本发明专利技术涉及对TBRFV具有抗性的番茄()植物，所述植物在11号染色体上在SEQ ID No.1与53之间包含QTL。11号染色体上所述QTL的存在通过使用选自包括SEQ ID No.4至52的组的至少一个标记来鉴定。该QTL是如同包含在其代表性种子以保藏号NCIMB 42882、NCIMB 42885、NCIMB 42887或NCIMB 42890保藏于NCIMB的番茄植物的基因组中一样。
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】TBRFV抗性番茄植物本专利技术涉及对番茄褐皱果病毒(Tomatobrownrugosefruitvirus，TBRFV)有抗性的番茄(Solanumlycopersicum)植物。本专利技术还涉及产生这种番茄植物的方法以及鉴定和选择这种植物的方法。本专利技术还涉及所述番茄褐皱果病毒抗性番茄植物的后代、种子和果实，适于产生所述番茄植物的繁殖材料，以及包含这种番茄果实或其部分的食品。本专利技术还涉及由番茄褐皱果病毒抗性番茄产生的或可再生成番茄褐皱果病毒抗性番茄植物的细胞或组织培养物。本专利技术还涉及用于鉴定番茄褐皱果病毒抗性番茄植物的标志物以及所述标志物的用途。种植番茄作物时遇到的问题之一是各种病毒的出现。已经鉴定了抗许多已知病毒的抗性，所述抗性通过育种引入到合适的番茄品种中。这使得种植者即使在生产过程中存在某种病毒时也能获得良好的产量。然而，新的病毒或已知病毒的新毒株经常被鉴定出来，在某些情况下其会破坏可供利用的抗性。2015年，新的烟草花叶病毒在番茄中的出现被发表(Salem等:AnewtobamovirusinfectingtomatocropsinJordan.ArchVirol.2016Feb；161(2):503-6.Epub2015Nov19)。该病毒显示与已知的烟草花叶病毒(Tobaccomosaicvirus，TMV)、番茄花叶病毒(Tomatomosaicvirus，ToMV)和番茄轻度斑驳病毒(Tomatomildmottlevirus，ToMMV)相关，与ToMMV和ToMV的最密切相关序列具有约80％至90％的序列同一性。植物的症状相当轻微，但几乎所有的果实上都存在非常严重的褐色皱纹症状。观察到该病毒破坏了常用的抗ToMV抗性基因的抗性:Tm-1、Tm-2和Tm-22，也称为Tm-2a。后来的公开文献显示，在以色列也发现了所述病毒，并确定该病毒也能感染椒类(辣椒(Capsicumannuum))植物(Luria等(2017):AnewIsraelitobamovirusisolateinfectstomatoplantsharboringTm-22resistancegenes.PLoSONE12(1):e0170429.Doi:10.1371/journal.pone.0170429)。症状似乎因受影响的品种而异，在某些情况下，症状主要以严重或轻微的花叶、坏死、叶片扭曲或其他症状的形式出现在营养部位。由于该病毒明显不同于已知的番茄病毒，因此用新的名称对其进行了描述:番茄褐皱果病毒(Tomatobrownrugosefruitvirus，TBRFV)。由于果实上症状的严重程度，TBRFV的存在对番茄种植者的影响非常大，因为其使水果基本上无法销售。到目前为止，还没有发现抗该病毒的抗性。该病毒至少可以通过机械方式传播，这使得传播很容易和迅速，并且难以控制。病毒的传播也可能通过受感染的种子发生。本专利技术的一个目的是提供抗番茄褐皱果病毒(TBRFV)的番茄种的番茄植物。由于与这种新的TBRFV传播很快并对某些地区的番茄生产造成了重大影响的问题，因此获得抗性番茄植物的紧迫性非常高。另外，由于其非常有效的传播，预期该病毒能够迅速传播到其他地区。因此，组织了大规模的种质筛选，以便深入了解可能来源的存在。番茄具有多种野生近缘种，其具有抗病性，是有价值的育种资源。因此，许多最新的番茄品种已经拥有一个或多个来自野生种的基因渗入。然而，目前栽培的番茄品种，包括已从野生近缘种中获得烟草花叶病毒抗性基因的品种，似乎很容易被这种新病毒感染。这可能意味着鉴定抗性并不简单。令人惊讶的是，在广泛筛选后，可以鉴定出对TBRFV具有高度抗性的醋栗番茄(Solanumpimpinellifolium)种中的3份种质(实施例1)。随后建立了研究项目，以确定该抗性是否可以转移到番茄上，并确定该抗性背后的遗传学。一方面，在三个醋栗番茄来源GNL.3919、GNL.3920和GNL.3951与内部育种系之间进行杂交，接着进行种群开发，诸如F2、F3和回交群体，以用于QTL作图。对所有世代进行生物测定，以确认和监测各种群体中的抗性，并确定遗传性。通过分子标记对QTL的鉴定和表征使人们有机会使用遗传连锁标记鉴定QTL的存在，从而鉴定抗性的存在，这显然比使用生物测定更加高效得多。为此，进行了QTL定位研究。针对F2群体的第一QTL定位鉴定了11号染色体上的QTL区域，该区域存在于基于所有三个番茄来源开发的群体中。本专利技术提供了对番茄褐皱果病毒(TBRFV)具有抗性的番茄植物，该植物在11号染色体上包含QTL。11号染色体上的该QTL特别地是来源于醋栗番茄种的QTL或由醋栗番茄渐渗的QTL。11号染色体上的QTL位于SEQIDNo.1与SEQIDNo.53之间。在本专利技术的QTL的侧翼按递增的优先顺序为SEQIDNo.4和SEQIDNo.52、SEQIDNo.5和SEQIDNo.52、SEQIDNo.5和SEQIDNo.51、SEQIDNo.4和SEQIDNo.33、SEQIDNo.5和SEQIDNo.11或SEQIDNo.6和SEQIDNo.11、或SEQIDNo.7和SEQIDNo.11。11号染色体上的本专利技术的QTL的侧翼最优选为SEQIDNo.8和SEQIDNo.10。如本文中所用，侧翼意指序列代表QTL区域的边界，因此是QTL的一部分。用于鉴定本专利技术的QTL在11号染色体上的存在的标记以递增的优先顺序选自包括SEQIDNo.4至52的组、或者选自包括SEQIDNo.5至52的组、或者选自包括SEQIDNo.5至51的组、或者选自包括SEQIDNo.4至33的组、或者选自包括SEQIDNo.5至11的组、或者选自包括SEQIDNo.6至11的组、或者选自包括SEQIDNo.7至11的组。用于鉴定本专利技术的QTL的标记最优选选自包括SEQIDNo.8至10的组。如本文中所用，用于鉴定所述QTL的标记是由图1中存在于所述QTL中的序列表示的标记。用于鉴定本专利技术的QTL的存在的另外的标记可基于本专利技术的抗性植物与易感对照植物之间的任何其它多态性，其中多态性以递增的优先顺序位于SEQIDNo.4与SEQIDNo.52之间，或SEQIDNo.5与SEQIDNo.52之间，或SEQIDNo.5与SEQIDNo.51之间，或SEQIDNo.4与SEQIDNo.33之间，或SEQIDNo.5与SEQIDNo.11之间，或SEQIDNo.6与SEQIDNo.11之间。用于鉴定本专利技术QTL存在的另外的标记最优选基于本专利技术的抗性植物与易感植物之间的任何其它多态性，其中所述多态性位于SEQIDNo.7与SEQIDNo.11之间(实施例2)。图1给出了SEQIDNo的序列，所述序列可用作标记或用于开发标记，以鉴定本专利技术的QTL在11号染色体上的存在，导致番茄植物的TBRFV抗性。表3显示了标记分数，即序列中鉴定QTL的存在、并因此鉴定抗性植物的核苷酸，以及图1序列中SNP的位置。当标记的序列位于例如可公共获得的番茄的基因组参考序列的SL3_00版本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种具有对TBRFV的抗性的番茄(Solanum lycopersicum)植物，所述植物在11号染色体上包含QTL，其中11号染色体上的所述QTL位于SEQ ID No.1与SEQ ID No.53之间。/n
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20171208 EP PCT/EP2017/0820961.一种具有对TBRFV的抗性的番茄(Solanumlycopersicum)植物，所述植物在11号染色体上包含QTL，其中11号染色体上的所述QTL位于SEQIDNo.1与SEQIDNo.53之间。
2.如权利要求1所述的番茄植物，其中通过使用选自包括SEQIDNo.4至52的组的至少一种标记来鉴定11号染色体上所述QTL的存在。
3.如权利要求1或2所述的番茄植物，其中在其代表性种子以保藏号NCIMB42882、NCIMB42885、NCIMB42887或NCIMB42890保藏在NCIMB的番茄植物的基因组中，所述QTL的侧翼为SEQIDNo.4和SEQIDNo.52。
4.如权利要求1-3中任一项所述的TBRFV抗性番茄植物的细胞，所述细胞在其基因组中的11号染色体上包含如权利要求1-3中任一项所定义的QTL。
5.一种番茄种子，其中由所述种子生长而来的植物由于在其基因组中存在如权利要求1-3中任一项所定义的11号染色体上的QTL而对TBRFV具有抗性。
6.一种适于产生如权利要求1-3中任一项所述的番茄植物的繁殖材料，其中所述繁殖材料适于有性繁殖，并且特别地选自小孢子、花粉、子房、胚珠、胚囊和卵细胞；或者适于营养繁殖，并且特别地选自插条、根、茎、细胞和原生质体；或者适于可再生细胞的组织培养，并且特别地选自叶、花粉、胚、子叶、下胚轴、分生组织细胞、根、根尖、花药、花、种子和茎；其中由所述繁殖材料产生的所述植物在11号染色体上包含如权利要求1-3中任一项所定义的导致TBRFV抗性的QTL。
7.一种用于鉴定番茄植物中的TBRFV抗性的标记，所述标记选自包括SEQIDNo.4至52的组。
8.一种用于在番茄植物中鉴定导致TBRFV抗性的11号染色体上的QTL的标记，所述标记选自包括SEQIDNo4至52的组。
9.如权利要求7或8所述的标记用于鉴定番茄植物中的...
【专利技术属性】
技术研发人员：R·哈梅林克，J·卡利斯瓦尔特，H·拉希迪，
申请(专利权)人：瑞克斯旺种苗集团公司，
类型：发明
国别省市：荷兰;NL
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