SARS冠状病毒结构蛋白ORF3及其应用制造技术

技术编号:2622723 阅读:134 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
一种结构蛋白,其特征在于,该蛋白选自下组:(a)具有SEQIDNO:1氨基酸序列的多肽;(b)将SEQIDNO:1氨基酸序列经过一个或多个氨基酸残基的取代、缺失或添加而形成的,且定位在SARS病毒颗粒上具有免 疫原性,可与S蛋白形成了链间二硫键共价复合物的由(a)衍生的多肽。(*该技术在2023年保护过期,可自由使用*)

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及SARS冠状病毒(SARS-CoV)的结构蛋白及其应用。具体地,本专利技术涉及一种新的SARS病毒结构蛋白ORF3及其片段,以及抗ORF3蛋白或其片段的抗体。
技术介绍
WHO于2003年3月12日向全球发出了近10年来的首次传染病预警,该曾一度被称为非典型肺炎(atypical pneumonia)的传染病自2002年11月中旬首次在中国广东境内发现,它起病急,传染力强,抗生素治疗无效,截至5月10日18时,全世界已有33个国家和地区发现该病,累计患病人数7296人,死亡人数526人,死亡率达3-6%。2003年4月16日世界卫生组织正式确认引起严重急性呼吸综合症(Severe Acute Respiratory Syndrome,以下简称SARS)的病原体为一种新型冠状病毒-SARS冠状病毒(以下简称SARS-CoV)。它是一种正链、单链RNA病毒(ssRNA positive-strand viruses,no DNA stage),属套病毒目(orderNidovirales)、冠状病毒科(family Coronaviridae)、冠状病毒属(genusCoronavirus)、SARS冠状病毒(SARS coronavirus)。电镜下,冠状病毒颗粒呈不规则形,直径约为60-220nm,有包膜,包膜上具有糖蛋白,其中一种长的包膜糖蛋白突起长度约为20nm,包膜内含有核衣壳。通常将包装到病毒颗粒中的病毒表达蛋白称为结构蛋白,但是有些非结构蛋白也能够插到病毒包膜中。一般认为结构蛋白质与病毒颗粒的形成与释放、以及宿主细胞的识别、宿主的感染和致病有关(S.G..Siddell,Ed.,TheCoronaviridae Plenum Press New York,1995)。序列分析表明SARS-CoV与已知冠状病毒一样同样存在结构蛋白复制酶(replicase)、S蛋白(spikeprotein)、E蛋白(envelope protein)、M蛋白(membrane protein)、N蛋白(nucleocapsid protein),这些结构蛋白的氨基酸序列在结构和功能上与已知冠状病毒相似。其中SARS-CoV的E、M、N蛋白所包含的保守基因序列同样存在于其他冠状病毒中;S蛋白是冠状病毒的糖蛋白,位于病毒表面,负责参与受体细胞的受体结合以及膜融合,S蛋白的羧基末端由跨膜域和富含半胱氨酸残基的胞质尾区组成。S蛋白上还包含了重要的病毒中和表位,但是,由于SARS-CoY的S蛋白与其他冠状病毒S蛋白间的氨基酸序列差异,目前还不能够从中推知SARS-CoV的S蛋白的受体结合特异性或抗原表位的结构特征(Paul A.Rota et al’Characterization of a Novel CoronavirusAssociated with Severe Acute Respeiratory Syndrome’Sciencexpress/1May 2003)。由于S基因的变异,其宿主范围、组织趋向及毒力都可能发生改变,因此,对于S蛋白及其共价复合物的研究将有助于理解S蛋白如何影响SARS的发病机制以及相关药物的开发研制。加拿大多伦多基因组科学中心的研究小组于4月12日在网上发布了病毒全序列,SARS-CoV全基因组序列长约30kb,具有5’帽结构和3’polyA尾(Marco A.Marra et al’The Genome Sequence of the SARS-AssociatedCoronavirus’Sciencexpress/1May 2003),来自加拿大的SARS-CoV分离株预测有14个开放阅读框(Rota PA,Oberste MS,The Genome sequence of theSARS-associated coronavirus.Science.2003 May 30;300(5624)1399-404.)。已知的结构蛋白复制酶、S蛋白、E蛋白、M蛋白、N蛋白的编码序列分别位于ORF1a和ORF1b、ORF2、ORF5、ORF6、ORF12(Rota PA,Oberste MS,The Genomesequence of the SARS-associated coronavirus.Science.2003 May30;300(5624)1399-404.)。一般说来,RNA病毒具有高遗传突变率的特征,这既是进化的需要也是RNA病毒用于逃避宿主防御的有效机制(Yijun Ruan etal)。基因序列分析表明SARS-CoV的基因组序列与已知的三种冠状病毒亚群序列截然不同,极有可能是独立进化而来,所以将其归为冠状病毒的一个新的分支。取自不同来源的14株SARS-CoV基因组序列比较结果显示总共有127个单核苷酸变异,其中94个改变了氨基酸残基(Yi jun Ruan et al),但是这些差异对于SARS-CoV本身进化的意义以及对于不同株型是否在被感染的宿主个体间存在的各种差异上起到关键性的作用,目前还不可知。现有SARS检测手段有3种,包括采用抗体检测的方法ELISA(IGM/IGA)方法可以可靠地检出出现临床症状20天后SARS病人血清中的病毒抗体。某些病人在14-21天时,已经可以检测到抗体;采用免疫荧光法检测可以检测出病毒感染VERO细胞10天后产生的M免疫球蛋白;采用分子检测方法已经发展了7对引物使用于检测过程中,检测中的阳性对照RNA可以从Bernhard-NochtInstitute in Hamburg,Germany免费获得。检测样品包括血液、粪便、呼吸道分泌物。PCR结果可以辅助临床诊断评价,但是不能肯定或排除疾病的可能;细胞培养方法利用VERO细胞来检测SARS病人的呼吸道分泌物和血液样品,阳性结果表示SARS病人感染了冠状病毒,阴性结果不表明病人不是SARS。但是这些检测手段还不能及时有效的作为检测诊断SARS的有效方法,一般都还需要结合临床症状等辅助手段综合判断。目前,有效控制乃至消灭SARS对于人类生命的危害已经成为摆在全球科学家面前的重要课题。人们从发现病源到病原体的确认到基因组测序、序列分析也只有短短几个月的时间,尽管已经取得了一些进展,但目前人们对SARS冠状病毒知之甚少。为了获取更多有价值的线索,人们逐渐把更多的目光投向对病毒蛋白的分离、病毒蛋白的功能分析及其应用的研究上,人们迫切需要通过更多的途径寻找到更多的、有价值的SARS-CoV表达蛋白,进一步了解它们在病毒复制、发病机理方面的作用,提供有效的SARS冠状病毒的检测方法和试剂,促进SARS疫苗的研制和SARS新药的开发。目前,除了结构蛋白S、E、M、N被确认之外,目前,除了上述开放阅读框被确认编码SARS-CoV结构基因之外,还没有明确确认其他SARS-CoV结构基因并证实该结构基因的功能和活性特征的报道,尤其是定位在病毒表面的其他蛋白。由于临床缺少有效SARS的治疗药物,所以现阶段将感染病人迅速隔离治疗是最有效的防治手段。为了开发SARS检测方法和治疗方法,本领域迫切需要开发新的SARS结构蛋白以及相关的诊断方法和试剂盒。
技术实现思路
本专利技术目的就是提本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:吴家睿曾嵘孙兵杨瑞馥施木德
申请(专利权)人:中国科学院上海生命科学研究院
类型:发明
国别省市:

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