用于提供波长可调的激发光束的系统、方法和产品技术方案

本发明专利技术描述一种扫描探针阵列的方法。该方法包括调谐激发光到多个波长，各波长都在与一种或多种靶分子相关联的荧光标记物的激发范围内；并将调谐的各波长的激发光指向探针阵列。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术总体上涉及生物材料检验，更具体地，本专利技术涉及提供波长可调的激发光以激发与生物探针阵列相关的多种荧光团并检测从各荧光团响应激发光的发射。现有技术合成的核酸探针阵列，例如AffymetrixGeneChip探针阵列，和点样探针阵列，已经被用于产生空前大量的生物系统信息。例如，可以从Affymetrix，Inc.of Santa Clara，California获得的GeneChip人类基因组U133Plus 2.0探针阵列，包括一个含1000000个独特的寡核苷酸特征的微阵列，其覆盖了代表超过33000个人类基因的超过47000个转录子和变体。对来自这种微阵列的表达数据的分析可以导致新药物和新诊断工具的开发。
技术实现思路
针对这些和其他的需要的系统、方法和产品在此利用示例性的和非限制的实现来进行描述。各种替换、修改和等同都是可能的。例如，此处使用分析来自由Affymetrix417TM或427TM阵列仪产生的生物材料阵列的数据的示例性实现来描述特定系统、方法和计算机软件产品。其他示例性的实现涉及来自AffymetrixGeneChip探针阵列的数据。然而，这些系统，方法和产品可以应用于很多其他类型的探针阵列，和更通常的，可应用于根据其他现有技术和/或将来可能发展的技术生产的许多并行生物分析。例如此处描述的该系统、方法和产品可以应用于核酸、从cDNA克隆产生的PCR产物、蛋白、抗体或许多其他生物材料的类似的分析。这些材料可以分布在载玻片(通常用于点样阵列)上，GeneChip阵列的基材上，或珠子上，光纤上，或其他基材或介质上，其可以包括载玻片或其他基材顶层的聚合物涂层或其他层。此外，探针不需要固定在基材之内或其上，并且，如果固定，则不需要以规则图案或阵列来设置。术语“探针阵列”将在下文中通常用于广泛地表示所有这些类型的阵列和并行生物分析。在一个实施例中，描述了扫描生物探针阵列的系统。该系统包括包含多个设置于其上的探针的生物探针阵列，其中一种或者多种第一探针与第一标记物有关，一种或者多种第二探针与第二标记物有关；和提供第一波长和第二波长的光的光源，其中第一波长在第一标记物的激发范围之内，第二波长在第二标记物的激发范围之内。还描述一种用于扫描探针阵列的方法。该方法包括调谐激发光到多个波长，每一都在与一种或者多种靶分子有关的荧光标记物的激发范围之内；和将调谐的各波长激发光指向探针阵列。此外，描述了为探针阵列提供多波长光的系统。该系统包括调谐激发光到多个波长的装置，各波长都在与一种或者多种靶分子有关的荧光标记物的激发范围之内；将各波长激发光指向探针阵列的装置；和检测各第二波长的光的检测器，其中第二波长响应于第一波长而发射。另外描述一种用于将多波长光指向探针阵列并检测发射光的系统。该系统包括扫描器以调谐激发光到多个波长，各波长都在与一种或者多种靶分子有关的荧光标记物的激发范围之内，并检测各第二波长的光，其中第二波长响应于第一波长而发射。上述实施例和实现不是必然彼此包含或彼此排斥的，并可以以任何不矛盾的方式或其他的可能来组合，而不管它们是否与相同或不同的实施例或实现相联系。对一个实施例或实现的描述不用于限制其他的实施例和/或执行。此外，任何一种或多种在本说明书其他地方描述的功能、步骤、操作或技术可以在替换性的实现中与
技术实现思路
中描述的一种或多种功能、步骤、操作或技术组合。因此，上述实施例和实现是示例性的而不是限制性的。附图说明当结合附图时，从下文的详述说明中，上述特征和进一步的特征将更加清楚。在附图中，相同的附图标记表示相同的结构或方法步骤，附图标记最左边的数字表示引用的部分首次出现的图的编号(例如，部分100首次出现在图1中)。在功能框图中，矩形通常表示功能元件而菱形通常表示数据。在方法流程图中，矩形通常表示方法步骤，菱形通常表示判定部分。然而所有这些约定都是用作代表性的或示例性的，而不是限制性的。图1是计算机系统和扫描器仪器的一个实施例的功能框图；图2是包括扫描器光学件和检测器的图1的计算机系统和扫描器仪器的一个实施例的功能模块图；图3是图2的扫描器光学件和检测器的一个实施例的简化的图示，其包括波长可调的源和波长调节元件；和图4是方法的一个实施例的功能框图，该方法调谐激发光束，将该光束指向与探针阵列相关联的一个或多个位置，并检测发射。具体实施例方式a)总述本专利技术具有许多优选实施例，以下的描述依赖于许多用以获得本领域人员公知的细节的专利、专利申请和其他的参考文献。因此，当在下文中引用或以其他方式参考专利、专利申请和其他的参考文献时，应当理解为出于各种目的及引用的目的，其被以全文引入作为参考。如在本申请中所应用的，单数形式“一”“一种”包括复数个引用形式，除非上下文明确指明不同的方式。例如，术语“一种试剂”包括多个试剂，包含其混合物。个体不限于人，而是也可以包括其他生物包括但不限于哺乳动物、植物、细菌、或来自上述任何生物的细胞。在整个专利技术公开中，本专利技术的多种方面可以表示为范围形式。应当理解，以范围形式的描述只是为了方便和简洁，不应当被认为是对专利技术范围的僵化的限制。因此，范围的说明应当被认为是已明确公开所有可能的子范围以及该范围内单独的数值。例如，对范围从1到6的描述应当认为已明确地公开子范围例如从1到3、从1到4、从1到5、从2到4、从2到6、从3到6等，以及该范围内单独的数值，例如1、2、3、4、5和6。无论范围有多宽，这同样适用。本专利技术的实践可以采用，除非有另外的说明，本领域技术范畴内的有机化学、聚合物技术、分子生物学(包括重组技术)、细胞生物学、生物化学和免疫学的现有的技术和说明。这样的现有技术包括聚合物阵列合成、杂交、连接和使用标记物检测杂交。合适的技术具体的示例可以参考下文的实施例。然而，当然也可以使用其他等同的现有方法。这样的现有技术和描述可以在如下的标准实验室手册中找到，例如Genome AnalysisA Laboratory Manual Series(基因组分析实验室手册系列)(Vols.I-IV)，Using AntibodiesA Laboratory Manual(使用抗体实验室手册)，CellsA Laboratory Manual(细胞实验室手册)，PCRPrimerA Laboratory Manual(PCR引物实验室手册)，和MolecularCloningA Laboratory Manual(分子克隆实验室手册)(全部来自ColdSpring Harbor Laboratory Press)，Stryer，L.(1995)Biochemistry(生物化学)(4th Ed.)Freeman，New York，Gait，″Oligonucleotide SynthesisAPractical Approach(寡核苷酸合成实用方法)″1984，IRL Press，London，Nelson and Cox(2000)，Lehninger，Principles of Biochemistry(生物化学原理)3rd Ed.，W.H.Freeman Pub.，New York，NY and Berg等(2002)Biochemistry，5th Ed本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种扫描生物探针阵列的系统，包括：生物探针阵列，其包含设置于其上的多个探针，其中一个或多个第一探针与第一标记物相关联，和一个或多个第二探针与第二标记物相关联；和光源，其提供第一波长和第二波长的光，其中该第一波长在第一标记物的 激发范围内，和该第二波长在第二标记物的激发范围内。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：格雷戈里C洛尼，内森K韦纳，
申请(专利权)人：阿菲梅特里克斯公司，
类型：发明
国别省市：US[美国]