自噬相关基因在结直肠癌预后的试剂盒和系统中的应用技术方案

技术编号:26602314 阅读:56 留言:0更新日期:2020-12-04 21:25
本发明专利技术提供了自噬相关基因在结直肠癌预后的试剂盒和系统中的应用,本发明专利技术结合自噬相关基因,找到一组可以稳定预测结直肠癌预后的特征基因;在不需要使用标准化技术平台统一测量前提下,可以兼容任何类型的测量平台来预测结直肠癌预后;采用本发明专利技术系统可以很好地预测结直肠癌预后和显著预测早期结直肠癌病人的风险;本发明专利技术还进行了单变量及多变量分析,证明使用免疫风险模型(IRGS)确实可以独立预测结直肠癌病人的预后风险。

【技术实现步骤摘要】
自噬相关基因在结直肠癌预后的试剂盒和系统中的应用
本专利技术涉及自噬相关基因在结直肠癌预后的试剂盒和系统中的应用。
技术介绍
结直肠癌(CRC)是世界常见癌症之一,每年有接近140万新发病例,居男性恶性肿瘤第三(10.9%),女性恶性肿瘤第二位(9.5%)。由于癌症筛查意识的提高,结直肠癌可以在早期被发现,从而提高生存的机会。大部分I/II期结肠癌及部分I/II期直肠癌患者均可以行无化疗手术治疗,并被认为是治愈性治疗。这大大减少了化疗所产生的副作用。然而,超过20%的I/II期CRC患者在手术切除后仍然复发。近年来研究认为这主要是有癌症病人的分子异质性导致。市面上已经开发了相当多的CRC多基因预后特征技术,但由于预后准确性的不确定性,没有一个被广泛应用。因此,一个由多种生物标志物组成的有效的预后模型对于选择性辅助化疗或其他靶向治疗是至关重要和必要的。基因分子标志物,是指基于一组基因的表达,通过机器学习建立数学模型,用于预测临床上的具体目标。近年来基因表达检测手段已经相当成熟,包括高通量的RNA测序技术、微阵列技术(Microarray)本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.基因CD163L1、FAM13B、HDAC6、HPR、NR2C2、RAB12、SIRT2、TBC1D14、TLK2和TBC1D12的联合使用在制备用于预测结直肠癌病人预后的试剂盒中的应用。/n

【技术特征摘要】
1.基因CD163L1、FAM13B、HDAC6、HPR、NR2C2、RAB12、SIRT2、TBC1D14、TLK2和TBC1D12的联合使用在制备用于预测结直肠癌病人预后的试剂盒中的应用。


2.检测自噬基因表达水平的试剂在制备用于预测结直肠癌病人预后的试剂盒中的用途,其特征在于,所述试剂用于检测基因CD163L1、FAM13B、HDAC6、HPR、NR2C2、RAB12、SIRT2、TBC1D14、TLK2和TBC1D12的表达水平。


3.一种用于预测结直肠癌病人预后的试剂盒,其特征在于,包括用于检测基因CD163L1、FAM13B、HDAC6、HPR、NR2C2、RAB12、SIRT2、TBC1D14、TLK2和TBC1D12的mRNA表达水平的试剂。


4.一种用于预测结直肠癌病人预后的系统,其特征在于,包括:数据输入模块,该模块用于将结直肠癌病人的自噬相关基因的mRNA表达值的结果输入模型计算模块,所述自噬相关基因包括基因CD163L1、FAM13B、HDAC6、HPR、NR2C2、RAB12、SIRT2、TBC1D14、TLK2和TBC1D12;所述mRNA表达值为通过Bioconductor的GEOquery程序包标准化处理后的mRNA表达水平数据;
模型计算模块,包括L...

【专利技术属性】
技术研发人员:邹一丰林绪涛高峰吴小剑兰平
申请(专利权)人:中山大学附属第六医院
类型:发明
国别省市:广东;44

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