检测番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-3和Ty-3a的KASP引物及其应用制造技术

本发明专利技术涉及分子生物学和番茄育种技术领域，特别是指检测番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty‑3和Ty‑3a基因分型的KASP引物及其应用。基因Ty‑3在其第3723位碱基的位置存在一处SNP位点，该SNP位点碱基的突变导致Ty‑3基因抗性的改变，基因Ty‑3a在其第8914位碱基的位置存在一处SNP位点，该SNP位点碱基的突变导致Ty‑3a基因抗性的改变。本发明专利技术基于上述两基因的SNP位点分别开发设计了一组可用于基因分型的KASP引物和包含相应KASP引物的试剂盒。本发明专利技术相比现有技术可对番茄植株在苗期进行快速、准确、高通量的抗病性鉴定，大大降低苗期人工接种和田间抗病鉴定的工作量，其应用可提高番茄育种效率、节约育种成本、加快育种进程。

【技术实现步骤摘要】
检测番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-3和Ty-3a的KASP引物及其应用
本专利技术涉及分子生物学和作物育种
，特别是指检测番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-3和Ty-3a的KASP引物及其应用。
技术介绍
番茄(LycopersiconesculentumMill.)是茄科番茄属的一种一年生或多年生草本植物，起源于南美洲，是一种世界性的蔬菜作物，也是我国的主要栽培蔬菜之一。随着番茄栽培面积的扩大、栽培方式的多样化和连作障碍等影响，番茄病虫害也在不断加剧。近几年由番茄黄化曲叶病毒(Tomatoyellowleafcurlvirus，TYLCV)引起的番茄黄化曲叶病毒病已成为全世界番茄生产上危害最严重的病害之一。感病植株初期上部叶片首先表现黄化型花叶，生长缓慢或停滞，节间变短，植株明显矮化。后期发病严重时，植株生长停滞、矮化，开花后坐果困难，果实不能正常转色，损失达到100％。培育抗TYLCV的新品种是防治此病的根本途径，随着番茄育种技术的不断进步，番茄已经由传统育种转向现代分子标记辅助的育种研究，分子标记辅助选择是对目标性状本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.检测番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-3和Ty-3a的KASP引物，其特征在于所述KASP引物序列包含：/n正向引物Ty-3-F1：5’-AGATTTTAGCACATTCAATGACCG-3’，其序列如SEQ No.1；/n正向引物Ty-3-F2：5’-AGATTTTAGCACATTCAATGACCA-3’，其序列如SEQ No.2；/n所述正向引物Ty-3-F1和正向引物Ty-3-F2分别与不同的标签序列相连；/n正向引物Ty-3a-F1：5’-GTGATTGCTTTATTGGAAACCA-3’，其序列如SEQ No.3；/n正向引物Ty-3a-F2：5’-GTGATTGCTTTATTGG...

【技术特征摘要】
1.检测番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-3和Ty-3a的KASP引物，其特征在于所述KASP引物序列包含：
正向引物Ty-3-F1：5’-AGATTTTAGCACATTCAATGACCG-3’，其序列如SEQNo.1；
正向引物Ty-3-F2：5’-AGATTTTAGCACATTCAATGACCA-3’，其序列如SEQNo.2；
所述正向引物Ty-3-F1和正向引物Ty-3-F2分别与不同的标签序列相连；
正向引物Ty-3a-F1：5’-GTGATTGCTTTATTGGAAACCA-3’，其序列如SEQNo.3；
正向引物Ty-3a-F2：5’-GTGATTGCTTTATTGGAAACCG-3’，其序列如SEQNo.4；
所述正向引物Ty-3a-F1和正向引物Ty-3a-F2分别与不同的标签序列相连接。


2.根据权利要求1所述的检测番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-3和Ty-3a的KASP引物，其特征在于合成所述正向引物Ty-3-F1和Ty-3a-F1时，分别在其5’端加上序列为：5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3’的标签序列A，其序列如SEQNo.11；合成所述正向引物Ty-3-F2和Ty-3a-F2时，分别在其5’端加上序列为5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3’的标签序列B，其序列如SEQNo.12。


3.根据权利要求1或2中所述的检测番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-3和Ty-3a的KASP引物，其特征在于所述的KASP引物序列为：
检测Ty-3基因的正向引物1：5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCTAGATTTTAGCACATTCAATGACCG-3’，其序列如SEQNo.5；
检测Ty-3基因的正向引物2：5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATTAGATTTTAGCACATTCAATGACCA-3’，其序列如SEQNo.6；
检测Ty-3a基因的正向引物A：5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGTGATTGCTTTATTGGAAACCA-3’，其序列如SEQNo.7；
检测Ty-3a基因的正向引物B：5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGTGATTGCTTTATTGGAAACCG-3’，其序列如SEQNo.8。


4.根据权利要求1-3中任一项所述的检测番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-3和Ty-3a的KASP引物，其特征在于所述KASP引物中还包括：
反向引物Ty-3-R：5’-TTTATGCCACACAGAAATCCTAATG...

【专利技术属性】
技术研发人员：康忱，吴志明，王鹏，李亚栋，田哲娟，王美娥，
申请(专利权)人：河北省农林科学院经济作物研究所，
类型：发明
国别省市：河北;13