32核苷酸序列中至少有一对碱基形成互补配对，N12与N14核苷酸序列中至少有一对碱基形成互补配对；
(b)与(a)限定的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列；
(c)在(a)限定的核苷酸序列中不包括N1、N12、N13、N14和N32的位置，经过一个或几个核苷酸的取代、缺失和/或添加，且具有适配体功能的由(a)衍生的核酸适配体分子。


2.根据权利要求1所述的核酸适配体分子，其中与(a)所述的cpPepper结构核苷酸序列具有至少75％，76％，78％，80％，82％，85％，87％，90％，93％，95％，96％，97％，98％，99％或100％同一性的序列。


3.根据权利要求1所述的核酸适配体分子，其中核苷酸序列(c)是在(a)限定的cpPepper结构核苷酸序列中不包括N1、N12、N13、N14和N32的位置，经过10个、9个、8个、7个、6个、5个、4个、3个、2个或1个核苷酸的取代、缺失和/或添加而得到的核酸适配体分子。


4.根据权利要求3所述的核酸适配体分子，其中核苷酸序列(c)是在(a)限定的核苷酸序列中不包括N1、N12、N13、N14和N32的位置，经过7个、6个、5个、4个、3个、2个或1个核苷酸的取代而得到的核酸适配体分子。


5.根据权利要求1-4任一项所述的核酸适配体分子，其中核苷酸序列(a)中的N1与N32互补配对时，N1核苷酸序列的方向为5’-3’，N32核苷酸序列的方向为3’-5’；N12与N14互补配对时，N12核苷酸序列的方向为5’-3’，N14核苷酸序列的方向为3’-5’。


6.根据权利要求5所述的核酸适配体分子，其中当N1与N32中的至少一条片段的长度≥5个核苷酸碱基时，则N1与N32核苷酸序列中至少有两对核苷酸碱基形成互补配对；当N12与N14中的至少一条片段的长度≥5个核苷酸碱基时，则N12与N14核苷酸序列中至少有两对碱基形成互补配对。


7.根据权利要求1-6任一项所述的核酸适配体分子，其中对通式cpPepper结构的核苷酸取代选自下组中的一种：C8G、C8U、G9U、C10G、C10U、C11A、C11U、C15A、C15U、A16U、A16G、A16C、A17G、A17C、U18A、U18G、U18C、C19A、C19U、G20C、U21A、G23A、G23U、C24G、C24A、C24U、G25C、U26A、U26G、C29U、G30U、G30C、C2A/G31U、C2U/G31A、C2G/G31C、C11U/G22A、C11G/G22C、C11A/G22U、C2G/G31C/C15A、C2G/G31C/A16C、C2G/G31C/A17C、C2G/G31C/G20C、C2G/G31C/C24U、C2G/G31C/U26G、C2G/G31C/C8U、C2G/G31C/C10G、C2G/G31C/C11U、C2G/G31C/C11U/G22A、C2G/G31C/C11G/G22C、C2G/G31C/C11A/G22U、C2A/G31U/C11U/G22A、C2A/G31U/C11G/G22C、C2A/G31U/C11A/G22U、C2U/G31A/C11U/G22A、C2U/G31A/C11G/G22C、C2U/G31A/C11A/G22U、C2G/G31C/C11G/G22C/C15A、C2G/G31C/C11G/G22C/A16C、C2G/G31C/C11G/G22C/A17C、C2G/G31C/C11G/G22C/G20C、C2G/G31C/C11G/G22C/C24U、C2G/G31C/C11G/G22C/U26G、C2G/G31C/C11G/G22C/C8U、C2G/G31C/C11G/G22C/C10G、C2G/G31C/C11G/G22C/U18G/C8U、C2G/G31C/C11A/G22U/U18G/C8U、C2G/G31C/C11G/G22C/U21A/U26G/C8U和C2G/G31C/C11A/G22U/U21A/U26G/C8U。


8.根据权利要求7所述的核酸适配体分子，其中对通式cpPepper结构的核苷酸取代选自下组中的一种：C15A、C15U、A16C、A17C、C19U、G20C、U21A、C24G、C24U、U26G、C8U、C10G、C11U、C2A/G31U、C2U/G31A、C2G/G31C、C11U/G22A、C11G/G22C、C11A/G22U、C2G/G31C/C15A、C2G/G31C/A16C、C2G/G31C/A17C、C2G/G31C/G20C、C2G/G31C/C24U、C2G/G31C/U26G、C2G/G31C/C8U、C2G/G31C/C10G、C2G/G31C/C11U、C2G/G31C/C11U/G22A、C2G/G31C/C11G/G22C、C2G/G31C/C11A/G22U、C2A/G31U/C11U/G22A、C2A/G31U/C11G/G22C、C2A/G31U/C11A/G22U、C2U/G31A/C11U/G22A、C2U/G31A/C11G/G22C、C2U/G31A/C11A/G22U、C2G/G31C/C11G/G22C/C15A、C2G/G31C/C11G/G22C/A16C、C2G/G31C/C11G/G22C/A17C、C2G/G31C/C11G/G22C/G20C、C2G/G31C/C11G/G22C/C24U、C2G/G31C/C11G/G22C/U26G、C2G/G31C/C11G/G22C/C8U、C2G/G31C/C11G/G22C/C10G、C2G/G31C/C11G/G22C/U18G/C8U和C2G/G31C/C11A/G22U/U18G/C8U。


9.根据权利要求8所述的核酸适配体分子，其中对通式cpPepper结构的核苷酸取代选自下组中的一种：C15A、C15U、A16C、A17C、C19U、G20C、U21A、C24G、C24U、U26G、C8U、C10G、C11U、C2A/G31U、C2U/G31A、C2G/G31C、C11U/G22A、C11G/G22C、C11A/G22U、C2G/G31C/C15A、C2G/G31C/A16C、C2G/G31C/A17C、C2G/G31C/G20C、C2G/G31C/C24U、C2G/G31C/U26G、...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨弋，陈显军，方梦悦，朱麟勇，
申请(专利权)人：华东理工大学，
类型：发明
国别省市：上海;31