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基于受体结合模式的有机物ER亲合力快速筛选预测方法技术

技术编号:2580549 阅读:257 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术公开了一种基于受体结合模式的有机物ER亲合力快速筛选预测方法。根据已有ER亲合力数据污染物与受体结合能、氢键作用模式和到达受体作用位点难易程度等受体结合模式与亲合力指标的关系建立基于受体结构的QSAR判别模型与预测模型,并将其应用到ER亲合力未知化合物的ER亲合力判别预测。采用本发明专利技术方法筛选预测环境可疑EDCs和激素受体亲合力的强弱,对很宽范围活性指标的结构各异化合物均可进行判别筛选与预测,方法成本低廉、简便可靠,能够节省大量的人力、物力、财力,平均预测能力达到80%以上,预测结果对相应化合物的环境管理和生态风险评价具有重要的指导意义。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及环境可疑内分泌干扰物生物活性的筛选和预测方法,具体说是基于受体结合模式的可疑环境内分泌干扰物雌激素受体(estrogen receptor,ER)亲合力筛选和预测方法。
技术介绍
环境内分泌干扰物(endocrine disrupting chemicals,EDCs)是指干扰生物体内维持自身稳定及调节发育过程中激素的产生、释放、代谢、结合、排泄、交互作用的外源性物质,也叫环境荷尔蒙/激素。EDCs对野生动物与人类的危害早在上世纪90年代就得到了人们的关注。1996年美国环保局列出60种内分泌干扰物。1997年世界野生动物基金会列出68种。1998年日本在全国范围内进行了水环境中的内分泌干扰物普查并于1999年公布了75种内分泌干扰物。目前已确认的环境内分泌干扰物超过100种,其中大多数属于持久性有机物,在环境中污染范围广、影响大、时效长,严重的威胁着人类生存。EDCs已成为继温室效应全球变暖和臭氧层破坏之后又一严重的全球性环境公害问题,属第三代环境污染物,关于EDCs的研究已经成为当前国际环境科学研究的热点领域。鉴于大量环境污染物是潜在的环境激素类物质,对大量化合本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种基于受体结合模式的有机物ER亲合力快速筛选预测方法,包括以下步骤:    (1)根据化合物相对亲合力大小,将已知雌激素受体亲合力的有机污染物按其与雌激素受体亲合力强弱分为三类或四类;每类至少随机抽取一种作为预测组,其余组成训练组;相对亲合力指标采用logRBA,其中logRBA<-3,-3≤logRBA<0,logRBA≥0分别对应于极弱ER亲合力、弱ER亲合力、强ER亲合力;logRBA≥0时的情况还可再分为两类,即0≤logRBA<1和logRBA≥1,分别对应中等强度亲合力、高亲合力;    (2)根据已有雌激素受体亲合力数据实验测定所使用受体的物种和亚型,从蛋白质数据库中选择与不同...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:张爱茜高常安蔺远穆云松王连生
申请(专利权)人:南京大学
类型:发明
国别省市:84[中国|南京]

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