【技术实现步骤摘要】
一种利用拉曼光谱快速鉴别细菌和真菌的方法
本专利技术属于微生物鉴定
,尤其是涉及一种利用拉曼光谱快速鉴别细菌和真菌的方法。
技术介绍
细菌和真菌的鉴别具有非常重要的临床意义,感染早期对细菌和真菌感染作出鉴别可以帮助临床医生制定针对性治疗方案,为临床选择有效抗菌药物提供参考,以减少广谱抗菌药物的不恰当使用,同时降低患者的经济负担。常用的细菌和真菌鉴别方法主要有染色法、生化法和免疫学、分子生物学检测法。临床用于细菌和真菌判别的染色法主要是革兰染色法,染色后真菌为革兰氏阳性,呈现深紫色,大小约10~100μm;革兰氏阳性细菌和革兰氏阴性细菌分别呈现深紫色和红色,大小约1-10μm,通过镜下观察菌体形态大小可初步鉴别细菌和真菌,但这种方法不适用于体积比较小的真菌鉴别,且依靠人工判读,容易出现错误。生化法是临床细菌和真菌鉴定的“金标准”,该方法尽管较为准确,但耗时较长,难以满足临床需求。应用免疫学和分子生物学技术进行感染微生物检测为培养时间长、难培养或不能培养的微生物鉴定提供了一个重要手段,使感染的诊断早期、快速、准确。 ...
【技术保护点】
1.一种利用拉曼光谱快速鉴别细菌和真菌的方法,其特征在于,对待鉴别的样品进行前处理,对处理后的样品进行拉曼图谱采集,对采集到的拉曼图谱进行去背景和归一化处理,利用处理后的图谱进行细菌真菌鉴别。/n
【技术特征摘要】
1.一种利用拉曼光谱快速鉴别细菌和真菌的方法,其特征在于,对待鉴别的样品进行前处理,对处理后的样品进行拉曼图谱采集,对采集到的拉曼图谱进行去背景和归一化处理,利用处理后的图谱进行细菌真菌鉴别。
2.根据权利要求1所述利用拉曼光谱快速鉴别细菌和真菌的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)样品前处理
对待鉴别的样品,采用离心方法去除培养液和血液,然后加入无菌水洗涤,离心去除上清后将菌液重悬,重悬液滴加到低拉曼背景载玻片上,室温风干后进行拉曼检测;
(2)拉曼图谱采集
使用共聚焦显微拉曼光谱仪,采集菌体单细胞拉曼图谱;
(3)拉曼图谱预处理
对采集到的拉曼图谱进行去背景和归一化处理,处理后的图谱用于后续数据分析;
(4)细菌真菌鉴别
选择两种方法中的一种或两种方法结合使用进行细菌和真菌的判别:一种是通过比较细菌和真菌的指纹区特异峰位判别细菌真菌;另一种是通过机器学习算法对已知分类的拉曼图谱数据进行训练,建立细菌真菌鉴定数据库,将新的数据代入库中进行测试鉴定。
3.根据权利要求2所述利用拉曼光谱快速鉴别细菌和真菌的方法,其特征在于,步骤(1)中,低拉曼背景载玻片包括单晶CaF2载玻片、BaF2载玻片或镀铝玻璃载玻片。
4.根据权利要求2所述利用拉曼光谱快速鉴别细菌和真菌的方法,其特征在于,步骤(1)中,低拉曼背景载玻片购于上海氘峰医疗器械有限公司,CatNo1001。
5.根据权利要求2所述利用拉曼光谱快速鉴别细菌和真菌的方法,其特征在于,步骤(2)中,使用共聚焦拉曼显微镜测试前进行硅片校准,使硅的拉曼谱峰位移在520.73cm,在显微镜视野中找到菌体。
6.根据权利要求2所述利用拉曼光谱快速鉴别细菌和真菌的方法,其特征在于,步骤(2)中,拉曼图谱采...
【专利技术属性】
技术研发人员:徐晓刚,王明贵,衣晓飞,
申请(专利权)人:复旦大学附属华山医院,
类型:发明
国别省市:上海;31
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