本发明专利技术公开了检测及靶向CTD‑3060P21.1的试剂及其应用。本发明专利技术公开了CTD‑3060P21.1在肺腺癌中差异表达，且该基因作为检测变量在肺腺癌中具有较高的特异性和敏感性。本发明专利技术同时公开了CTD‑3060P21.1的表达的改变影响肺腺癌细胞的增殖和迁移，说明CTD‑3060P21.1可作为分子靶标应用于肺腺癌的治疗。
【技术实现步骤摘要】
检测及靶向CTD-3060P21.1的试剂及其应用
本专利技术属于生物医药领域，涉及检测及靶向CTD-3060P21.1的试剂及其应用。
技术介绍
近年来，肺癌的发病率和病死率均呈上升趋势，严重危害人类的生命和健康。据统计，肺癌患者5年生存率仅18.1％，其中肿瘤的复发和转移是影响患者生存期的主要原因。根据组织病理学分型，肺癌可分为非小细胞肺癌和小细胞肺癌，其中以非小细胞肺癌最常见，非小细胞肺癌可分为鳞癌、腺癌、大细胞癌、腺鳞癌、类癌等，又以肺鳞癌最为常见。肺癌的发生进展是一个缓慢复杂的过程，肺癌形成一般要经过局部浸润、循环扩散、远处侵袭、新生血管形成等步骤，其中肿瘤细胞进入外周血是肿瘤发生远处转移和复发的关键一步。尽管随着医疗科技的发展，肺癌患者的诊断、治疗、护理均得到很大提高，但是这几十年来肺癌死亡率依然居高不下，肺癌患者总体生存预后依然不佳。这其中导致肺癌患者预后不佳的主要原因是当患者就诊时疾病已经处于晚期或者已经发生转移，即肺癌患者已经失去了最佳治疗时机。但是，对原位癌或者早期肺癌的患者治疗后随访发现生存期和预后都得到很大改善，甚至不少患者达到了治愈。研究表明:如果早期发现肿瘤形成，许多肿瘤都是可以治疗甚至治愈的。因此，肺癌防治的关键是在早期筛查，早期诊断，只有这样才能早期治疗提高患者的治愈率。早期治疗不仅可以节约医疗费用，减少病人创伤，减轻病人痛苦，而且可以延长病人寿命，提高生活质量。目前肺癌的治疗方法包括手术、放疗、化疗、生物靶向治疗等，但是这些方法目前仍难以提高肺癌患者的治愈率。许多患者由于肿瘤转移或复发从而错过了最好的治疗时机，因此，如何提高肺癌患者的早期诊断率，如何提高肺癌早期诊断方法一直以来是医学领域中科研人员不断努力的方向。近年来，表观遗传分子的调控在肺腺癌的发生发展中的作用越来越引起重视，表观遗传学是在非基因序列改变的基础上研究基因表达的改变。研究发现，肺腺癌发生发展过程中，存在表观遗传学关键基因/蛋白的改变，进而影响相关通路，最终对细胞的增殖、凋亡和周期产生不同程度的影响。表观遗传调控领域研究包括DNA甲基化、微小RNA(microRNA，miRNA)、长链非编码RNA(longnon-codingRNA,1ncRNA)、环状RNA(circleRNA，circRNA)等。基于以上认识，综合国内外最新肺腺癌标志研究进展及前期研究基础，本申请以lncRNA切入点，以研究肺腺癌诊断和治疗相关的lncRNA，并探索lncRNA在肺腺癌发病机制中的可能作用。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术的目的在于提供一种与肺腺癌相关的lncRNA生物标志物，通过检测该生物标志物的水平可以判断受试者是否患有肺腺癌，从而为肺腺癌的早期诊断和治疗提供一种新手段。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术的第一方面提供了一种检测试剂，所述试剂为检测CTD-3060P21.1水平的试剂。进一步，所述试剂选自特异性针对CTD-3060P21.1的探针或引物。进一步，所述特异性扩增CTD-3060P21.1的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。本专利技术的第二方面提供了一种产品，所述产品包括本专利技术第一方面所述的试剂。进一步，所述产品包括试剂盒、芯片、核酸膜条。本专利技术的第三方面提供了一种组合物，所述组合物包括有效量的CTD-3060P21.1的抑制剂。所述抑制剂选自核酸分子、碳水化合物、小分子化合物或干扰慢病毒。进一步，所述核酸分子选自：反义寡核苷酸、双链RNA、小干扰RNA或短发夹RNA。进一步，所述抑制剂为核酸分子。进一步，所述核酸分子为siRNA。进一步，所述siRNA的序列如SEQIDNO.5～6所示。本专利技术的第四方面提供了一种预测肺腺癌的计算模型，所述计算模型包括CTD-3060P21.1的计算分析模块，计算分析模块处理检测的CTD-3060P21.1的数据，并与设定诊断值进行比较。本专利技术的第五方面提供了一种筛选治疗肺腺癌的候选药物的方法，所述方法包括：用待筛选物质处理表达或含有CTD-3060P21.1基因的体系；和检测所述体系中CTD-3060P21.1基因的表达；其中，若所述待筛选的物质可以抑制CTD-3060P21.1基因的水平，则表明该待筛选物质是治疗肺腺癌的候选药物。进一步，所述体系选自：细胞体系、亚细胞体系、溶液体系、组织体系、器官体系或动物体系。所述候选物质包括(但不限于)：针对CTD-3060P21.1基因或其上游或下游基因设计的干扰分子、核酸抑制物、小分子化合物等。本专利技术的第六方面提供了如下任一项应用：a.本专利技术第一方面所述的试剂在制备诊断肺腺癌的工具中的应用；b.本专利技术第二方面所述的产品在制备诊断肺腺癌的工具中的应用；c.CTD-3060P21.1在构建诊断肺腺癌的计算模型中的应用；d.CTD-3060P21.1在制备治疗肺腺癌的药物中的应用；e.CTD-3060P21.1在筛选治疗肺腺癌的候选药物中的应用；f.本专利技术第三方面所述的组合物在制备治疗肺腺癌的药物中的应用。附图说明图1是利用QPCR检测CTD-3060P21.1基因在肺腺癌组织中的表达情况图。具体的实施方式本专利技术通过检测肺腺癌样本中lncRNA在肿瘤组织和癌旁组织中的表达，发现其中具有明显表达差异的lncRNA，探讨其与肺腺癌的发生发展之间的关系，从而为肺腺癌的诊断及靶向治疗寻找更好的途径和方法。本专利技术首次发现了肺腺癌中CTD-3060P21.1显著性上调，并通过实验证明了CTD-3060P21.1与肺腺癌的发生发展相关，为肺腺癌的早期诊断及治疗提供了新的肿瘤标志物和治疗靶点。CTD-3060P21.1转录CTD-3060P21.1的基因是位于人17号染色体上，本专利技术中的CTD-3060P21.1包括野生型、突变型或其片段。本领域技术人员知道，在进行测序分析时，会将原始测序结果比对到人的参考基因组上，因此筛选结果中的CTD-3060P21.1可能会包含不同的转录本，只要可以比对到参考基因组上的CTD-3060P21.1即可。一种代表性的CTD-3060P21.1的序列如ENST00000574885.1所示。本专利技术技术人员应当理解，可以利用本领域内已知的任何方法来测定基因的表达水平，包括但不限于核酸测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术，测定基因表达的手段不是本专利技术的重要方面。许多表达检测方法使用分离的RNA。起始材料典型地是从生物样品，例如分别从肿瘤或肿瘤细胞系，以及相应的正常组织或细胞系分离的总RNA。如果RNA的来源是原发性肿瘤，则可以从冷冻的或保存的石蜡包埋并固定的(例如福尔马林固定的)组织样品(例如病理学家指导的组织核心样品)中提取RNA(例如mRNA)。RNA提取的一般方法是本领域熟知的。特别地，可以使用来自商业制造商，例如Qiagen(V本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种检测试剂，其特征在于，所述试剂为检测样本中CTD-3060P21.1水平的试剂。/n
【技术特征摘要】
1.一种检测试剂，其特征在于，所述试剂为检测样本中CTD-3060P21.1水平的试剂。
2.根据权利要求1所述的试剂，其特征在于，所述试剂选自特异性针对CTD-3060P21.1的探针或引物。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述特异性扩增CTD-3060P21.1的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。
4.一种产品，其特征在于，所述产品包括权利要求1-3任一项所述的试剂。
5.根据权利要求4所述的产品，其特征在于，所述产品包括试剂盒、芯片、核酸膜条。
6.一种组合物，其特征在于，所述组合物包括有效量的CTD-3060P21.1的抑制剂。
7.根据权利要求6所述的组合物，其特征在于，所述抑制剂为核酸分子，优选的，所述核酸分子为siRNA，优选的，所述siRNA的序列如SEQIDNO.5～6所示。
8.一种预测肺腺癌的计算模型，其特征在于，所述计...
【专利技术属性】
技术研发人员：徐红玉，杜泽东，刘贤国，廖洪飞，蒙荣钦，虞晓林，曹鹏，石雨卉，余研忻，
申请(专利权)人：三六三医院，
类型：发明
国别省市：四川;51
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