一种牛肉脂肪酸组成预测方法、系统和存储介质技术方案

本发明专利技术公开了一种牛肉脂肪酸组成预测方法、系统和存储介质，所述方法包括：对待测目标进行全基因组测序，获取所述待测目标的SNPs位点；根据预设置的SNPs位点，在所述待测目标的SNPs位点中筛选出有效的SNPs位点；将所述有效的SNPs位点输入到牛肉脂肪酸预测模型中，获取所述待测目标的牛肉脂肪酸组成。本发明专利技术实施例通过全基因组测序技术获取待测目标的SNPs位点，并在待测目标的SNPs位点中筛选出有效的SNPs位点，并将有效的SNPs位点输入到牛肉脂肪酸预测模型中，获取待测目标的牛肉脂肪酸组成，相较于现有的气相色谱法，大大提高了牛肉脂肪酸组成检测的效率。本发明专利技术可广泛应用于生物技术领域中。

【技术实现步骤摘要】
一种牛肉脂肪酸组成预测方法、系统和存储介质
本专利技术涉及生物
，尤其涉及一种牛肉脂肪酸组成预测方法、系统和存储介质。
技术介绍
近年来，随着人们生活品质的提高和消费理念的改变，优质牛肉产品越来越受广大消费者喜爱。脂肪酸是人体不可缺少的营养素，牛肉脂肪酸的成分和含量是衡量其肉质特性的重要指标，也是决定消费者选择购买的重要因素。饱和脂肪酸、单不饱和脂肪酸和多不饱和脂肪酸比例适当的牛肉，富于多汁性，风味佳，营养丰富。因此，科学合理地预测牛肉脂肪酸组成，能够帮助企业充分发挥其生产潜力，提高经济收益。牛肉脂肪酸组成是牛肉价值评定的重要指标之一，目前主要通过气相色谱法来测定。气相色谱法只能测定特定时间点牛肉脂肪酸，且需要待牛出栏屠宰取样后才能测量，使用气相色谱法进行牛肉脂肪酸组成的检测成本高、技术复杂、测量时间长且有很大的局限性，导致牛肉脂肪酸组成的检测效率较低。
技术实现思路
有鉴于此，本专利技术的目的是提供一种牛肉脂肪酸组成预测方法、系统和存储介质，以提高牛肉脂肪酸组成的检测效率。本专利技术所采用的第一技术方案是：一种牛肉脂肪酸组成预测方法，包括：对待测目标进行全基因组测序，获取所述待测目标的SNPs位点；根据预设置的SNPs位点，在所述待测目标的SNPs位点中筛选出有效的SNPs位点；将所述有效的SNPs位点输入到牛肉脂肪酸预测模型中，获取所述待测目标的牛肉脂肪酸组成。进一步，所述预设置的SNPs位点的确定方法为：构建样本集，所述样本集包括样本的SNPs位点和样本的脂肪酸组成；根据所述样本的SNPs位点和所述样本的脂肪酸组成，计算所述样本的SNPs位点和所述样本的脂肪酸组成的相关系数；根据所述相关系数对所述样本的SNPs位点进行筛选，得到筛选后的SNPs位点；根据所述筛选后的SNPs位点和所述样本的脂肪酸组成，获取预设置的SNPs位点。进一步，所述相关系数为皮尔逊相关系数。进一步，所述预设置的SNPs位点为所述筛选后的SNPs位点的稀疏表示。进一步，所述牛肉脂肪酸预测模型包括输入层、第一隐藏层、第二隐藏层和输出层。进一步，所述第一隐藏层后采用ReLU激活函数，所述第二隐藏层后采用ReLU激活函数。进一步，所述牛肉脂肪酸预测模型的损失函数为L2范数。本专利技术所采用的第二技术方案是：一种牛肉脂肪酸组成预测系统，包括：测序模块，用于对待测目标进行全基因组测序，获取所述待测目标的SNPs位点；筛选模块，用于根据预设置的SNPs位点，在所述待测目标的SNPs位点中筛选出有效的SNPs位点；预测模块，用于将所述有效的SNPs位点输入到牛肉脂肪酸预测模型中，获取所述待测目标的牛肉脂肪酸组成。本专利技术所采用的第三技术方案是：一种牛肉脂肪酸组成预测系统，包括：存储器，用于存储程序；处理器，用于加载所述程序以执行所述的一种牛肉脂肪酸组成预测方法。本专利技术所采用的第四技术方案是：一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现所述的一种牛肉脂肪酸组成预测方法。本专利技术实施例通过全基因组测序技术获取待测目标的SNPs位点，并在待测目标的SNPs位点中筛选出有效的SNPs位点，并将有效的SNPs位点输入到牛肉脂肪酸预测模型中，获取待测目标的牛肉脂肪酸组成，相较于现有的气相色谱法，大大提高了牛肉脂肪酸组成检测的效率。附图说明图1为本专利技术实施例一种牛肉脂肪酸组成预测方法的流程图。具体实施方式以下将结合实施例和附图对本专利技术的构思、具体结构及产生的技术效果进行清楚、完整的描述，以充分地理解本专利技术的目的、方案和效果。本专利技术实施例提供了一种牛肉脂肪酸组成预测方法，参照图1，包括：S100、对待测目标进行全基因组测序，获取所述待测目标的SNPs位点；S200、根据预设置的SNPs位点，在所述待测目标的SNPs位点中筛选出有效的SNPs位点；S300、将所述有效的SNPs位点输入到牛肉脂肪酸预测模型中，获取所述待测目标的牛肉脂肪酸组成。具体地，本方案中对一头脂肪酸组成未知的牛进行牛肉脂肪酸预测时，只需要采集其全基因组DNA进行测序，并从获得的SNPs中选择有效SNPs位点并送入到牛肉脂肪酸预测模型就可以得到相应的牛肉脂肪酸组成。待测目标是指待进行牛肉脂肪酸组成检测的牛。全基因组测序是一种新型基因检测技术，能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测或分析个体的特征。由于牛肉脂肪酸组成与牛的遗传资源具有很强的相关性，所以通过全基因组测序技术获取牛的SNPs位点可以在一定程度上预测其牛肉脂肪酸组成。SNPs又叫单核苷酸多样性，是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。预设置的SNPs位点是指样本集中与牛肉脂肪酸组成关联性较高的SNPs位点。有效的SNPs位点是指待测目标中与牛肉脂肪酸组成关联性较高的SNPs位点。牛肉脂肪酸预测模型是一个训练完成后的神经网络模型，其输入为SNPs位点数据，输出为对应的牛肉脂肪酸组成，通过将待测目标的有效SNPs位点输入到牛肉脂肪酸预测模型中，可以得到待测目标的牛肉脂肪酸组成。牛肉脂肪酸组成指牛肉脂肪酸的构成和含量，现有技术中一般通过气相色谱仪分析牛肉中的脂肪酸组成，例如牛肉中的各种饱和脂肪酸的含量和各种不饱和脂肪酸的含量。在一些实施例中，所述预设置的SNPs位点的确定方法为：构建样本集，所述样本集包括样本的SNPs位点和样本的脂肪酸组成；根据所述样本的SNPs位点和所述样本的脂肪酸组成，计算所述样本的SNPs位点和所述样本的脂肪酸组成的相关系数；根据所述相关系数对所述样本的SNPs位点进行筛选，得到筛选后的SNPs位点；根据所述筛选后的SNPs位点和所述样本的脂肪酸组成，获取预设置的SNPs位点。具体地，牛肉脂肪酸组成与牛的基因具有很强的相关性。为了能够预测牛肉脂肪酸组成，需要构建求解预测模型所需的样本集。构建样本集的示例如下：对同一群体N头24月龄的牛宰杀，用气相色谱法测定其背最长肌脂肪酸成分，并利用高密度芯片获得其全基因组SNPs位点。假设共检测出q种脂肪酸及p0个SNPs位点，构建样本对：i＝1,2,…,N(N≥200)其中，和yi＝[yi,1,yi,2,…,yi,q]T均为列向量。yik表示第i头牛的脂肪酸的第k种成分的值，即k＝1,2,…q；表示第i头牛检测出来的第j个SNPs位点。根据SNPs的性质，取值为{0,1,2}，共有p0个SNPs位点，即j＝1,2,…p0。上标0表示原始的基因特征。由于每个群体检测到的SNPs位点个数有差异，用p0表示实际检测出来的SNPs位点个数。牛肉脂肪酸组成由少量基因决定，因此，全基因组测序检测出来的SNPs位点绝大部分与牛肉脂肪酸组成无关。为本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种牛肉脂肪酸组成预测方法，其特征在于，包括：/n对待测目标进行全基因组测序，获取所述待测目标的SNPs位点；/n根据预设置的SNPs位点，在所述待测目标的SNPs位点中筛选出有效的SNPs位点；/n将所述有效的SNPs位点输入到牛肉脂肪酸预测模型中，获取所述待测目标的牛肉脂肪酸组成。/n

【技术特征摘要】
1.一种牛肉脂肪酸组成预测方法，其特征在于，包括：
对待测目标进行全基因组测序，获取所述待测目标的SNPs位点；
根据预设置的SNPs位点，在所述待测目标的SNPs位点中筛选出有效的SNPs位点；
将所述有效的SNPs位点输入到牛肉脂肪酸预测模型中，获取所述待测目标的牛肉脂肪酸组成。


2.根据权利要求1所述的一种牛肉脂肪酸组成预测方法，其特征在于，所述预设置的SNPs位点的确定方法为：
构建样本集，所述样本集包括样本的SNPs位点和样本的脂肪酸组成；
根据所述样本的SNPs位点和所述样本的脂肪酸组成，计算所述样本的SNPs位点和所述样本的脂肪酸组成的相关系数；
根据所述相关系数对所述样本的SNPs位点进行筛选，得到筛选后的SNPs位点；
根据所述筛选后的SNPs位点和所述样本的脂肪酸组成，获取预设置的SNPs位点。


3.根据权利要求2所述的一种牛肉脂肪酸组成预测方法，其特征在于，所述相关系数为皮尔逊相关系数。


4.根据权利要求2所述的一种牛肉脂肪酸组成预测方法，其特征在于，所述预设置的SNPs位点为所述筛选后的SNPs位点的稀疏表示。


5.根据权利要求1所述的一种牛肉脂肪酸组成预...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵拴平，金海，徐磊，贾玉堂，
申请(专利权)人：安徽省农业科学院畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：安徽;34