用于肺癌治疗和诊断的组合物和方法技术

本发明专利技术公开了用于癌症例如肺癌的治疗和诊断的组合物和方法。所述组合物可以含有一或多种肺肿瘤蛋白质、其免疫原部分、或编码这些部分的多核苷酸。或者，治疗组合物可以含有表达肺肿瘤蛋白质的抗原呈递细胞、或对表达该蛋白质的细胞具有特异性的Ｔ细胞。这些组合物可以用于例如预防和治疗肺癌等疾病。本发明专利技术还提供了基于对样品中肺肿瘤蛋白质、或编码该蛋白质的ｍＲＮＡ的检测的诊断方法。（*该技术在2020年保护过期，可自由使用*）

【技术实现步骤摘要】
专利技术
一般地，本专利技术涉及癌症如肺癌的治疗和诊断。更具体地，本专利技术涉 及含有肺肿瘤蛋白质的至少一部分的多肽、和编码该多肽的多核苷酸。 这些多肽和多核苷酸可以用于预防和治疗肺癌、以及对这些癌症进行诊 断和监测的组合物中。 专利技术背景癌症是全世界显著的健康问题。尽管在癌症的检测和治疗方面已取得法。目前的治疗一般是基于化疗或手术与辐射的联合，它们一直被证明 对于许多患者是不适当的。在美国肺癌是男性和女性中癌症死亡的主要原因，据报道1994年就 估计有172,000例新病例。对于所有的肺癌患者，无论其诊断时处于何 疾病阶段，5年的存活率仅为13%。这与当该疾病仍处于局部时检测到 的病例中46%的5年存活率形成对照。然而，仅有16%的肺癌在该疾病 扩散前被发现。由于通常一直要到该疾病达到晚期时才可观察到临床症状，故早期检 测是困难的。目前，借助胸部x-射线、对痰中所含细胞类型的分析、和 支气管道的光纤检查进行诊断。治疗方案由癌症的类型和阶段来确定， 包括手术、放疗和/或化疗。尽管对于这种和其它癌症的治疗已有了相当多的研究，但肺癌仍难于 有效地获得诊断和治疗。因此，在此领域需要有检测和治疗这些癌症的 改进方法。本专利技术满足了这些需要并进一步提供了其它的相关优点。 专利技术概述简而言之，本专利技术提供用于癌症如肺癌的诊断和治疗的组合物和方 法。 一方面，本专利技术提供含有肺肿瘤蛋白质或其变体的至少一部分的多肽。某些部分和其它变体具有免疫原性，以致该变体与抗原特异性抗血 清的反应能力基本上不减弱。在一些实施方案中，该多肽含有由选自下组的多核苷^列编码的序列:(a)SEQIDNO: 1、 11-13、 15、 20、 23-27、 29、 30、 33、 34、 39、 41、 43—46、 51、 52、 57、 58、 60、 62、 65—67、 69-71、 74、 76、 79、 80、 84、 86、 89—92、 95、 97、 98、 101、 110、 111、 113—119、 121-128、 130-134、 136、 138、 139、 141、 143、 146—151、 153、 154、 157—160、 162-164、 167—178、 180、 181、 183、 186—190、 192、 193、 195—220、 224、 226—231、 234、 236、 237、 240、 241、 244—246、 248、 254、 255、 261、 262、 266、 270、 275、 280、 282、 283、 288、 289、 290、 292、 295、 301、 303、 304、 309、 311、 341-782、 784、 785、 790、 792、 794、 796、 800-804、 807、 808和810-826中所示序列；(b) SEQ ID NO: 1、 11-13、 15、 20、 23-27、 29、 30、 33、 34、 39、 41、 43—46、 51、 52、 57、 58、 60、 62、 65—67、 69-71、 74、 76、 79、 80、 84、 86、 89—92、 95、 97、 98、 101、 110、 111、 113—119、 121—128、 130—134、 136、 138、 139、 141、 143、 146-151、 153、 154、 157—160、 162-164、 167—178、 180、 181、 183、 186-190、 192、 193、 195—220、 224、 226—231、 234、 236、 237、 240、 241、 244— 246、 248、 254、 255、 261、 262、 266、 270、 275、 280、 282、 283、 288、 289、 290、 292、 295、 301、 303、 304、 309、 311、 341—782、 784、 785、 790、 792、 794、 796、 800-804、 807、 808和810-826中所示序列的变 体；和(c) (a)或(b)之序列的互补序列。在特定实施方案中，本专利技术的 多欣含有胂瘤蛋白质的至少一个部分，所述肿瘤蛋白质包括选自SEQ ID NO: 786、 787、 791、 793、 795、 797-799、 806、 809和827中所示序列和其 变体的氨基酸序列。本专利技术还提供编码上述多肽的多核苷酸，或其部分(例如编码肺胂瘤 蛋白质至少15个氨基酸残基的部分)，含有这些多核苷酸的表达载体和 用这些表达载体转化或转染的宿主细胞。在其它方面，本专利技术提供含有上述多肽或多核苷酸和生理上可接受载 体的药物组合物。在本专利技术的一个相关方面，提供用于预防或治疗用途的疫苗、或免疫原性组合物。这些疫苗含有上述多肽或多核苷酸和免疫刺激剂。本专利技术还提供药物组合物，其含有(a)特异与肺肿瘤蛋白质结合 的抗体或其抗原结合片段；和(b)生理学上可接受载体。在其它方面，本专利技术提供药物组合物，其含有(a)表达上述多肽的 抗原呈递细胞和(b)可药用载体或赋形剂。抗原呈递细胞包括树突细胞、 巨噬细胞、单核细胞、成纤维细胞和B细胞。在相关方面中，本专利技术提供疫苗或免疫原性组合物，其含有(a)表 达上述多肽的抗原呈递细胞，和(b)免疫刺激剂。本专利技术在其它方面还提供含有至少一种上述多肽的融合蛋白，以及编 码这些融合蛋白的多核普酸。在相关方面中，本专利技术提供含有融合蛋白，或编码融合蛋白的多核苷 酸，及生理上可接受载体的药物组合物。在其它方面，本专利技术还提供含有融合蛋白，或编码融合蛋白的多核香 酸，及免疫刺激剂的疫苗或免疫原性组合物。在其它方面，本专利技术提供用于抑制患者体内癌症t艮的方法，包括给 患者施用上述药物组合物或免疫原性组合物。所述患者可以患有肺癌， 在此情况下这些方法提供了对该疾病的治疗，或者可以对被认为具有患 该病危险的患者进行预防性治疗。在其它方面中，本专利技术还提供用于从生物样品中除去胂瘤细胞的方 法，包括用特异与肺肿瘤蛋白质反应的T细胞接触生物样品，其中该接 触步骤在足以允许从该样品中除去表达该蛋白质的细胞的条件和时间下 进行。在相关方面，本专利技术提供用于抑制患者体内癌症J^艮的方法，包括给 患者施用按上述方法处理过的生物样品。在其它方面，本专利技术还提供用于刺激和/或扩增肺肺瘤蛋白质特异性 T细胞的方法，包括在足以允许刺激和/或扩增T细胞的条件和时间下， 用以下一或多种物质接触T细胞(i)上述多肽；(ii)编码该多肽的多 核苷酸；和/或(iii)表达该多肽的抗原呈递细胞。本专利技术还提供含有按 上述方法制备的T细胞的分离T细胞群。在其它方面，本专利技术提供用于抑制患者体内癌症发展的方法，包括给患者施用有效量的上述T细胞群。本专利技术还提供用于抑制患者体内癌症发展的方法，包括步骤(a) 用以下一或多种物质与分离自患者的CD4+和/或CD8+T细胞一起孵育 (i)含有肺肿瘤蛋白质的至少免疫原性部分的多肽；(ii)编码该多肽 的多核苷酸；和(iii)表达该多肽的抗原呈递细胞；和(b)给患者施 用有效量的该增本文档来自技高网...

【技术保护点】
分离的多肽，其含有肺肿瘤蛋白质的至少免疫原性部分，其中该肿瘤蛋白质含有由选自下组的多核苷酸序列编码的氨基酸序列：　　　　（ａ）ＳＥＱ　　ＩＤ　　ＮＯ：１、１１－１３、１５、２０、２３－２７、２９、３０、３３、３４、３９、４１、４３－４６、５１、５２、５７、５８、６０、６２、６５－６７、６９－７１、７４、７６、７９、８０、８４、８６、８９－９２、９５、９７、９８、１０１、１１０、１１１、１１３－１１９、１２１－１２８、１３０－１３４、１３６、１３８、１３９、１４１、１４３、１４６－１５１、１５３、１５４、１５７－１６０、１６２－１６４、１６７－１７８、１８０、１８１、１８３、１８６－１９０、１９２、１９３、１９５－２２０、２２４、２２６－２３１、２３４、２３６、２３７、２４０、２４１、２４４－２４６、２４８、２５４、２５５、２６１、２６２、２６６、２７０、２７５、２８０、２８２、２８３、２８８、２８９、２９０、２９２、２９５、３０１、３０３、３０４、３０９、３１１、３４１－７８２、７８４、７８５、７９０、７９２、７９４、７９６、８００、８０２、８０４、８０７、８０８和８１１－８２６中所示序列；　　　　（ｂ）与ＳＥＱ　　ＩＤ　　ＮＯ：１、１１－１３、１５、２０、２３－２７、２９、３０、３３、３４、３９、４１、４３－４６、５１、５２、５７、５８、６０、６２、６５－６７、６９－７１、７４、７６、７９、８０、８４、８６、８９－９２、９５、９７、９８、１０１、１１０、１１１、１１３－１１９、１２１－１２８、１３０－１３４、１３６、１３８、１３９、１４１、１４３、１４６－１５１、１５３、１５４、１５７－１６０、１６２－１６４、１６７－１７８、１８０、１８１、１８３、１８６－１９０、１９２、１９３、１９５－２２０、２２４、２２６－２３１、２３４、２３６、２３７、２４０、２４１、２４４－２４６、２４８、２５４、２５５、２６１、２６２、２６６、２７０、２７５、２８０、２８２、２８３、２８８、２８９、２９０、２９２、２９５、３０１、３０３、３０４、３０９、３１１、３４１－７８２、７８４、７８５、７９０、７９２、７９４、７９６、８００、８０２、８０４、８０７、８０８和８１１－８２６之任一个中所示序列在中等严紧条件下杂交的序列；和　　　　（ｃ）（ａ）或（ｂ）之序列的互补序列。...

【技术特征摘要】
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【专利技术属性】
技术研发人员：王彤彤，CS班古尔，MJ罗迪斯，GR方格，TS韦德维克，D卡特尔，MW莱特，J曼尼恩，
申请(专利权)人：科里克萨有限公司，
类型：发明
国别省市：US[美国]