食管癌辅助诊断相关的SNPs标志物及其应用制造技术

本发明专利技术涉及基因工程及肿瘤学领域，公开了食管癌辅助诊断相关的SNPs标志物、相关特异性扩增引物和特异性探针引物；还公开了SNPs标志物、特异性扩增引物和特异性探针引物的相关应用；还公开了食管癌辅助诊断试剂盒。本发明专利技术的SNPs遗传标志物稳定性好，易于检测，本发明专利技术的诊断试剂盒具有精简、稳定性高、能够预测疾病状态和遗传风险的优势，有助于临床医生快速掌握患者发生食管癌的遗传风险，以便于进行早期诊断、个体化预防和治疗，为食管癌高危人群的筛查和干预提供决策依据。

【技术实现步骤摘要】
食管癌辅助诊断相关的SNPs标志物及其应用
本专利技术涉及基因工程及肿瘤学领域，具体涉及食管癌辅助诊断相关的SNPs标志物及其应用。
技术介绍
食管癌是常见的消化系统肿瘤之一，据统计，2015年我国食管癌发病48万例，死亡37万例，位居中国居民癌症死因谱中的第四位，严重危害着我国居民的生命健康。近年来，随着我国的医学发展和不断进步，食管癌的发病率和死亡率呈逐年下降的趋势，但由于食管癌早期发现较为困难，尚缺乏早期、特异、敏感的筛查指标，其造成的疾病负担依然很大。因此，寻找有效的标志物来评估食管癌的发病风险并筛选高危人群，并对其辅以食管癌的常规检查，从而实现食管癌患者的早发现和早诊断，将大大降低食管癌的发病率和死亡率。众所周知，食管癌的发生发展是多因素参与的过程，是由环境因素(如饮酒)、遗传因素以及两者的交互作用共同导致的结果。然而，在相同的环境暴露下仅有少数人发展成食管癌，提示遗传因素在食管癌的发生发展中起到了关键作用。另外，已有学者发现在中国人群中食管癌发生具有一定的遗传解释度，进一步证实了遗传因素对食管癌的效应。因此，识别食管癌风险相本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.食管癌辅助诊断相关的SNPs标志物，其特征在于，所述SNPs标志物为外周血DNA中的如下组合：rs74076695、rs10911099、rs2334892、rs12047929、rs10207968、rs2111598、rs3769025、rs2004837、rs1374910、rs6781154、rs6438069、rs3762725、rs11100914、rs6870395、rs730906、rs2915850、rs1866544、rs17774569、rs55734016、rs2050184、rs6920944、rs9689490、rs2158794、rs7805713、rs125...

【技术特征摘要】
1.食管癌辅助诊断相关的SNPs标志物，其特征在于，所述SNPs标志物为外周血DNA中的如下组合：rs74076695、rs10911099、rs2334892、rs12047929、rs10207968、rs2111598、rs3769025、rs2004837、rs1374910、rs6781154、rs6438069、rs3762725、rs11100914、rs6870395、rs730906、rs2915850、rs1866544、rs17774569、rs55734016、rs2050184、rs6920944、rs9689490、rs2158794、rs7805713、rs12532433、rs1003827、rs3807211、rs6981033、rs2099898、rs1841907、rs6991074、rs1927602、rs1063192、rs3731239、rs1328996、rs10962033、rs825809、rs12418574、rs2298464、rs11215374、rs1147052、rs17079434、rs12871511、rs856675、rs10136872、rs11625722、rs113099571、rs11071537、rs17237466、rs10519035、rs1878187、rs10515129、rs9959071、rs60764487、rs6075045、rs6032259、rs2839519、rs1319436和rs1547014。


2.权利要求1所述的SNPs标志物在建立食管癌发病遗传风险预测模型或在制备食管癌辅助诊断试剂盒中的应用。


3.权利要求1所述的SNPs标志物的特异性扩增引物，其特征在于，引物序列如下：
rs74076695的引物序列为SEQIDNO.1和SEQIDNO.2；rs10911099的引物序列为SEQIDNO.5和SEQIDNO.6；rs2334892的引物序列为SEQIDNO.9和SEQIDNO.10；rs12047929的引物序列为SEQIDNO.13和SEQIDNO.14；rs10207968的引物序列为SEQIDNO.17和SEQIDNO.18；rs2111598的引物序列为SEQIDNO.21和SEQIDNO.22；rs3769025的引物序列为SEQIDNO.25和SEQIDNO.26；rs2004837的引物序列为SEQIDNO.29和SEQIDNO.30；rs1374910的引物序列为SEQIDNO.33和SEQIDNO.34；rs6781154的引物序列为SEQIDNO.37和SEQIDNO.38；rs6438069的引物序列为SEQIDNO.41和SEQIDNO.42；rs3762725的引物序列为SEQIDNO.45和SEQIDNO.46；rs11100914的引物序列为SEQIDNO.49和SEQIDNO.50；rs6870395的引物序列为SEQIDNO.53和SEQIDNO.54；rs730906的引物序列为SEQIDNO.57和SEQIDNO.58；rs2915850的引物序列为SEQIDNO.61和SEQIDNO.62；rs1866544的引物序列为SEQIDNO.65和SEQIDNO.66；rs17774569的引物序列为SEQIDNO.69和SEQIDNO.70；rs55734016的引物序列为SEQIDNO.73和SEQIDNO.74；rs2050184的引物序列为SEQIDNO.77和SEQIDNO.78；rs6920944的引物序列为SEQIDNO.81和SEQIDNO.82；rs9689490的引物序列为SEQIDNO.85和SEQIDNO.86；rs2158794的引物序列为SEQIDNO.89和SEQIDNO.90；rs7805713的引物序列为SEQIDNO.93和SEQIDNO.94；rs12532433的引物序列为SEQIDNO.97和SEQIDNO.98；rs1003827的引物序列为SEQIDNO.101和SEQIDNO.102；rs3807211的引物序列为SEQIDNO.105和SEQIDNO.106；rs6981033的引物序列为SEQIDNO.109和SEQIDNO.110；rs2099898的引物序列为SEQIDNO.113和SEQIDNO.114；rs1841907的引物序列为SEQIDNO.117和SEQIDNO.118；rs6991074的引物序列为SEQIDNO.121和SEQIDNO.122；rs1927602的引物序列为SEQIDNO.125和SEQIDNO.126；rs1063192的引物序列为SEQIDNO.129和SEQIDNO.130；rs3731239的引物序列为SEQIDNO.133和SEQIDNO.134；rs1328996的引物序列为SEQIDNO.137和SEQIDNO.138；rs10962033的引物序列为SEQIDNO.141和SEQIDNO.142；rs825809的引物序列为SEQIDNO.145和SEQIDNO.146；rs12418574的引物序列为SEQIDNO.149和SEQIDNO.150；rs2298464的引物序列为SEQIDNO.153和SEQIDNO.154；rs11215374的引物序列为SEQIDNO.157和SEQIDNO.158；rs1147052的引物序列为SEQIDNO.161和SEQIDNO.162；rs17079434的引物序列为SEQIDNO.165和SEQIDNO.166；rs12871511的引物序列为SEQIDNO.169和SEQIDNO.170；rs856675的引物序列为SEQIDNO.173和SEQIDNO.174；rs10136872的引物序列为SEQIDNO.177和SEQIDNO.178；rs11625722的引物序列为SEQIDNO.181和SEQIDNO.182；rs113099571的引物序列为SEQIDNO.185和SEQIDNO.186；rs11071537的引物序列为SEQIDNO.189和SEQIDNO.190；rs17237466的引物序列为SEQIDNO.193和SEQIDNO.194；rs10519035的引物序列为SEQIDNO.197和SEQIDNO.198；rs1878187的引物序列为SEQIDNO.201和SEQIDNO.202；rs10515129的引物序列为SEQIDNO.205和SEQIDNO.206；rs9959071的引物序列为SEQIDNO.209和SEQIDNO.210；rs60764487的引物序列为SEQIDNO.213和SEQIDNO.214；rs6075045的引物序列为SEQIDNO.217和SEQIDNO.218；rs6032259的引物序列为SEQIDNO.221和SEQIDNO.222；rs2839519的引物序列为SEQIDNO.225和SEQIDNO.226；rs1319436的引物序列为SEQIDNO.229和SEQIDNO.230；rs1547014的引物序列为SEQIDNO.233和SEQIDNO.234。


4.用于检测权利要求1所述的SNPs标志物的特异性探针引物，其特征在于，探针引物为：
rs74076695的引物序列为SEQIDNO.3...

【专利技术属性】
技术研发人员：张正东，王美林，辛俊逸，杜牧龙，邬燕玲，刘晗婷，黎书炜，储海燕，
申请(专利权)人：南京医科大学，
类型：发明
国别省市：江苏;32