一种槐蕾茶抗冠状病毒肺炎的靶点筛选方法技术

本发明专利技术公开一种槐蕾茶抗冠状病毒肺炎的靶点筛选方法，属于医药技术领域。通过活性成分的筛选及靶标预测；分子对接配体与受体的准备；成分靶点分子对接筛选活性成分；疾病靶点的预测；构建化合物‑靶点‑疾病网络；关键靶点功能富集分析。本研究采用网络药理学方法及分子对接技术探究槐蕾针对COVID‑19的活性成分及潜在靶点，进行分子对接验证，构建成分‑靶点网络，与连花清瘟胶囊与金花清感颗粒进行对比，探究其机制作用通路，为后续基础实验提供思路。

【技术实现步骤摘要】
一种槐蕾茶抗冠状病毒肺炎的靶点筛选方法
本专利技术属于医药
，具体涉及一种槐蕾茶抗冠状病毒肺炎的靶点筛选方法。
技术介绍
自2019年12月以来，新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在全球相继爆发，截至9月25日全球新冠肺炎确诊病例达32110656例，死亡病例980031例。新冠肺炎潜伏期中位数约为5.1天，常见症状有发烧，咳嗽，乏力，呼吸困难，肌痛，头痛和腹泻等。胸部CT扫描显示的最常见临床特征为在两个肺的胸膜下区域观察到多个外周毛玻璃样混浊，目前仍无针对COVID-19的特效药及疫苗。SARS-CoV-2属于β型冠状病毒，与SARS、MARS基因同源性较高，新型冠状病毒3CL水解酶(3CLpro)在病毒复制过程中能将病毒复制酶多聚蛋白切割成必须的功能蛋白。病毒的外层刺突蛋白(spike-蛋白)经宿主细胞弗林样蛋白酶或蛋白酶TMSPSS2等切割激活，与其在细胞表面的受体ACE2结合，启动由ACE2介导的病毒进入细胞的过程。木瓜样蛋白酶(PLpro)在冠状病毒复制中起着重要作用。因此，以本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种槐蕾茶抗冠状病毒肺炎的靶点筛选方法，其特征在于：包括以下步骤：/n步骤1、活性成分的筛选及靶标预测；/n步骤2、分子对接配体与受体的准备；/n步骤3、成分靶点分子对接筛选活性成分；/n步骤4、疾病靶点的预测；/n步骤5、构建化合物-靶点-疾病网络；/n步骤6、关键靶点功能富集分析。/n

【技术特征摘要】
1.一种槐蕾茶抗冠状病毒肺炎的靶点筛选方法，其特征在于：包括以下步骤：
步骤1、活性成分的筛选及靶标预测；
步骤2、分子对接配体与受体的准备；
步骤3、成分靶点分子对接筛选活性成分；
步骤4、疾病靶点的预测；
步骤5、构建化合物-靶点-疾病网络；
步骤6、关键靶点功能富集分析。


2.根据权利要求1所述的一种槐蕾茶抗冠状病毒肺炎的靶点筛选方法，其特征在于：所述步骤1、活性成分的筛选及靶标预测的具体方法是：在中药系统药理学数据库及分析平台TCMSP检索槐蕾茶已知活性成分，设置口服生物利用度OB≥30％和类药性DL≥0.18，筛选槐蕾茶活性成分，并查询得到活性成分对应的靶点，使用Uniprot数据库验证有效靶点对应的基因名称。


3.根据权利要求2所述的一种槐蕾茶抗冠状病毒肺炎的靶点筛选方法，其特征在于：所述步骤2、分子对接配体与受体的准备的具体方法是：从TCMSP中导出槐蕾茶活性成分mol2结构，通过OpenBabelGUI选用MMFF94力场进行能量优化，并保存为mol2格式；通过AutoDockTools-1.5.6赋予配体原子类型、进行电荷计算，并定义所有柔性键可旋转，保存为pdbqt格式；从PDB数据库中下载SARS-CoV-23CL水解酶、SARS-CoV-2S蛋白ACE2和木瓜蛋白酶的PDB格式，导入PyMOL软件去水分子，分离蛋白；导入AutoDockTools-1.5.6中进行添加极性氢，计算Gasteiger电荷并分配电荷，保存为pdbqt文件。


4.根据权利要求3所述的一种槐蕾茶抗冠状病毒肺炎的靶点筛选方法，其特征在于：所述步骤3、成分靶点分子对接筛选活性成分的具体方法是：AutoDockTools软件分别设置受体的格点参数文本文件，energy_range＝3，num_modes＝10，exhaustiveness＝8；运用AutodockVina软件在linux虚拟环境下进行对接，选取结合自由能小且构象较好的作为结果；...

【专利技术属性】
技术研发人员：张升校，郭姝骏，冯艺洋，乔军，赵蓉，王灿，宋珊，张一凡，
申请(专利权)人：张升校，
类型：发明
国别省市：山西;14