一种代谢途径预测方法、系统、终端设备及可读存储介质技术方案

本申请属于数据分析技术领域，特别是涉及一种代谢途径预测方法、系统、终端设备及可读存储介质。现有的代谢途径预测方法对代谢过程无法提供进一步解释。本申请提供了一种代谢途径预测方法，包括根据第一物质对第二物质进行裁剪获得第一结构，所述第一结构为所述第一物质与所述第二物质的共同分子子结构；将所述第二物质转换为联合树一，所述联合树一为所述第一物质中非共同分子子结构的联合树表示；将所述联合树一与所述第一结构拼接得到结构确定的所述第一物质；将所述结构确定的第一物质作为第二物质二，根据第一物质二重复以上过程得到结构确定的第一物质二；得出代谢途径。为代谢反应的产生提供可能的生物学解释。

【技术实现步骤摘要】
一种代谢途径预测方法、系统、终端设备及可读存储介质
本申请属于数据分析
，特别是涉及一种代谢途径预测方法、系统、终端设备及可读存储介质。
技术介绍
代谢中的化学反应几乎都是在酶的催化下进行的，而且许多酶连续地按顺序地起作用，形成多酶体系，使第一个酶促反应产物变成第二个酶促反应的底物，依此类推。概括生物体代谢途径的重要特征为(1)由代谢的中间体产生许多分支，从而构成了复杂的代谢网；(2)正反应(A→X)与逆反应(X→A)的途径往往是不同的，因此防止达到单纯的平衡状态；(3)在代谢途径的一些中间过程有各种代谢调节作用。把代谢途径以线路图案形式来表示就是代谢图(metabolicmap)。现有的基于规则的代谢路径预测方法：首先通过线下模块来构建一个反应规则网络(RRN)，然后通过一个线上模块来对产物的一系列反应物进行预测。或者有借助于于反应规则网络的代谢路径预测方法，它提出的一个端到端的方法是针对这个反应规则网络来找到产物的对应反应物。现有的代谢途径预测是给定一个代谢产物，得到代谢反应物。现有的代谢途径预测方法中，都是以从某个产本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种代谢途径预测方法，其特征在于，所述方法包括：/n根据第一物质对第二物质进行裁剪获得第一结构，所述第一结构为所述第一物质与所述第二物质的共同分子子结构；将所述第二物质转换为联合树一，所述联合树一为所述第一物质中非共同分子子结构的联合树表示；将所述联合树一与所述第一结构拼接得到结构确定的所述第一物质；/n将所述结构确定的第一物质作为第二物质二，根据第一物质二重复以上过程得到结构确定的第一物质二。/n

【技术特征摘要】
1.一种代谢途径预测方法，其特征在于，所述方法包括：
根据第一物质对第二物质进行裁剪获得第一结构，所述第一结构为所述第一物质与所述第二物质的共同分子子结构；将所述第二物质转换为联合树一，所述联合树一为所述第一物质中非共同分子子结构的联合树表示；将所述联合树一与所述第一结构拼接得到结构确定的所述第一物质；
将所述结构确定的第一物质作为第二物质二，根据第一物质二重复以上过程得到结构确定的第一物质二。


2.如权利要求1所述的代谢途径预测方法，其特征在于，所述裁剪包括获取所述第二物质的待裁剪区域，根据所述带裁剪区域确定裁剪中心，根据所述裁剪中心确定裁剪分支，对所述裁剪分支进行裁剪获得所述第一结构。


3.如权利要求2所述的代谢途径预测方法，其特征在于，将所述第二物质转换为联合树一包括：
将所述第二物质转换为联合树二；
对所述第二物质进行编码转换为节点向量表示一，对所述联合树二进行编码转换为节点向量表示二；
将所述节点向量表示一与所述节点向量表示二进行树解码转换为所述联合树一。


4.如权利要求3所述的代谢途径预测方法，其特征在于，所述树解码包括从树根节点开始递归第一节点，判断所述第一节点是否为新节点，如果所述第一节点为新节点，获取所述新节点的化学子结构；循环以上步骤，返回根节点得到所述联合树一。


5.如权利要4所述的代谢途径预测方法，其特征在于，所述树根节点为所述裁剪中心；通过拓扑结构预测所述第一节点是否为新...

【专利技术属性】
技术研发人员：纪超杰，吴红艳，蔡云鹏，郑奕嘉，
申请(专利权)人：深圳先进技术研究院，
类型：发明
国别省市：广东;44