一种鉴定黄瓜种质真实性的SNP位点引物组合及应用制造技术

技术编号:24882377 阅读:24 留言:0更新日期:2020-07-14 18:09
本发明专利技术属于分子标记及其检测领域,具体涉及一种鉴定黄瓜种质真实性的核心SNP位点、引物组合,基于SNP位点的DNA指纹数据库、数据库构建方法,以及基于SNP位点的黄瓜种质真实性的鉴定方法、应用。所述SNP位点选自第一SNP位点到第四十八SNP位点中的任1到48种。本发明专利技术建立了基于高通量测序鉴定黄瓜种质真实性的DNA指纹数据库,可用于对黄瓜种质在种子、幼苗、叶片等组织或器官进行早期鉴定,为黄瓜种质资源保护提供技术支持。本发明专利技术提供的方法既可以对未知黄瓜种质进行鉴定,也可以对已知黄瓜种质的真实性进行鉴定。本发明专利技术提供的方法具有高通量、准确、低成本、操作简单、节约人力、物力等优点,具有十分广阔的应用前景。

【技术实现步骤摘要】
一种鉴定黄瓜种质真实性的SNP位点引物组合及应用
本专利技术属于分子标记及其检测领域,具体涉及一种鉴定黄瓜种质真实性的核心SNP位点、引物组合,基于SNP位点的DNA指纹数据库、数据库构建方法,以及基于SNP位点的黄瓜种质真实性的鉴定方法、应用。
技术介绍
种质资源是种业的基础。《种子法》第九十二条指出,种质资源是指选育植物新品种的基础材料,包括各种植物的栽培种、野生种的繁殖材料以及利用上述繁殖材料人工创造的各种植物的遗传材料。种质资源由自然演化和人工创造而形成的一种重要的自然资源,积累了极其丰富的遗传变异,是人类用于选育新品种和发展农业生产的物质基础。种质资源的发现和利用决定了现代作物育种工作能否取得突破性进展的关键。所以,在鉴定真伪、优化来源方面,和具体的品种相比,种质资源的鉴定和保护工作更加重要。然而,目前绝大部分种质资源的鉴定和保护工作却处于空白状态。黄瓜由于其独特的风味,成为了中国消费者喜爱的蔬菜作物之一。2018年,FAOSTAT公布了其在中国的产量5629.4吨(http://www.fao.org/faostat/zh/#data/QC),占世界黄瓜总产量的70%。目前,市场上黄瓜品种丰富,但多为杂交种。农业部公布的黄瓜登记品种达上千份,其中杂交品种超过95%。黄瓜种质资源是培育黄瓜杂交种的遗传材料,其遗传特性直接决定了杂交品种的产量和品质,然而黄瓜种质资源保护方面研究还没有报道。众所周知,一个具有优异性状的黄瓜种质,需要经过育种家数年的培育,而不法分子的盗用,严重侵犯了育种家的种质知识产权,影响了育种家的积极性,阻碍了黄瓜种业的良性发展。目前,分子标记检测的方法已经应用到黄瓜品种鉴定上,但黄瓜种质资源(育种亲本)的鉴定和保护工作的研究却甚少涉及,造成了黄瓜种质的盗用现象严重,产生了很多近似种质,阻碍了黄瓜种质知识产权的保护。同时,利用近似黄瓜种质培育的黄瓜品种,也给黄瓜品种的登记和审定带来了一定难度,影响了黄瓜品种的监管。因此急需开发一套适用于鉴定黄瓜种质的DNA快速检测技术。黄瓜种质分为4大类,包括印度型、西双版纳型、欧洲型和东亚型。其中,印度型是黄瓜野生种质;西双版纳型是我国西双版纳地区种植的主要类型的黄瓜;欧洲型和东亚型是我国培育黄瓜品种的主要的种质。目前,我国科研机构收集的世界范围内的黄瓜种质三千余份,但是,科研中还未报导利用SNP位点来鉴定黄瓜的种质,故现在需要构建出基于核心SNP位点的黄瓜DNA指纹数据库,也需要一种基于核心SNP位点来鉴定黄瓜种质的方法和应用。
技术实现思路
本专利技术提供了一种鉴定黄瓜种质的核心SNP位点、引物组合,以及基于SNP位点的DNA指纹数据库、数据库构建方法,基于SNP位点的黄瓜种质的鉴定方法、应用。本专利技术是通过以下的技术方案实现的:鉴定黄瓜种质真实性的核心SNP位点,所述SNP位点选自如下第一SNP位点到第四十八SNP位点中的任1到48种:第一SNP位点,所述第一SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第215528位,该位点的核苷酸碱基为G或A;第二SNP位点,所述第二SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第6591765位,该位点的核苷酸碱基为或A或T;第三SNP位点,所述第三SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第18360230位,该位点的核苷酸碱基为G或C;第四SNP位点,所述第四SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第19328118位,该位点的核苷酸碱基为T或C;第五SNP位点,所述第五SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第21471767位,该位点的核苷酸碱基为G或C;第六SNP位点,所述第六SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第26006098位,该位点的核苷酸碱基为A或G;第七SNP位点,所述第七SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第430448位,该位点的核苷酸碱基为C或T;第八SNP位点,所述第八SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第6544548位,该位点的核苷酸碱基为A或T;第九SNP位点,所述第九SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第7082492位,该位点的核苷酸碱基为A或T;第十SNP位点,所述第十SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第13016733位,该位点的核苷酸碱基为C或T;第十一SNP位点,所述第十一SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第19736406位,该位点的核苷酸碱基为C或T;第十二SNP位点,所述第十二SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第22890765位,该位点的核苷酸碱基为C或T;第十三SNP位点,所述第十三SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第3674759位,该位点的核苷酸碱基为G或A;第十四SNP位点,所述第十四SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第6715343位,该位点的核苷酸碱基为T或C;第十五SNP位点,所述第十五SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第8251132位,该位点的核苷酸碱基为G或A;第十六SNP位点,所述第十六SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第17274568位,该位点的核苷酸碱基为G或A;第十七SNP位点,所述第十七SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第28481554位,该位点的核苷酸碱基为C或T;第十八SNP位点,所述第十八SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第30072485位,该位点的核苷酸碱基为A或G;第十九SNP位点,所述第十九SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第31558451位,该位点的核苷酸碱基为A或G;第二十SNP位点,所述第二十SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第1284842位,该位点的核苷酸碱基为G或T;第二十一SNP位点,所述第二十一SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第14339957位,该位点的核苷酸碱基为A或G;第二十二SNP位点,所述二十二第SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第16172836位,该位点的核苷酸碱基为A或G;第二十三SNP位点,所述第二十三SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第20428654位,该位点的核苷酸碱基为G或A;第二十四SNP位点,所述第二十四SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第22774845位,该位点的核苷酸碱基为G或A;第二十五SNP位点,所述第二十五SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第1045863位,该位点的核苷酸碱基为T或G;第二十六SNP位点,所述第二十六SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第4850607位,该位点的核苷酸碱基为G或A;第二十七SNP位点,所述第二十七SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第5787330位,该位点的核苷酸碱基为T或A;第二十八SNP位点,所述第二十八SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第11869197位,该位点的核苷酸碱基为G或C;第二十九SNP位点,所述第二十九SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第15556517位,该位点的核苷酸碱基为T或G;第三十SNP位点,所述第三十SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第23713010位,该位点的核苷酸碱基为T或C;第三十一SNP位点,所本文档来自技高网
...

【技术保护点】
1.鉴定黄瓜种质真实性的核心SNP位点,所述SNP位点选自如下第一SNP位点到第四十八SNP位点中的任1到48种:/n第一SNP位点,所述第一SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第215528位,该位点的核苷酸碱基为G或A;/n第二SNP位点,所述第二SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第6591765位,该位点的核苷酸碱基为或A或T;/n第三SNP位点,所述第三SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第18360230位,该位点的核苷酸碱基为G或C;/n第四SNP位点,所述第四SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第19328118位,该位点的核苷酸碱基为T或C;/n第五SNP位点,所述第五SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第21471767位,该位点的核苷酸碱基为G或C;/n第六SNP位点,所述第六SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第26006098位,该位点的核苷酸碱基为A或G;/n第七SNP位点,所述第七SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第430448位,该位点的核苷酸碱基为C或T;/n第八SNP位点,所述第八SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第6544548位,该位点的核苷酸碱基为A或T;/n第九SNP位点,所述第九SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第7082492位,该位点的核苷酸碱基为A或T;/n第十SNP位点,所述第十SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第13016733位,该位点的核苷酸碱基为C或T;/n第十一SNP位点,所述第十一SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第19736406位,该位点的核苷酸碱基为C或T;/n第十二SNP位点,所述第十二SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第22890765位,该位点的核苷酸碱基为C或T;/n第十三SNP位点,所述第十三SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第3674759位,该位点的核苷酸碱基为G或A;/n第十四SNP位点,所述第十四SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第6715343位,该位点的核苷酸碱基为T或C;/n第十五SNP位点,所述第十五SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第8251132位,该位点的核苷酸碱基为G或A;/n第十六SNP位点,所述第十六SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第17274568位,该位点的核苷酸碱基为G或A;/n第十七SNP位点,所述第十七SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第28481554位,该位点的核苷酸碱基为C或T;/n第十八SNP位点,所述第十八SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第30072485位,该位点的核苷酸碱基为A或G;/n第十九SNP位点,所述第十九SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第31558451位,该位点的核苷酸碱基为A或G;/n第二十SNP位点,所述第二十SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第1284842位,该位点的核苷酸碱基为G或T;/n第二十一SNP位点,所述第二十一SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第14339957位,该位点的核苷酸碱基为A或G;/n第二十二SNP位点,所述二十二第SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第16172836位,该位点的核苷酸碱基为A或G;/n第二十三SNP位点,所述第二十三SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第20428654位,该位点的核苷酸碱基为G或A;/n第二十四SNP位点,所述第二十四SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第22774845位,该位点的核苷酸碱基为G或A;/n第二十五SNP位点,所述第二十五SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第1045863位,该位点的核苷酸碱基为T或G;/n第二十六SNP位点,所述第二十六SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第4850607位,该位点的核苷酸碱基为G或A;/n第二十七SNP位点,所述第二十七SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第5787330位,该位点的核苷酸碱基为T或A;/n第二十八SNP位点,所述第二十八SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第11869197位,该位点的核苷酸碱基为G或C;/n第二十九SNP位点,所述第二十九SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第15556517位,该位点的核苷酸碱基为T或G;/n第三十SNP位点,所述第三十SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第23713010位,该位点的核苷酸碱基为T或C;/n第三十一SNP位点,所述第三十一SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第24681408位,该位点的核苷酸碱基为C或A;/n第三十二SNP位点,所述第三十二SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第437035位,该位点的核苷酸碱基为G或C;/n第三十三SNP位点,所述第三十三SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色...

【技术特征摘要】
1.鉴定黄瓜种质真实性的核心SNP位点,所述SNP位点选自如下第一SNP位点到第四十八SNP位点中的任1到48种:
第一SNP位点,所述第一SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第215528位,该位点的核苷酸碱基为G或A;
第二SNP位点,所述第二SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第6591765位,该位点的核苷酸碱基为或A或T;
第三SNP位点,所述第三SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第18360230位,该位点的核苷酸碱基为G或C;
第四SNP位点,所述第四SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第19328118位,该位点的核苷酸碱基为T或C;
第五SNP位点,所述第五SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第21471767位,该位点的核苷酸碱基为G或C;
第六SNP位点,所述第六SNP位点位于黄瓜参考基因组第1染色体第26006098位,该位点的核苷酸碱基为A或G;
第七SNP位点,所述第七SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第430448位,该位点的核苷酸碱基为C或T;
第八SNP位点,所述第八SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第6544548位,该位点的核苷酸碱基为A或T;
第九SNP位点,所述第九SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第7082492位,该位点的核苷酸碱基为A或T;
第十SNP位点,所述第十SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第13016733位,该位点的核苷酸碱基为C或T;
第十一SNP位点,所述第十一SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第19736406位,该位点的核苷酸碱基为C或T;
第十二SNP位点,所述第十二SNP位点位于黄瓜参考基因组第2染色体第22890765位,该位点的核苷酸碱基为C或T;
第十三SNP位点,所述第十三SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第3674759位,该位点的核苷酸碱基为G或A;
第十四SNP位点,所述第十四SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第6715343位,该位点的核苷酸碱基为T或C;
第十五SNP位点,所述第十五SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第8251132位,该位点的核苷酸碱基为G或A;
第十六SNP位点,所述第十六SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第17274568位,该位点的核苷酸碱基为G或A;
第十七SNP位点,所述第十七SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第28481554位,该位点的核苷酸碱基为C或T;
第十八SNP位点,所述第十八SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第30072485位,该位点的核苷酸碱基为A或G;
第十九SNP位点,所述第十九SNP位点位于黄瓜参考基因组第3染色体第31558451位,该位点的核苷酸碱基为A或G;
第二十SNP位点,所述第二十SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第1284842位,该位点的核苷酸碱基为G或T;
第二十一SNP位点,所述第二十一SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第14339957位,该位点的核苷酸碱基为A或G;
第二十二SNP位点,所述二十二第SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第16172836位,该位点的核苷酸碱基为A或G;
第二十三SNP位点,所述第二十三SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第20428654位,该位点的核苷酸碱基为G或A;
第二十四SNP位点,所述第二十四SNP位点位于黄瓜参考基因组第4染色体第22774845位,该位点的核苷酸碱基为G或A;
第二十五SNP位点,所述第二十五SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第1045863位,该位点的核苷酸碱基为T或G;
第二十六SNP位点,所述第二十六SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第4850607位,该位点的核苷酸碱基为G或A;
第二十七SNP位点,所述第二十七SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第5787330位,该位点的核苷酸碱基为T或A;
第二十八SNP位点,所述第二十八SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第11869197位,该位点的核苷酸碱基为G或C;
第二十九SNP位点,所述第二十九SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第15556517位,该位点的核苷酸碱基为T或G;
第三十SNP位点,所述第三十SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第23713010位,该位点的核苷酸碱基为T或C;
第三十一SNP位点,所述第三十一SNP位点位于黄瓜参考基因组第5染色体第24681408位,该位点的核苷酸碱基为C或A;
第三十二SNP位点,所述第三十二SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第437035位,该位点的核苷酸碱基为G或C;
第三十三SNP位点,所述第三十三SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第6311543位,该位点的核苷酸碱基为T或G;
第三十四SNP位点,所述第三十四SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第7644442位,该位点的核苷酸碱基为T或C;
第三十五SNP位点,所述第三十五SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第8554160位,该位点的核苷酸碱基为C或T;
第三十六SNP位点,所述第三十六SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第9796426位,该位点的核苷酸碱基为G或A;
第三十七SNP位点,所述第三十七SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第11577012位,该位点的核苷酸碱基为T或G;
第三十八SNP位点,所述第三十八SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第13951516位,该位点的核苷酸碱基为T或A;
第三十九SNP位点,所述第三十九SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第18948506位,该位点的核苷酸碱基为G或A;
第四十SNP位点,所述第SNP位点位于黄瓜参考基因组第6染色体第24605064位,该位点的核苷酸碱基为A或T;
第四十一SNP位点,所述第四十一SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第4474790位,该位点的核苷酸碱基为C或T;
第四十二SNP位点,所述第四十二SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第6777921位,该位点的核苷酸碱基为C或A;
第四十三SNP位点,所述第四十四SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第7779724位,该位点的核苷酸碱基为G或A;
第四十四SNP位点,所述第四十四SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第9945305位,该位点的核苷酸碱基为T或C;
第四十五SNP位点,所述第四十五SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第10495910位,该位点的核苷酸碱基为A或G;
第四十六SNP位点,所述第四十六SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第11918569位,该位点的核苷酸碱基为C或T;
第四十七SNP位点,所述第四十七SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第12580918位,该位点的核苷酸碱基为G或A;
第四十八SNP位点,所述第四十八SNP位点位于黄瓜参考基因组第7染色体第14166928位,该位点的核苷酸碱基为A或G;
所述黄瓜参考基因组为ChineseLongV2。


2.如权利要求1所述的SNP位点,其特征在于:
所述第一SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:145所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:145的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第二SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:146所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:146的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第三SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:147所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:147的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第四SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:148所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:148的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第五SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:149所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:149的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第六SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:150所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:150的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第七SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:151所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:151的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第八SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:152所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:152的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第九SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:153所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:153的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第十SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:154所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:154的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第十一SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:155所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:155的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第十二SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:156所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:156的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第十三SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:157所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:157的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第十四SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:158所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:158的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第十五SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:159所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:159的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第十六SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:160所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:160的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第十七SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:161所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:161的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第十八SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:162所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:162的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第十九SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:163所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:163的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第二十SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:164所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:164的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第二十一SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:165所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:165的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第二十二SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:166所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:166的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第二十三SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:167所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:167的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第二十四SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:168所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:168的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第二十五SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:169所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:169的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第二十六SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:170所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:170的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第二十七SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:171所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:171的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第二十八SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:172所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:172的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第二十九SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:173所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:173的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第三十SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:174所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:174的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第三十一SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:175所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:175的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第三十二SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:176所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:176的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第三十三SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:177所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:177的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第三十四SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:178所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:178的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第三十五SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:179所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:179的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第三十六SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:180所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:180的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第三十七SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:181所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:181的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第三十八SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:182所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:182的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第三十九SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:183所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:183的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第四十SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:184所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:184的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第四十一SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:185所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:185的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第四十二SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:186所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:186的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第四十三SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:187所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:187的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第四十四SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:188所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:188的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第四十五SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:189所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:189的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第四十六SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:190所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:190的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第四十七SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:191所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:191的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%;
所述第四十八SNP位点及其上下游碱基的序列为序列表中的SEQIDNO:192所述序列的片段或其种质间同源基因组片段,更优选与序列表中的SEQIDNO:192的核苷酸序列的同一性大于等于95%、96%、97%、98%或99%。


3.鉴定黄瓜种质真实性的核心SNP引物组,所述SNP引物组用于分别扩增如权利要求1所述的SNP位点,所述SNP引物组包括:
第一SNP引物组,用于扩增所述第一SNP位点;第二SNP引物组,用于扩增所述第二SNP位点;第三SNP引物组,用于扩增所述第三SNP位点;第四SNP引物组,用于扩增所述第四SNP位点;第五SNP引物组,用于扩增所述第五SNP位点;第六SNP引物组,用于扩增所述第六SNP位点;第七SNP引物组,用于扩增所述第七SNP位点;第八SNP引物组,用于扩增所述第八SNP位点;第九SNP引物组,用于扩增所述第九SNP位点;第十SNP引物组,用于扩增所述第十SNP位点;第十一SNP引物组,用于扩增所述第十一SNP位点;第十二SNP引物组,用于扩增所述第十二SNP位点;第十三SNP引物组,用于扩增所述第十三SNP位点;第十四SNP引物组,用于扩增所述第十四SNP位点;第十五SNP引物组,用于扩增所述第十五SNP位点;第十六SNP引物组,用于扩增所述第十六SNP位点;第十七SNP引物组,用于扩增所述第十七SNP位点;第十八SNP引物组,用于扩增所述第十八SNP位点;第十九SNP引物组,用于扩增所述第十九SNP位点;第二十SNP引物组,用于扩增所述第二十SNP位点;第二十一SNP引物组,用于扩增所述第二十一SNP位点;第二十二SNP引物组,...

【专利技术属性】
技术研发人员:温常龙杨静静张建罗江刘庞源毛爱军王航
申请(专利权)人:北京市农林科学院
类型:发明
国别省市:北京;11

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1