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检测水产品食物过敏原基因的实时荧光PCR方法技术

技术编号:2619519 阅读:289 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术公开了一种检测水产品食物过敏原基因的实时荧光PCR方法,其步骤包括提取样品总RNA,通过SYBR Green或TaqMan探针法实时荧光PCR技术分别检测水产品食物过敏原基因Par和TM,以及内标基因β-actin,依据扩增动力学曲线和Ct值对检样进行结果分析。由于本发明专利技术利用实时荧光PCR技术来检测水产品食物过敏原基因Par和TM,相对于其它方法,该技术具有灵敏度高、检测时间短和可以定量分析等优点,可用于水产品的未知品种或混合样品中过敏原基因的定性筛选、定量分析和确认鉴定。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及食物过敏原基因的检测,特别是涉及检一种检测水产 品食物过敏原基因的实时荧光聚合酶链式反应(PCR)方法,该方法 主要用于鱼类小清蛋白(Par)和甲壳类原肌球蛋白'(TM)基因的实 时荧光PCR检测。
技术介绍
食物过敏医学上也称变态反应。引起食物过敏反应的物质叫做食 物过敏原,如鱼、虾、蟹、牛奶、蛋类等。其反应机理为过敏原进入 机体以后,会导致机体发生正常或过度免疫应答,即超敏反应。当再 次接触相同过敏原时多个IgE分子和抗体结合,引起IgE的Fc端结 构改变,导致细胞脱颗粒,释放组胺、5-羟色胺、白三烯等生物呼吸 活性物质并作用于效应器官,表现为平滑肌收縮、毛细血管扩张、通 透性增加、皮肤过敏、呼吸道过敏、造血系统过敏甚至过敏性休克(赵 俊芳,等.食物过敏原检测及其应用前景.中华检验医学杂志,2007, 8: 948-950)。近年来食物过敏问题已引起广大消费者、食品生产者和科学研究 者的普遍关注。根据流行病学调査,全球约有2%-2. 5%的成人受到食 物过敏疾病的困扰,婴幼儿的发病率更高,达到4%-6%,儿童约为 2%-3%。在联合国粮农组织公布的全球八大类过敏食物中,鱼类和甲 壳类水产品是其中重要的两大类,其主要过敏原分别为鱼类小清蛋白 (Par)和甲壳类原肌球蛋白(TM) (Food and Agriculture Organization. Report of the FAO technical consultation on foodallergies. Rome, Italy. 1995.)。对于食物过敏目前无特别的治疗方法,严格避免接触过敏食物是 最有效的方法。常用的检测过敏原方法有体内过敏原点刺试验、体外 检测特异性IgE (RAST抑制实验和EAST抑制实验)、双盲食物激发 试验和酶联免疫吸附试验等。这些方法中,体内过敏原点刺试验易出 现假阳性;RAST抑制实验和EAST抑制实验的不足是对人体血清的依 赖性,血清是很难保证一致的,因此该方法难以标准化;双盲食物激 发试验易受其它因素影响,实践中也不易操作,实验剂量、安慰剂及 双盲控制等环节还有待完善;酶联免疫吸附试验对于微量蛋白难以检 测(赵俊芳,等.食物过敏原检测及其应用前景.中华检验医学杂志, 2007, 8: 948-950)。近年来基因检测方法(如PCR、核酸杂交)以其敏感性高、特异 性好、操作简便而倍受检验工作者的青睐。但是常用的PCR检测技术 仍需经历一个对扩增产物进行电泳分析的过程,时间耗费在所难免, 而且电泳过程中所使用的溴化乙啶染料对人和环境都有不同程度的 危害 (Lee C Y, et aL Detection of pathogenic bacteria in shellfish using multiplex PCR followed by CovaLink NH microwell plate sandwich hybridization. Journal of Microbiology Methods, 2003, 53: 199-209)。实时荧光PCR的扩增与产物分析全过程均在 单管封闭条件下进行,并通过微机控制,实现了对PCR检测进行实时 监测和自动分析的目标,也从根本上解决了常规PCR可能发生的假阳 性污染问题。但目前尚无采用实时荧光PCR方法来检测水产品食物过 敏原基因,因此,公众迫切需要将水产品食物过敏原基因检测方法应 用于实践
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种可定量、快速、灵敏检出水产品食物过敏原的实时荧光PCR方法。为实现上述目的,本专利技术的技术解决方案是提取样品总RNA, 通过SYBR Green或TaqMan探针法实时荧光PCR技术分别检测水产品 食物过敏原基因Par和TM,以及内标基因P-actin,依据扩增动力 学曲线和Ct值对检样进行结果分析。本专利技术具体包括以下步骤-(1) 设计合成用于检测水产品食物过敏原的3组引物及探针。 Par基因的上游引物5, -ATGGCATTCGCTGGAATTCTG-3', Par基因的下游引物5, -TGCCATTTATGCCTTGACCAG-3',Par基因的探针5, -FAM-AGGGCTGCCAAGCTGCTGACTCC-TAMRA-3,; TM基因的上游引物,TM-1: 5, -CGCATGGACGCCATCAAGAAGAAGATG -3,,TM基因的上游引物5, -AGGTTMTAGCCAGACAGTTCGCT-3,, TM基因的探针5, -FAM-AGCAGCTGTCCGCCGCTAACACTAAG -TAMRA-3,;actin基因的上游引物5, -AGAGCAAGAGAGGTATCTTGA-3,, actin基因的上游引物5, -GGCGGTCTCGTGGATACCAG-3,, actin基因的探针5' -FAM- CACGGCATCATCACTAACTGGGACGA -TAMRA-3'。(2) 实时荧光PCR检测。配制荧光PCR扩增反应体系,体系含有 PCR缓冲液、MgCl2、 dNTP、逆转录酶、RNase抑制剂,DNA聚合酶、 上游引物和下游引物、Oligo dT15、 RNA模板、灭菌超纯水(注探 针法需添加TaqMan探针);荧光PCR扩增反应条件为45_55匸逆转 录20-40min; 93-95。C预变性3—lOmin; 93-95°C/30-60S, 50_60°C/30-60S, 72°C/40-90S, 35-45循环(注:采用SYBR Green法需设 置6(TC到95-C的熔解曲线分析);检测设立阳性对照(水产品肌肉 总RNA)、阴性对照(猪肉总RNA)和空白对照(灭菌超纯水)。反 应结束后,依据荧光PCR仪器的分析软件,求出每个样品的Ct值, 依据Ct值和扩增动力学曲线对检样进行分析。本专利技术可以制成用于检测水产品食物过敏原基因的实时荧光PCR 试剂盒。由于本专利技术采用SYBR Green或TaqMan探针法实时荧光PCR检测 水产品食物过敏原基因。SYBR Green是一种与DNA双链结合的荧光 染料,当与DNA双链结合时发出荧光;当DNA解链时,SYBR Green 被释放出来,荧光信号急剧减弱,反应体系中荧光信号强度代表了双 链DNA分子的数量;但SYBR Green染料能与所有DNA双链结合,因 此必须设置熔解曲线来分析扩增产物的特异性(即目标核酸序列的熔 解温度,Tm) 。 TaqMan探针是一种能与PCR产物杂交的寡核苷酸探 针,探针两端分别标记荧光报告基团和淬灭基团;探针完整时,报告 基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,DNA聚合酶的外 切酶活性将探针降解,破坏了两个荧光分子之间的能量传递,从而发 出荧光;切割下来的荧光分子数与PCR产物的数量成正比,即荧光信 号的累积与PCR产物形成完全同步(Ke L D, et al. A reliability test of standard-based quantitative PCR - exogenous vs endogenous standards. Molecular and Cellular Prob本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种检测水产品食物过敏原基因的实时荧光PCR方法,其特征在于:其步骤包括提取样品总RNA,通过SYBR Green或TaqMan探针法实时荧光PCR技术分别检测水产品食物过敏原鱼类小清蛋白(Par)和甲壳类原肌球蛋白(TM)基因,以及内标 基因β-actin,依据扩增动力学曲线和Ct值对检样进行结果分析。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:刘光明曹敏杰蔡慧农
申请(专利权)人:集美大学
类型:发明
国别省市:92[中国|厦门]

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