本发明专利技术公开了一种对个体的肿瘤（如肝癌）的易感性和／或预后进行诊断的方法它包括步骤：检测该个体的ＬＬＧＬ１基因、转录本和／或蛋白，并与正常的ＬＬＧＬ１基因、转录本和／或蛋白相比较，存在差异就表明该个体患肿瘤的可能性高于正常人群和／或已经患有肿瘤。本发明专利技术还提供了相应的检测试剂盒。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物
，具体地说，本专利技术涉及一组LLGL1变异体，适用于肝癌组织学分级和判断病人易感性和/或预后。
技术介绍
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma，HCC)是常见恶性肿瘤之一，在全世界范围内肝癌的发病率居于恶性肿瘤第五位(＞500,000/年)，并且肝癌的死亡率高，是肿瘤死亡的第三大原因(Block，T.M.等，Molecular viral oncology of hepatocellularcarcinoma.Oncogene 22(33)5093-107.2003)。这与肝癌的发病特点有很大的关系，肝癌发病通常比较隐秘，早期诊断率低，临床治疗效果差，确诊后五年生存率＜5％。肝癌的发病目前认为与HBV(肝炎B病毒，hepatitis B virus)，HCV(肝炎C病毒，hepatitis C virus)感染等可以导致肝组织炎症性病变及肝硬化等因素有关，而对于他的发病机理还不清楚(Brnix，J等，Focus on hepatocellular carcinoma.Cancer Cell 5(3)215-9.2004)。而目前对于肝癌的治疗方案还主要是基于肝癌的大小，个数这类影像诊断指标，而没有特异性的分子指标指导临床治疗。随着肿瘤癌基因，抑癌基因及其它相关基因的研究深入，肿瘤被认为是一种多基因异常的疾病，对肿瘤实行个体化，预见性的治疗有利于提高肿瘤患者的无瘤生存期及绝对生存期。因此，确定肝癌相关基因及其参与肝癌发病机理，为肝癌个体化和预见性治疗提供基础，也为新的治疗方案提供靶点，从而有利于提高肝癌的治愈率(Thorgeirsson，S.等，Huntingfor tumor suppressor genes in liver cancer.Hepatology 37(4)739-41.2003)。lgl(果蝇幼虫巨大致死性基因，lethal giant lavae)，dlg(成虫盘巨大基因，discslarge，)和scribble(紊乱基因，scrib)三个基因是果蝇的抑癌基因(tumor suppressor)，这三个基因在功能上有协同作用。其中任何一个基因发生突变的细胞及生物学表型相似，表现为果蝇幼虫的先前视中枢及成虫盘会发生恶性肿瘤样的增生，细胞过度增生失去原有的组织结构(Wodarz，A等，Tumor suppressorslinking cell polarityand growth control.Curr Biol 10(17)R624-6.2000；Bilder，D等，Cell polaritysquaring the circle.Curr Biol 11(4)R132-5，2001)。lgl-/-细胞植入成虫的体内会形成肿瘤并且会发生转移(Bilder，D等，Epithelial polarity and proliferation controllinksfrom the Drosophila neoplastic tumor suppressors.Genes Dev 18(16)1909-25.2004)。另外还有证据显示这些基因的失活可能会促进肿瘤的转移(Pagliarini，R等，Agenetic screen in Drosophila for metastatic behavior.Science 302(5648)1227-31.2003)。人果蝇同源性致死性巨大基因(lethal giant larvae homolog 1，LLGL1)是人与果蝇lgl同源的基因，同源性达到27％。lgl在果蝇中起着抑癌基因的作用，如果lgl发生突变，功能失活，原有的组织形态消失，并且这种增生的组织接种到成虫体内会不停的增生并发生广泛的转移”(Watson，K.L.Drosophila in cancer researchthefirst fifty tumor suppressor genes.J Cell Sci Suppl 1819-33.1994)。许多研究证明lgl在进化上很保守(Baek，K.H.等，Structural and functional conservation of the lglrecessive oncogenes(Review).Int J Oncol 24(5)1257-61.2004)。例如在线虫，果蝇，哺乳动物及人中都存在同源基因，并且在结构上都包含有多个WD40区及保守的丝氨酸序列；在功能上，来自各个种属的lgl之间可以进行功能替代(Kim，Y.S.等，Functional and expression analyses of mgl-1，a mouse orthologue of lethal giantlarvae recessive oncogene.Int J Oncol 23(6)1515-9.2003；Kim，Y.K.等，Complementation of temperature tolerance by rat Rgl-1 recessive oncogene in theabsence of Saccharomyces cerevisiae Sop genes.Oncol Rep 12(5)1105-8.2004)。LLGL1位于人的17号染色体近着丝点区，17p11.2-12，近来的分子学研究显示这一区域可能存在与神经外胚层肿瘤相关基因。目前已有报道显示LLGL1在63％的肺癌，76％的乳腺癌，50％的卵巢癌，53％的前列腺癌及40％的黑色素瘤中表达下降或不表达，支持LLGL1有可能也是一个抑癌基因(Grifoni，D.等，Thehuman protein Hugl-1 substitutes for Drosophila lethal giant larvae tumour suppressorfunction in vivo.Oncogene 23(53)8688-94.2004)。近来Schimanski等人的研究显示LLGL1在结肠癌的低表达与结肠癌的淋巴结转移有关，在293细胞过表达LLGL1会抑制细胞的迁移(Schimanski，C.C.等，Reduced expression of Hugl-1，the humanhomologue of Drosophila tumour suppressor gene lgl，contributes to progression ofcolorectal cancer.Oncogene.2005)。由于癌症是危害人类健康的主要疾病之一。为了有效地治疗和预防肿瘤(如肝癌)，目前人们已越来越关注肿瘤的早期诊断和预后，而目前本领域对于LLGL1是否是在肝癌的发生发展中的作用还不清楚。因此，现有技术迫切需要将LLGL1抑癌基因与肝癌的发生发展相关联，从而为肝癌的诊断和预后提供依据。
技术实现思路
本专利技术的目的之一是提供体外检测LLGL1的基因和转录本是否存在变异的方法。本专利技术的目的之二是提供一组分离的LLGL1突变体核苷酸和氨基酸序列，用以通过细胞生物学实验分析LLGL1的突变体对细胞生物学特征的影响，从而进一步验证本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种体外检测ＬＬＧＬ１的基因和转录本是否存在变异的方法，其特征在于，它包括步骤：检测所述的ＬＬＧＬ１基因或转录本，并与正常的ＬＬＧＬ１基因、转录本的核苷酸序列相比较，存在选自下组的差异就表明ＬＬＧＬ１的基因和转录本存在变异： １）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第１１５位至１７９６位碱基被删除， ２）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第１５８位碱基被删除， ３）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第２８２位至１７５９位碱基被删除， ４）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第３４７位至１５５７位碱基被删除， ５）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第３６５位至１５１５位碱基被删除， ６）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第３９２位和３９３位碱基中插入序列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２的３８个碱基， ７）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第４１６位至１６９２位碱基被删除， ８）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第７１５位至１２８４位碱基、第１３５３位至１５０６位碱基和第１６１６位至１９０８位碱基被删除， ９）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第８３１位至１８８５位碱基被删除且于此处插入序列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３的６７个碱基， １０）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第９９８位至１６３４位碱基被删除， １１）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第１１２９位至１４４７位碱基被删除， １２）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第１３５３位至１５０６位碱基和第１６１６位至１８０８位碱基被删除， １３）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第９２位至１６２７位碱基被删除， １４）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第３０８位至１３８１位碱基被删除， １５）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第４３５位至１６１９位碱基被删除， １６）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第６４４位至１７５９位碱基被删除， １７）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第７１５位至８６７位碱基被删除， １８）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第９６９位至１２８６位碱基被删除的ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或第９６６位至１２８４位碱基被删除， １９）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第７１６位至１２６７位碱基被删除， ２０）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１，其中第１１３５位至１４３１位碱基被删除，...
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：陈正军，芦雪峰，
申请(专利权)人：中国科学院上海生命科学研究院，
类型：发明
国别省市：31[中国|上海]
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