通过T细胞受体亚基库多样性的分析评估移植排斥状态制造技术

技术编号:26798881 阅读:55 留言:0更新日期:2020-12-22 17:16
本发明专利技术公开了评估移植受体(例如肾移植受体)的移植排斥状态的新方法。该诊断方法利用TCR亚基库多样性的测量来识别稳定受试者、经历细胞介导的排斥过程的受试者和经历抗体介导的排斥过程的受试者。独特的TCRα和β亚基序列占总的独特TCR亚基序列(α、β、δ和γ亚基的总序列)的比例提供了一种可识别稳定受试者、经历细胞介导的排斥过程的受试者和经历抗体介导的排斥过程的受试者的诊断措施。如果检测到抗体介导的排斥或细胞介导的排斥,治疗方法包括施用适当的治疗。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】通过T细胞受体亚基库多样性的分析评估移植排斥状态相关申请的交叉引用:本申请要求2018年3月12日提交的美国临时申请序列号62/641,992的优先权,该临时申请题为“KidneyTransplantRejectionAndT-CellReceptorSubunitRepertoire”,其内容通过引用纳入本申请。关于联邦政府资助的研究或开发的声明:本专利技术是在国立卫生研究院授予的授权号U19AI128913的政府支持下完成的。政府对专利技术享有一定的权利。
技术介绍
移植排斥是一个影响相当一部分肾移植受体的严重问题。肾排斥有两种主要形式:抗体介导的排斥(AMR)和通过T细胞介导的细胞介导的排斥(CMR)。重要的是,如本领域所知的,这两种形式的排斥具有不同的预后,并通过不同的方法进行治疗。因此,能够识别肾移植受体何时发生排斥并能够准确诊断受试者遭受哪种形式的排斥将是有利的。与侵入性移植物活组织检查相反,通过容易获得的样品来识别有AMR或CMR风险或者正在发生AMR或CMR的患者更为有利。由于重组过程,BCR和TCR的高度变化性是可能本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种评估移植受体受试者的排斥状态的方法,包括以下步骤:/n从所述受试者获得样品;/n通过所述样品评估受试者的(Nα+Nβ):(Nα+Nβ+Nδ+Nγ)比率,其中Nα为独特的α亚基序列的数量,Nβ为独特的β亚基序列的数量,Nδ为独特的δ亚基序列的数量,Nγ为独特的γ亚基序列的数量;和/n通过比较观察到的(Nα+Nβ):(Nδ+Nγ)比率与指示正常、CMR或AMR排斥状态的阈值确定所述受试者的移植排斥状态。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20180312 US 62/641,9921.一种评估移植受体受试者的排斥状态的方法,包括以下步骤:
从所述受试者获得样品;
通过所述样品评估受试者的(Nα+Nβ):(Nα+Nβ+Nδ+Nγ)比率,其中Nα为独特的α亚基序列的数量,Nβ为独特的β亚基序列的数量,Nδ为独特的δ亚基序列的数量,Nγ为独特的γ亚基序列的数量;和
通过比较观察到的(Nα+Nβ):(Nδ+Nγ)比率与指示正常、CMR或AMR排斥状态的阈值确定所述受试者的移植排斥状态。


2.根据权利要求1所述的方法,其中所述移植受体是肾移植受体。


3.根据权利要求1所述的方法,其中所述移植受体是选自器官、组织、细胞、心脏、肺、肝、皮肤、角膜、肠、胰腺、肢体、手指、骨、韧带、软骨和肌腱的移植物的受体。


4.根据权利要求1所述的方法,其中
通过RNA-Seq评估Nα、Nβ、Nδ和Nγ序列多样性。


5.根据权利要求1所述的方法,其中
所述受体为肾脏受体,且相关统计阈值为:稳定状态确定为(Nα+Nβ):(Nα+Nβ+Nδ+Nγ)比率低于94%的受试者;CMR排斥状态确定为(Nα+Nβ):(Nα+Nβ+Nδ+Nγ)比率在94%至97%之间的受试者;并且AMR排斥状态确定为具有大于97%的(Nα+Nβ):(Nα+Nβ+Nδ+Nγ)比率的受试者。


6.一种治疗移植受体的移植排斥的方法,包括
对所述受试者执行权利要求1-5中任一项的诊断方法以确定所述受试者是否是稳定的、正在进行的CMR或正在进行的AMR;和
如果确定所述受试者具有CMR排斥,则执行施用适合CMR的治疗的额外步骤;如果受试者被确定具有AMR,则施用适合AMR的治疗;并且如果所述受试者确定是稳定的,则不施用治疗。


7.根据权利要求6所述的方法,其中
所述受试者为肾脏受体。


8.根据权利要求6所述的方法,其中
施用于CMR的治疗为施用皮质类固醇或T细胞耗竭剂;施用于AMR排斥状态的治疗为血浆置换、静脉注射免疫球蛋白的施用或B细胞耗竭治疗。


9.一种评估移植受体受试者的移植排斥状态的方法,包括以下步骤:
从所述受试者获得样品;
通过所述样品评估所述受试者的TCR-α、TCR-β、TCR-δ和/或TCR-γ亚基中一个或多个的表达;
通过将所述样品中一个或多个选定的TCR亚基的观察表达值与定义选定群体的成员的稳定、AMR或CMR排斥状态的值进行比较来确定所述受试者是否患有CMR、患有AMR或是稳定的。


10.根据权利要求9所述的方法,其中
通过将所述一个或多个TCR亚基测量的表达值与选定的阈值或对于相同群体的稳定受试者确定的值范围进行比较来进行排斥状态的确定。


11.根据权利要求10所述的方法,其中
测量TCR-α亚基的表达;并且其中
TCR-α亚基的表达相对于对于稳定受试者确定的表达水平的增加指示AMR。


12.根据权利要求10所述的方法,其中
测量TCR-β...

【专利技术属性】
技术研发人员:M·萨瓦尔M·西罗塔S·皮内达·桑·胡安
申请(专利权)人:加利福尼亚大学董事会
类型:发明
国别省市:美国;US

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