病毒基因检测报告的生成方法、装置、设备及存储介质制造方法及图纸

本申请实施例公开了一种病毒基因检测报告的生成方法、装置、设备及计算机存储介质，方法包括：获取生物样本的对象信息；获取所述生物样本的聚合酶链式反应PCR检测信息，其中，所述PCR检测信息包括至少一个检测项目的PCR检测信息；基于所述PCR检测信息中的操作信息，以及操作信息与基因型别之间的关系，确定所述检测项目对应的检测基因的型别信息；基于所述PCR检测信息中反应结果，以及反应结果与阴阳性检测结果之间的关系，确定所述检测基因的阴阳性检测信息；基于所述对象信息、所述型别信息和所述阴阳性检测信息，生成所述生物样本的病毒基因检测报告。如此，将对象信息和病毒基因的检测信息进行整合，提高生成病毒基因检测报告的工作效率。

【技术实现步骤摘要】
病毒基因检测报告的生成方法、装置、设备及存储介质
本申请涉及生物信息技术，尤其涉及一种病毒基因检测报告的生成方法、装置、设备及计算机存储介质。
技术介绍
人乳头瘤病毒(humanpapillomavirus，HPV)目前已分离出130多种，至少有15种HPV亚型能增加女性罹患宫颈癌风险，其中95％的宫颈癌由8种高危型HPV亚型所致，HPV16和HPV18为两种最常见致癌性HPV，70％以上的宫颈癌和50％以上的宫颈上皮内瘤变由这两种HPV亚型引起。因此，在宫颈癌筛查的HPV检测项目中要求对多个病毒基因的型别做出判断。同时，为了节约检测时间和资源，将多个样本同时进行HPV检测。由于HPV通过在宫颈上皮细胞内整合、复制和增生，从而引起癌前病变—宫颈上皮内瘤样病变，最后发展到宫颈浸润癌，因此，采用核酸检测的方法，如荧光定量聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction，PCR)检测，可以检测出HPV亚型。然而，荧光定量PCR检测获的结果通常为数值型，例如，荧光定量PCR检测获的结果为循环阈值(Cyclethreshold，CT)。因此，还需要根据试剂盒的说明书对PCR检测结果进行判读，才能得到样本的多个HPV亚型的检测结果。若需要完成多个样本的HPV检测，则需要花费大量的时间。且检测报告的生成过程耗时长，以及完成的检测报告缺乏统一的标准。
技术实现思路
本申请实施例提供一种病毒基因检测报告的生成方法、装置、设备及计算机存储介质。第一方面，本申请实施例提供一种病毒基因检测报告的生成方法，所述方法包括：获取生物样本的对象信息；获取所述生物样本的聚合酶链式反应PCR检测信息，其中，所述PCR检测信息包括至少一个检测项目的PCR检测信息；基于所述PCR检测信息中的操作信息，以及操作信息与基因型别之间的关系，确定所述检测项目对应的检测基因的型别信息；其中，所述检测基因包括病毒基因和内标基因；基于所述PCR检测信息中反应结果，以及反应结果与阴阳性检测结果之间的关系，确定所述检测基因的阴阳性检测信息；基于所述对象信息、所述型别信息和所述阴阳性检测信息，生成所述生物样本的病毒基因检测报告。在一些实施例中，所述获取所述生物样本的PCR检测信息，包括：根据所述对象信息中的PCR文件标识，读取目标存储区域中包含PCR检测信息的文件；根据所述包含PCR检测信息的文件，确定所述PCR检测信息。在一些实施例中，所述操作信息包括反应孔的位置信息和荧光通道的信息，所述基于所述PCR检测信息中操作信息，以及操作信息与基因型别之间的关系，确定所述检测项目对应的检测基因的型别信息，包括：基于所述PCR检测的信息中反应孔的位置信息和荧光通道的信息，以及反应孔的位置信息、荧光通道的信息和基因型别之间的关系，确定每个所述反应孔中所述荧光通道对应的检测基因的型别。在一些实施例中，所述方法还包括：根据每个所述反应孔中所述荧光通道对应的反应结果，确定所述检测基因中的每种病毒基因型别对应的反应结果，以及所述检测基因中的所述内标基因对应的反应结果；所述基于所述PCR检测信息中反应结果，以及反应结果与阴阳性检测结果之间的关系，确定所述检测基因的阴阳性检测信息，包括：基于所述每种病毒基因型别对应的反应结果、所述内标基因对应的反应结果，以及反应结果与阴阳性检测结果之间的关系，确定所述每种病毒基因型别的阴阳性检测信息以及所述内标基因的阴阳性检测信息。在一些实施例中，在所述确定所述检测基因的阴阳性检测信息之后，所述方法还包括：根据所述检测基因的阴阳性检测信息，确定所述阴阳性检测信息中呈阳性的至少一个型别的病毒基因和所述阴阳性检测信息中呈阳性的第一内标基因；根据所述至少一个型别的病毒基因的反应结果信息，以及病毒基因的反应结果与病毒基因的浓度的关系，确定所述至少一个型别的病毒基因的浓度。根据所述第一内标基因的反应结果信息，以及内标基因的反应结果与内标基因的浓度的关系，确定所述第一内标基因的浓度。在一些实施例中，所述方法还包括：基于所述至少一个型别的病毒基因的浓度和所述第一内标基因的浓度，确定所述至少一个型别的病毒基因的感染信息，并将所述感染信息添加至所述病毒基因检测报告。在一些实施例中，所述方法还包括：基于病毒基因型别，以及病毒基因型别与临床风险注解之间的关系，生成所述病毒基因的临床解读信息，并将所述临床解读信息添加至所述病毒基因检测报告。第二方面，本申请实施例提供一种病毒基因检测报告的生成装置，所述装置包括：第一获取模块、第二获取模块、基因型别确定模块、信息确定模块和生成模块；所述第一获取模块，用于获取生物样本的对象信息；所述第二获取模块，用于获取所述生物样本的聚合酶链式反应PCR检测信息，其中，所述PCR检测信息包括至少一个检测项目的PCR检测信息；所述基因型别确定模块，用于基于所述PCR检测信息中的操作信息，以及操作信息与基因型别之间的关系，确定所述检测项目对应的检测基因的型别信息；其中，所述检测基因包括病毒基因和内标基因；所述信息确定模块，用于基于所述PCR检测信息中反应结果，以及反应结果与阴阳性检测结果之间的关系，确定所述检测基因的阴阳性检测信息；所述生成模块，用于基于所述对象信息、所述型别信息和所述阴阳性检测信息，生成所述生物样本的病毒基因检测报告。第三方面，本申请实施例提供一种设备，包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序，其特征在于，所述处理器执行所述程序时以实现以如本申请任一实施例所述的病毒基因检测报告的生成方法的步骤。第四方面，本申请实施例提供一种计算机存储介质，所述计算机可读存储介质上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现本申请任一实施例所提供的病毒基因检测报告的生成方法。在本申请实施例中，获取生物样本的对象信息。获取所述生物样本的PCR检测信息，所述PCR检测信息包括至少一个检测项目的PCR检测信息。基于所述PCR检测信息中的操作信息，以及操作信息与基因型别之间的关系，确定所述检测项目对应的检测基因的型别信息，从而利用操作信息与基因型别之间的关系，能够快速确定样本的病毒基因的型别。基于所述PCR检测信息中反应结果，以及反应结果与阴阳性检测结果之间的关系，确定所述检测基因的阴阳性检测信息，从而利用反应结果与阴阳性检测结果之间的关系，能够快速准确地判读样本的病毒基因型别的阴阳性。基于所述对象信息、所述型别信息和所述阴阳性检测信息，生成所述生物样本的病毒基因检测报告。如此，将对象信息和检测信息进行整合，使得对病毒基因的数据分析和报告生成的过程简便化，能够快速生成病毒基因的检测报告，从而提高生成检测报告的工作效率，减少耗时过长的缺陷。同时，生成的检测报告中的信息包括所述对象信息、所述型别信息和所述阴阳性检测信息，检测报告包含的信息更加全面，且生成的检测报告能够提供更加标准化的本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种病毒基因检测报告的生成方法，其特征在于，所述方法包括:/n获取生物样本的对象信息；/n获取所述生物样本的聚合酶链式反应PCR检测信息，其中，所述PCR检测信息包括至少一个检测项目的PCR检测信息；/n基于所述PCR检测信息中的操作信息，以及操作信息与基因型别之间的关系，确定所述检测项目对应的检测基因的型别信息；其中，所述检测基因包括病毒基因和内标基因；/n基于所述PCR检测信息中反应结果，以及反应结果与阴阳性检测结果之间的关系，确定所述检测基因的阴阳性检测信息；/n基于所述对象信息、所述型别信息和所述阴阳性检测信息，生成所述生物样本的病毒基因检测报告。/n

【技术特征摘要】
1.一种病毒基因检测报告的生成方法，其特征在于，所述方法包括:
获取生物样本的对象信息；
获取所述生物样本的聚合酶链式反应PCR检测信息，其中，所述PCR检测信息包括至少一个检测项目的PCR检测信息；
基于所述PCR检测信息中的操作信息，以及操作信息与基因型别之间的关系，确定所述检测项目对应的检测基因的型别信息；其中，所述检测基因包括病毒基因和内标基因；
基于所述PCR检测信息中反应结果，以及反应结果与阴阳性检测结果之间的关系，确定所述检测基因的阴阳性检测信息；
基于所述对象信息、所述型别信息和所述阴阳性检测信息，生成所述生物样本的病毒基因检测报告。


2.根据权利要求1所述方法，其特征在于，所述获取所述生物样本的PCR检测信息，包括：
根据所述对象信息中的PCR文件标识，读取目标存储区域中包含PCR检测信息的文件；
根据所述包含PCR检测信息的文件，确定所述PCR检测信息。


3.根据权利要求1所述方法，其特征在于，所述操作信息包括反应孔的位置信息和荧光通道的信息，所述基于所述PCR检测信息中操作信息，以及操作信息与基因型别之间的关系，确定所述检测项目对应的检测基因的型别信息，包括：
基于所述PCR检测的信息中反应孔的位置信息和荧光通道的信息，以及反应孔的位置信息、荧光通道的信息和基因型别之间的关系，确定每个所述反应孔中所述荧光通道对应的检测基因的型别。


4.根据权利要求3所述方法，其特征在于，所述方法还包括：
根据每个所述反应孔中所述荧光通道对应的反应结果，确定所述检测基因中的每种病毒基因型别对应的反应结果，以及所述检测基因中的所述内标基因对应的反应结果；
所述基于所述PCR检测信息中反应结果，以及反应结果与阴阳性检测结果之间的关系，确定所述检测基因的阴阳性检测信息，包括：
基于所述每种病毒基因型别对应的反应结果、所述内标基因对应的反应结果，以及反应结果与阴阳性检测结果之间的关系，确定所述每种病毒基因型别的阴阳性检测信息以及所述内标基因的阴阳性检测信息。


5.根据权利要求1所述方法，其特征在于，在所述确定所述检测基因的阴阳性检测信息之后，所述方法还包括：
根据所述检测基因的阴阳性检测信息，确定所述阴阳性检测...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘让蛟，戴立忠，周玮欢，郭鑫武，邓中平，李勃，
申请(专利权)人：圣湘生物科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：湖南;43